RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, human

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP5-208	ENST00000459627	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	28.52	■■■□□ 2.16
SH3BP5-208	ENST00000459627	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		28.52	■■■□□ 2.16
SH3BP5-208	ENST00000459627	PORCN	Q9H237	461 aa		28.52	■■■□□ 2.16
SH3BP5-208	ENST00000459627	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		28.52	■■■□□ 2.16
SH3BP5-208	ENST00000459627	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		28.52	■■■□□ 2.16
SH3BP5-208	ENST00000459627	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	28.52	■■■□□ 2.16
SH3BP5-208	ENST00000459627	TMX2	Q9Y320	296 aa		28.52	■■■□□ 2.16
SH3BP5-208	ENST00000459627	RAD21	O60216	631 aa		28.51	■■■□□ 2.15
SH3BP5-208	ENST00000459627	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	28.51	■■■□□ 2.15
SH3BP5-208	ENST00000459627	PPARA	Q07869	468 aa		28.51	■■■□□ 2.15
SH3BP5-208	ENST00000459627	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		28.51	■■■□□ 2.15
SH3BP5-208	ENST00000459627	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	28.51	■■■□□ 2.15
SH3BP5-208	ENST00000459627	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	28.5	■■■□□ 2.15
SH3BP5-208	ENST00000459627	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	28.5	■■■□□ 2.15
SH3BP5-208	ENST00000459627	ADCY3	O60266	1144 aa		28.5	■■■□□ 2.15
SH3BP5-208	ENST00000459627	VCPKMT	Q9H867	229 aa		28.5	■■■□□ 2.15
SH3BP5-208	ENST00000459627	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		28.5	■■■□□ 2.15
SH3BP5-208	ENST00000459627	BTBD7	Q9P203	1132 aa		28.5	■■■□□ 2.15
SH3BP5-208	ENST00000459627	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		28.5	■■■□□ 2.15
SH3BP5-208	ENST00000459627	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	28.49	■■■□□ 2.15
SH3BP5-208	ENST00000459627	SDS	P20132	328 aa		28.49	■■■□□ 2.15
SH3BP5-208	ENST00000459627	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		28.49	■■■□□ 2.15
SH3BP5-208	ENST00000459627	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		28.49	■■■□□ 2.15
SH3BP5-208	ENST00000459627	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		28.49	■■■□□ 2.15
SH3BP5-208	ENST00000459627	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	28.48	■■■□□ 2.15
SH3BP5-208	ENST00000459627	BRCA2	P51587	3418 aa		28.48	■■■□□ 2.15
SH3BP5-208	ENST00000459627	PLXNB2	O15031	1838 aa		28.48	■■■□□ 2.15
SH3BP5-208	ENST00000459627	SH2D4A	Q9H788	454 aa		28.47	■■■□□ 2.15
SH3BP5-208	ENST00000459627	GJD2	Q9UKL4	321 aa		28.47	■■■□□ 2.15
SH3BP5-208	ENST00000459627	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		28.47	■■■□□ 2.15
SH3BP5-208	ENST00000459627	RLF	Q13129	1914 aa		28.45	■■■□□ 2.15
SH3BP5-208	ENST00000459627	WDR78	Q5VTH9	848 aa		28.45	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	28.45	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		28.45	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	28.45	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	28.45	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		28.45	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		28.45	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		28.44	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	FLOT1	O75955	427 aa		28.44	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	INHA	P05111	366 aa		28.44	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	CCL5	P13501	91 aa		28.44	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	CYP2B6	P20813	491 aa		28.44	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	PDE4B	Q07343	736 aa		28.44	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	IRF5	Q13568	498 aa		28.44	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	COG2	Q14746	738 aa		28.44	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		28.44	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	28.44	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	GPR142	Q7Z601	462 aa		28.44	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	ATG4C	Q96DT6	458 aa		28.44	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	CEP95	Q96GE4	821 aa		28.44	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	28.44	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		28.43	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	FGA	P02671	866 aa		28.43	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	28.43	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	28.43	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	TFAP4	Q01664	338 aa		28.43	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	TRIM32	Q13049	653 aa		28.43	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	LPAR1	Q92633	364 aa		28.43	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		28.43	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		28.43	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	28.43	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	28.43	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	28.42	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	28.42	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	TSPY3	P0CV98	308 aa		28.42	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	TSPY8	P0CW00	308 aa		28.42	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	MAPK4	P31152	587 aa		28.42	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	DSG3	P32926	999 aa		28.42	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	HAND2	P61296	217 aa		28.42	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	LBX2	Q6XYB7	198 aa		28.42	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		28.42	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	28.42	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		28.42	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	GOPC	Q9HD26	462 aa		28.42	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		28.42	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	NYAP2	Q9P242	653 aa		28.42	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	UBXN2A	P68543	259 aa		28.41	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	ALX1	Q15699	326 aa		28.41	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	TTC22	Q5TAA0	569 aa		28.41	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	RNF208	Q9H0X6	261 aa		28.41	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		28.41	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	MYH4	Q9Y623	1939 aa		28.41	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		28.4	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		28.4	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		28.4	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		28.4	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	PARP14	Q460N5	1801 aa		28.39	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627		F5H6K3	240 aa		28.39	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	NMT2	O60551	498 aa		28.39	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	KLRC3	Q07444	240 aa		28.39	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	PLS1	Q14651	629 aa		28.39	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	28.39	■■■□□ 2.14
SH3BP5-208	ENST00000459627		A0A0G2JMZ2	1700 aa		28.38	■■■□□ 2.13
SH3BP5-208	ENST00000459627	NDUFB10	O96000	172 aa		28.38	■■■□□ 2.13
SH3BP5-208	ENST00000459627	CCNA1	P78396	465 aa		28.38	■■■□□ 2.13
SH3BP5-208	ENST00000459627	CCL14	Q16627	93 aa		28.38	■■■□□ 2.13
SH3BP5-208	ENST00000459627	MORN1	Q5T089	497 aa		28.38	■■■□□ 2.13
SH3BP5-208	ENST00000459627	TRIB2	Q92519	343 aa		28.38	■■■□□ 2.13
SH3BP5-208	ENST00000459627	SHISA4	Q96DD7	197 aa		28.38	■■■□□ 2.13

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