RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466657.1

SIKE1-205, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

TSL 3

Gene SIKE1, Length 415 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-205ENST00000466657 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
SIKE1-205ENST00000466657 SLC15A5A6NIM6 579 aa21.56■■□□□ 1.04
SIKE1-205ENST00000466657 SMIM22K7EJ46 135 aa21.56■■□□□ 1.04
SIKE1-205ENST00000466657 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SIKE1-205ENST00000466657 EVI5O60447 810 aa21.56■■□□□ 1.04
SIKE1-205ENST00000466657 HOXC6P09630 235 aa21.56■■□□□ 1.04
SIKE1-205ENST00000466657 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa21.56■■□□□ 1.04
SIKE1-205ENST00000466657 C16orf86Q6ZW13 317 aa21.56■■□□□ 1.04
SIKE1-205ENST00000466657 CCDC17Q96LX7 622 aa21.56■■□□□ 1.04
SIKE1-205ENST00000466657 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SIKE1-205ENST00000466657 ECHDC1Q9NTX5 307 aa21.56■■□□□ 1.04
SIKE1-205ENST00000466657 LAMA3Q16787 3333 aa21.55■■□□□ 1.04
SIKE1-205ENST00000466657 MYH4Q9Y623 1939 aa21.55■■□□□ 1.04
SIKE1-205ENST00000466657 USP17L12C9JPN9 530 aa21.55■■□□□ 1.04
SIKE1-205ENST00000466657 USP17L21D6R901 530 aa21.55■■□□□ 1.04
SIKE1-205ENST00000466657 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SIKE1-205ENST00000466657 IGHA2P01877 340 aa21.55■■□□□ 1.04
SIKE1-205ENST00000466657 AKR1B1P15121 316 aa21.55■■□□□ 1.04
SIKE1-205ENST00000466657 PTPREP23469 700 aa21.55■■□□□ 1.04
SIKE1-205ENST00000466657 CDK8P49336 464 aa21.55■■□□□ 1.04
SIKE1-205ENST00000466657 GRB14Q14449 540 aa21.55■■□□□ 1.04
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SIKE1-205ENST00000466657 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa21.55■■□□□ 1.04
SIKE1-205ENST00000466657 LPAR1Q92633 364 aa21.55■■□□□ 1.04
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SIKE1-205ENST00000466657 TMX2Q9Y320 296 aa21.55■■□□□ 1.04
SIKE1-205ENST00000466657 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa21.54■■□□□ 1.04
SIKE1-205ENST00000466657 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa21.54■■□□□ 1.04
SIKE1-205ENST00000466657 LHX8Q68G74 356 aa21.54■■□□□ 1.04
SIKE1-205ENST00000466657 HOXC10Q9NYD6 342 aa21.54■■□□□ 1.04
SIKE1-205ENST00000466657 CTR9Q6PD62 1173 aa21.53■■□□□ 1.04
SIKE1-205ENST00000466657 CLEC10AQ8IUN9 316 aa21.53■■□□□ 1.04
SIKE1-205ENST00000466657 FLRT1Q9NZU1 646 aa21.53■■□□□ 1.04
SIKE1-205ENST00000466657 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa21.53■■□□□ 1.04
SIKE1-205ENST00000466657 A0A1W2PPC1 479 aa21.52■■□□□ 1.04
SIKE1-205ENST00000466657 COL6A1P12109 1028 aa21.52■■□□□ 1.04
SIKE1-205ENST00000466657 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
SIKE1-205ENST00000466657 ICA1Q05084 483 aa21.52■■□□□ 1.04
SIKE1-205ENST00000466657 AMOTL1Q8IY63 956 aa21.52■■□□□ 1.04
SIKE1-205ENST00000466657 MB21D1Q8N884 522 aa21.52■■□□□ 1.04
SIKE1-205ENST00000466657 KBTBD3Q8NAB2 608 aa21.52■■□□□ 1.04
SIKE1-205ENST00000466657 SHCBP1Q8NEM2 672 aa21.52■■□□□ 1.04
SIKE1-205ENST00000466657 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.52■■□□□ 1.04
SIKE1-205ENST00000466657 C11orf49Q9H6J7 331 aa21.52■■□□□ 1.04
SIKE1-205ENST00000466657 SH2D4AQ9H788 454 aa21.52■■□□□ 1.04
