RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa23.29■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 SCN7AQ01118 1682 aa23.29■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 SCG2P13521 617 aa23.29■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 CD44P16070 742 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa23.29■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 ANKRD2Q9GZV1 360 aa23.29■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa23.29■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 STX10O60499 249 aa23.28■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 STAMQ92783 540 aa23.28■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 MYH6P13533 1939 aa23.28■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 DPYDQ12882 1025 aa23.28■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 NR1I3Q14994 352 aa23.28■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 SPATA1Q5VX52 437 aa23.28■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 MCM9Q9NXL9 1143 aa23.28■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 A0A1B0GUL6 1792 aa23.28■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 GSDMAQ96QA5 445 aa23.27■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa23.27■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 A0A1B0GTH6 734 aa23.27■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 URI1O94763 535 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 MCM7P33993 719 aa23.27■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa23.27■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 TXNRD3Q86VQ6 643 aa23.27■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
IMP4-208ENST00000460766 FANCGO15287 622 aa23.26■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 CUL4BQ13620 913 aa23.26■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 PTF1AQ7RTS3 328 aa23.26■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 NARFQ9UHQ1 456 aa23.26■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 ZPR1O75312 459 aa23.26■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 TEX33O43247 280 aa23.25■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 USP17L8P0C7I0 530 aa23.25■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 SBK1Q52WX2 424 aa23.25■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 KIF5BP33176 963 aa23.25■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 TPTE2Q6XPS3 522 aa23.25■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 IQUBQ8NA54 791 aa23.25■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 BLZF1Q9H2G9 400 aa23.25■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 KAT14Q9H8E8 782 aa23.25■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 ADAMTS3O15072 1205 aa23.24■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 GNPATO15228 680 aa23.24■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 DMTNQ08495 405 aa23.23■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 RCSD1Q6JBY9 416 aa23.23■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 MNS1Q8NEH6 495 aa23.23■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa23.23■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa23.23■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 TRAPPC10P48553 1259 aa23.23■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 GNG11P61952 73 aa23.23■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 TFAP4Q01664 338 aa23.23■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 DESI2Q9BSY9 194 aa23.23■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 XDHP47989 1333 aa23.23■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 CPLX3Q8WVH0 158 aa23.22■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 CTNND2Q9UQB3 1225 aa23.22■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 PARP3Q9Y6F1 533 aa23.22■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 COBLO75128 1261 aa23.22■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 RPS6KA4O75676 772 aa23.22■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 USP5P45974 858 aa23.22■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 E2F4Q16254 413 aa23.22■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 IL17AQ16552 155 aa23.22■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa23.22■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 PPFIBP1Q86W92 1011 aa23.22■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 IGSF22Q8N9C0 903 aa23.22■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP23.22■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 RGL2O15211 777 aa23.21■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 CDKAL1Q5VV42 579 aa23.21■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 CTAGE1Q96RT6 745 aa23.21■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 CASQ1P31415 396 aa23.21■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 UBXN4Q92575 508 aa23.21■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 WDR24Q96S15 920 aa23.21■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
IMP4-208ENST00000460766 DLEC1Q9Y238 1755 aa23.2■■□□□ 1.3
IMP4-208ENST00000460766 CALML3P27482 149 aa23.2■■□□□ 1.3
IMP4-208ENST00000460766 RBL2Q08999 1139 aa23.2■■□□□ 1.3
IMP4-208ENST00000460766 MTF1Q14872 753 aa23.2■■□□□ 1.3
IMP4-208ENST00000460766 FILIP1LQ4L180 1135 aa23.2■■□□□ 1.3
IMP4-208ENST00000460766 PNMA1Q8ND90 353 aa23.2■■□□□ 1.3
IMP4-208ENST00000460766 DYNLL2Q96FJ2 89 aa23.2■■□□□ 1.3
IMP4-208ENST00000460766 CARD6Q9BX69 1037 aa23.2■■□□□ 1.3
IMP4-208ENST00000460766 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa23.2■■□□□ 1.3
IMP4-208ENST00000460766 RRAGBQ5VZM2 374 aa23.2■■□□□ 1.3
IMP4-208ENST00000460766 PDXDC2PQ6P474 469 aa23.2■■□□□ 1.3
IMP4-208ENST00000460766 BLIDQ8IZY5 108 aa23.2■■□□□ 1.3
IMP4-208ENST00000460766 PANX2Q96RD6 677 aa23.2■■□□□ 1.3
IMP4-208ENST00000460766 IL17RBQ9NRM6 502 aa23.2■■□□□ 1.3
IMP4-208ENST00000460766 SOWAHDA6NJG2 315 aa23.19■■□□□ 1.3
IMP4-208ENST00000460766 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
IMP4-208ENST00000460766 CDC25AP30304 524 aa23.19■■□□□ 1.3
IMP4-208ENST00000460766 C12orf60Q5U649 245 aa23.19■■□□□ 1.3
IMP4-208ENST00000460766 STAG2Q8N3U4 1231 aa23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms