RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460297.1

NME4-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 5

Gene NME4, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-209ENST00000460297 WRNIP1Q96S55 665 aa28.27■■■□□ 2.12
NME4-209ENST00000460297 MAP3K14Q99558 947 aa28.27■■■□□ 2.12
NME4-209ENST00000460297 MTMR7Q9Y216 660 aa28.27■■■□□ 2.12
NME4-209ENST00000460297 PTPDC1A2A3K4 754 aa28.26■■■□□ 2.12
NME4-209ENST00000460297 USP2O75604 605 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.12
NME4-209ENST00000460297 PRKG1Q13976 671 aa28.26■■■□□ 2.12
NME4-209ENST00000460297 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa28.26■■■□□ 2.11
NME4-209ENST00000460297 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa28.26■■■□□ 2.11
NME4-209ENST00000460297 A0A1W2PRG0 241 aa28.26■■■□□ 2.11
NME4-209ENST00000460297 GRM4Q14833 912 aa28.26■■■□□ 2.11
NME4-209ENST00000460297 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
NME4-209ENST00000460297 DDX11Q96FC9 970 aa28.26■■■□□ 2.11
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NME4-209ENST00000460297 OTOFQ9HC10 1997 aa28.24■■■□□ 2.11
NME4-209ENST00000460297 STAG2Q8N3U4 1231 aa28.24■■■□□ 2.11
NME4-209ENST00000460297 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP28.24■■■□□ 2.115e-9■■■□□ 17.3
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NME4-209ENST00000460297 GINM1Q9NU53 330 aa28.24■■■□□ 2.11
NME4-209ENST00000460297 MAD2L2Q9UI95 211 aa28.24■■■□□ 2.11
NME4-209ENST00000460297 USP17L5A8MUK1 530 aa28.23■■■□□ 2.11
NME4-209ENST00000460297 PLEKHA8P1O95397 391 aa28.23■■■□□ 2.11
NME4-209ENST00000460297 PDHBP11177 359 aa28.23■■■□□ 2.11
NME4-209ENST00000460297 FDPSP14324 419 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
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NME4-209ENST00000460297 ECE1P42892 770 aa28.23■■■□□ 2.11
NME4-209ENST00000460297 SCYL3Q8IZE3 742 aa28.23■■■□□ 2.11
NME4-209ENST00000460297 SNHG28P0DPA3 235 aa28.23■■■□□ 2.11
NME4-209ENST00000460297 KIF5BP33176 963 aa28.23■■■□□ 2.11
NME4-209ENST00000460297 FUT2Q10981 343 aa28.23■■■□□ 2.11
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NME4-209ENST00000460297 PHKBQ93100 1093 aa28.23■■■□□ 2.11
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NME4-209ENST00000460297 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
NME4-209ENST00000460297 CDKL5O76039 1030 aa28.22■■■□□ 2.11
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NME4-209ENST00000460297 USP17L2Q6R6M4 530 aa28.22■■■□□ 2.11
NME4-209ENST00000460297 NBPF11Q86T75 865 aa28.22■■■□□ 2.11
NME4-209ENST00000460297 CCDC82Q8N4S0 544 aa28.22■■■□□ 2.11
NME4-209ENST00000460297 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa28.22■■■□□ 2.11
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NME4-209ENST00000460297 GOLGA8HP0CJ92 632 aa28.21■■■□□ 2.11
NME4-209ENST00000460297 NF2P35240 595 aa28.21■■■□□ 2.11
NME4-209ENST00000460297 TMX2Q9Y320 296 aa28.21■■■□□ 2.11
NME4-209ENST00000460297 MYH6P13533 1939 aa28.21■■■□□ 2.11
NME4-209ENST00000460297 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP28.2■■■□□ 2.11
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NME4-209ENST00000460297 PHIPQ8WWQ0 1821 aa28.2■■■□□ 2.11
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NME4-209ENST00000460297 CHMP5Q9NZZ3 219 aa28.19■■■□□ 2.1
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NME4-209ENST00000460297 KLRC3Q07444 240 aa28.19■■■□□ 2.1
NME4-209ENST00000460297 UBE2Q2LH0YL09 131 aa28.18■■■□□ 2.1
NME4-209ENST00000460297 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
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NME4-209ENST00000460297 MAP3K9P80192 1104 aa28.18■■■□□ 2.1
NME4-209ENST00000460297 SLC35G1Q2M3R5 365 aa28.18■■■□□ 2.1
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NME4-209ENST00000460297 KLRF2D3W0D1 207 aa28.17■■■□□ 2.1
NME4-209ENST00000460297 SYT1P21579 422 aa28.17■■■□□ 2.1
NME4-209ENST00000460297 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
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NME4-209ENST00000460297 MOB2Q70IA6 237 aa28.17■■■□□ 2.1
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NME4-209ENST00000460297 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa28.17■■■□□ 2.1
NME4-209ENST00000460297 RAD21O60216 631 aa28.16■■■□□ 2.1
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NME4-209ENST00000460297 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa28.16■■■□□ 2.1
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NME4-209ENST00000460297 DCAF4Q8WV16 495 aa28.15■■■□□ 2.1
NME4-209ENST00000460297 GMCL1Q96IK5 515 aa28.15■■■□□ 2.1
NME4-209ENST00000460297 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
NME4-209ENST00000460297 SH2D4AQ9H788 454 aa28.15■■■□□ 2.1
NME4-209ENST00000460297 CYTH3O43739 400 aa28.14■■■□□ 2.1
NME4-209ENST00000460297 KCTD1Q719H9 257 aa28.14■■■□□ 2.1
NME4-209ENST00000460297 TRIM22Q8IYM9 498 aa28.14■■■□□ 2.1
NME4-209ENST00000460297 WDR18Q9BV38 432 aa28.14■■■□□ 2.1
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