SIKE1-205ENST00000466657 VCPKMTQ9H867 229 aa21.52■■□□□ 1.04
SIKE1-205ENST00000466657 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa21.52■■□□□ 1.04
SIKE1-205ENST00000466657 PFASO15067 1338 aa21.52■■□□□ 1.03
SIKE1-205ENST00000466657 DNAH12Q6ZR08 3092 aa21.52■■□□□ 1.03
SIKE1-205ENST00000466657 ROBO3Q96MS0 1386 aa21.51■■□□□ 1.03
SIKE1-205ENST00000466657 DSG3P32926 999 aa21.51■■□□□ 1.03
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SIKE1-205ENST00000466657 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SIKE1-205ENST00000466657 TANGO6Q9C0B7 1094 aa21.51■■□□□ 1.03
SIKE1-205ENST00000466657 SPATC1LQ9H0A9 340 aa21.51■■□□□ 1.03
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SIKE1-205ENST00000466657 GSG1L2A8MUP6 293 aa21.49■■□□□ 1.03
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SIKE1-205ENST00000466657 WDR78Q5VTH9 848 aa21.49■■□□□ 1.03
SIKE1-205ENST00000466657 MFSD14CQ5VZR4 134 aa21.49■■□□□ 1.03
SIKE1-205ENST00000466657 NPLOC4Q8TAT6 608 aa21.49■■□□□ 1.03
SIKE1-205ENST00000466657 KANSL2Q9H9L4 492 aa21.49■■□□□ 1.03
SIKE1-205ENST00000466657 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa21.49■■□□□ 1.03
SIKE1-205ENST00000466657 EEF2P13639 858 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SIKE1-205ENST00000466657 APPBP2Q92624 585 aa21.48■■□□□ 1.03
SIKE1-205ENST00000466657 OSBP2Q969R2 916 aa21.48■■□□□ 1.03
SIKE1-205ENST00000466657 GPATCH3Q96I76 525 aa21.48■■□□□ 1.03
SIKE1-205ENST00000466657 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
SIKE1-205ENST00000466657 SMCHD1A6NHR9 2005 aa21.48■■□□□ 1.03
SIKE1-205ENST00000466657 FLOT1O75955 427 aa21.47■■□□□ 1.03
SIKE1-205ENST00000466657 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
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SIKE1-205ENST00000466657 OLFML2BQ68BL8 750 aa21.47■■□□□ 1.03
SIKE1-205ENST00000466657 ABRAQ8N0Z2 381 aa21.47■■□□□ 1.03
SIKE1-205ENST00000466657 SPICE1Q8N0Z3 855 aa21.47■■□□□ 1.03
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SIKE1-205ENST00000466657 GDF15Q99988 308 aa21.47■■□□□ 1.03
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SIKE1-205ENST00000466657 CYBAP13498 195 aa21.46■■□□□ 1.03
SIKE1-205ENST00000466657 ADORA2AP29274 412 aa21.46■■□□□ 1.03
SIKE1-205ENST00000466657 BMP8BP34820 402 aa21.46■■□□□ 1.03
SIKE1-205ENST00000466657 ATP2B2Q01814 1243 aa21.46■■□□□ 1.03
SIKE1-205ENST00000466657 TSHZ3Q63HK5 1081 aa21.46■■□□□ 1.03
SIKE1-205ENST00000466657 C7orf61Q8IZ16 206 aa21.46■■□□□ 1.03
SIKE1-205ENST00000466657 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa21.46■■□□□ 1.03
SIKE1-205ENST00000466657 TTC41PQ6P2S7 1318 aa21.46■■□□□ 1.03
SIKE1-205ENST00000466657 MSCO60682 206 aa21.45■■□□□ 1.02
SIKE1-205ENST00000466657 RASA1P20936 1047 aa21.45■■□□□ 1.02
SIKE1-205ENST00000466657 TRPV1Q8NER1 839 aa21.45■■□□□ 1.02
SIKE1-205ENST00000466657 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SIKE1-205ENST00000466657 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SIKE1-205ENST00000466657 CYP2C19P33261 490 aa21.44■■□□□ 1.02
SIKE1-205ENST00000466657 PI4K2BQ8TCG2 481 aa21.44■■□□□ 1.02
SIKE1-205ENST00000466657 GOPCQ9HD26 462 aa21.44■■□□□ 1.02
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