RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468031.1

NME4-210, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 2

Gene NME4, Length 1,861 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-210ENST00000468031 OFD1O75665 1012 aa21.52■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 DPCR1Q3MIW9 517 aa21.52■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa21.52■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 NOVP48745 357 aa21.51■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 NLRP5P59047 1200 aa21.51■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 CERS5Q8N5B7 392 aa21.51■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 CNNM3Q8NE01 707 aa21.51■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 PLIN4Q96Q06 1357 aa21.51■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 A0A087WWV3 80 aa21.5■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 FAM205CA6NFA0 338 aa21.5■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 STYK1Q6J9G0 422 aa21.5■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 AOPEPQ8N6M6 819 aa21.5■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 FERMT2Q96AC1 680 aa21.5■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 STX8Q9UNK0 236 aa21.5■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 GRIN1Q05586 938 aa21.49■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 LONRF3Q496Y0 759 aa21.49■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 HHIPL2Q6UWX4 724 aa21.49■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 OLFM4Q6UX06 510 aa21.49■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 STAG2Q8N3U4 1231 aa21.49■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 PIBF1Q8WXW3 757 aa21.49■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 TTC38Q5R3I4 469 aa21.49■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 PODNQ7Z5L7 613 aa21.49■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 SPC24Q8NBT2 197 aa21.49■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 ATP2B1P20020 1258 aa21.48■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 GALNT17Q6IS24 598 aa21.48■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 KANK3Q6NY19 840 aa21.48■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 MYO3BQ8WXR4 1341 aa21.48■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 IKBKBO14920 756 aa21.47■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 TOP1P11387 765 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 SMARCA1P28370 1054 aa21.47■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 GABPAQ06546 454 aa21.47■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 C2CD5Q86YS7 1000 aa21.47■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 CCDC148Q8NFR7 591 aa21.47■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 FBXW7Q969H0 707 aa21.47■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 SPZ1Q9BXG8 430 aa21.47■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 CSRNP2Q9H175 543 aa21.47■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 C10orf71Q711Q0 1435 aa21.47■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 SMTNL1A8MU46 457 aa21.47■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 H0YIN7 160 aa21.47■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 PNOCQ13519 176 aa21.47■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 DOK7Q18PE1 504 aa21.47■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 DAGLBQ8NCG7 672 aa21.47■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 PCDHA4Q9UN74 947 aa21.47■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 BIN1O00499 593 aa21.46■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 SPECC1Q5M775 1068 aa21.46■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 MSL1Q68DK7 614 aa21.46■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 BLIDQ8IZY5 108 aa21.46■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 KCNF1Q9H3M0 494 aa21.46■■□□□ 1.03
NME4-210ENST00000468031 G3V3G9 751 aa21.45■■□□□ 1.02
NME4-210ENST00000468031 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
NME4-210ENST00000468031 CYTH3O43739 400 aa21.45■■□□□ 1.02
NME4-210ENST00000468031 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
NME4-210ENST00000468031 TPM4P67936 248 aa21.45■■□□□ 1.02
NME4-210ENST00000468031 SLC35G1Q2M3R5 365 aa21.45■■□□□ 1.02
NME4-210ENST00000468031 DCAF8Q5TAQ9 597 aa21.45■■□□□ 1.02
NME4-210ENST00000468031 NT5DC1Q5TFE4 455 aa21.45■■□□□ 1.02
NME4-210ENST00000468031 DRC7Q8IY82 874 aa21.45■■□□□ 1.02
NME4-210ENST00000468031 TEKT1Q969V4 418 aa21.45■■□□□ 1.02
NME4-210ENST00000468031 MRIQ9BWK5 157 aa21.45■■□□□ 1.02
NME4-210ENST00000468031 CLIP2Q9UDT6 1046 aa21.45■■□□□ 1.02
NME4-210ENST00000468031 SWAP70Q9UH65 585 aa21.45■■□□□ 1.02
NME4-210ENST00000468031 F8W031 263 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
NME4-210ENST00000468031 POSTNQ15063 836 aa21.45■■□□□ 1.02
NME4-210ENST00000468031 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa21.45■■□□□ 1.02
NME4-210ENST00000468031 CEP95Q96GE4 821 aa21.45■■□□□ 1.02
NME4-210ENST00000468031 CCDC34Q96HJ3 373 aa21.45■■□□□ 1.02
NME4-210ENST00000468031 BARHL2Q9NY43 387 aa21.45■■□□□ 1.02
NME4-210ENST00000468031 M0R2N6 131 aa21.44■■□□□ 1.02
NME4-210ENST00000468031 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
NME4-210ENST00000468031 NCAPHQ15003 741 aa21.44■■□□□ 1.02
NME4-210ENST00000468031 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
NME4-210ENST00000468031 USP40Q9NVE5 1235 aa21.44■■□□□ 1.02
NME4-210ENST00000468031 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa21.44■■□□□ 1.02
NME4-210ENST00000468031 MYH8P13535 1937 aa21.43■■□□□ 1.02
NME4-210ENST00000468031 KLRF2D3W0D1 207 aa21.43■■□□□ 1.02
NME4-210ENST00000468031 WNT7AO00755 349 aa21.43■■□□□ 1.02
NME4-210ENST00000468031 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
NME4-210ENST00000468031 PICALMQ13492 652 aa21.43■■□□□ 1.02
NME4-210ENST00000468031 SLC15A2Q16348 729 aa21.43■■□□□ 1.02
NME4-210ENST00000468031 WWC2Q6AWC2 1192 aa21.43■■□□□ 1.02
NME4-210ENST00000468031 CCDC186Q7Z3E2 898 aa21.43■■□□□ 1.02
NME4-210ENST00000468031 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
NME4-210ENST00000468031 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.02
NME4-210ENST00000468031 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
NME4-210ENST00000468031 SERTAD1Q9UHV2 236 aa21.43■■□□□ 1.02
NME4-210ENST00000468031 PTGS1P23219 599 aa21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms