RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463118.1

AKAP9-208, Transcript of A-kinase anchoring protein 9, human

TSL 3

Gene AKAP9, Length 891 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP9-208	ENST00000463118	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	RAI14	Q9P0K7	980 aa		13.19	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		13.19	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		13.19	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	BECN2	A8MW95	431 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	DYNC1I1	O14576	645 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	PTGS1	P23219	599 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	13.18	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	MPND	Q8N594	471 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	FANCB	Q8NB91	859 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	ZNF384	Q8TF68	577 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	NLRP3	Q96P20	1036 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	SETDB2	Q96T68	719 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	MYL10	Q9BUA6	226 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	LY75	O60449	1722 aa		13.17	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	ORC4	O43929	436 aa		13.17	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	CFH	P08603	1231 aa		13.17	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	SHC4	Q6S5L8	630 aa		13.17	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	DRC7	Q8IY82	874 aa		13.17	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		13.17	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		13.17	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	ABCF2	Q9UG63	623 aa		13.17	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	13.17	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	POM121C	A8CG34	1229 aa		13.16	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	SMTNL1	A8MU46	457 aa		13.16	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	IKBKB	O14920	756 aa		13.16	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	CALM1	P0DP23	149 aa		13.16	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	CALM2	P0DP24	149 aa		13.16	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	CALM3	P0DP25	149 aa		13.16	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	TM4SF1	P30408	202 aa		13.16	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	13.16	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	SYK	P43405	635 aa		13.16	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	FUT2	Q10981	343 aa		13.16	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	SBK1	Q52WX2	424 aa		13.16	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		13.16	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		13.16	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		13.16	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		13.16	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		13.16	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	NGLY1	Q96IV0	654 aa		13.16	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	TNKS	O95271	1327 aa		13.15	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	LAMB1	P07942	1786 aa		13.15	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		13.15	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	MYO1B	O43795	1136 aa		13.15	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	ZPR1	O75312	459 aa		13.15	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	DDAH1	O94760	285 aa		13.15	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	UQCRH	P07919	91 aa		13.15	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	GUCY1A2	P33402	732 aa		13.15	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	CTR9	Q6PD62	1173 aa		13.15	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		13.15	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	HLA-C	Q95604	372 aa		13.15	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	TOMM22	Q9NS69	142 aa		13.15	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	KCND1	Q9NSA2	647 aa		13.15	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		13.15	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		13.15	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		13.15	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
AKAP9-208	ENST00000463118	TAF1	P21675	1872 aa		13.14	□□□□□ -0.31
AKAP9-208	ENST00000463118	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		13.14	□□□□□ -0.31
AKAP9-208	ENST00000463118	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
AKAP9-208	ENST00000463118	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		13.14	□□□□□ -0.31
AKAP9-208	ENST00000463118	BTBD18	B2RXH4	712 aa		13.14	□□□□□ -0.31
AKAP9-208	ENST00000463118	RNF40	O75150	1001 aa		13.14	□□□□□ -0.31
AKAP9-208	ENST00000463118	TPM4	P67936	248 aa		13.14	□□□□□ -0.31
AKAP9-208	ENST00000463118	PIP4K2B	P78356	416 aa		13.14	□□□□□ -0.31
AKAP9-208	ENST00000463118	MECOM	Q03112	1051 aa		13.14	□□□□□ -0.31
AKAP9-208	ENST00000463118	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		13.14	□□□□□ -0.31
AKAP9-208	ENST00000463118	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		13.14	□□□□□ -0.31

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 253.6 ms