RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466037.6

HOXB-AS3-204, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 522 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ALX1Q15699 326 aa23.5■■□□□ 1.35
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 ARMC5Q96C12 935 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 HOXC10Q9NYD6 342 aa23.49■■□□□ 1.35
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 Q3C1V9 767 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP23.42■■□□□ 1.34
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 ORC4O43929 436 aa23.41■■□□□ 1.34
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 KLRC3Q07444 240 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FAM83BQ5T0W9 1011 aa23.41■■□□□ 1.34
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 BTBD7Q9P203 1132 aa23.4■■□□□ 1.34
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RAD50Q92878 1312 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NDUFB10O96000 172 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ELNP15502 786 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-204ENST00000466037 POTEEQ6S8J3 1075 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CCDC136Q96JN2 1154 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DSCC1Q9BVC3 393 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
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