RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 CAPN2P17655 700 aa10.24□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAPK4P31152 587 aa10.24□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 USP17L24Q0WX57 530 aa10.24□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 ANKLE1Q8NAG6 615 aa10.24□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 FEZ1Q99689 392 aa10.24□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 HAUS7Q99871 368 aa10.24□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa10.24□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 COL6A1P12109 1028 aa10.23□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 AKR1B1P15121 316 aa10.23□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 USP14P54578 494 aa10.23□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAP2K5Q13163 448 aa10.23□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 PDE3AQ14432 1141 aa10.23□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 LHX8Q68G74 356 aa10.23□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 PLEKHH3Q7Z736 793 aa10.23□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 NPLOC4Q8TAT6 608 aa10.23□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 APBA2Q99767 749 aa10.23□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 MYO9BQ13459 2157 aa10.23□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 HOXC6P09630 235 aa10.22□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 PTPREP23469 700 aa10.22□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 RGS2P41220 211 aa10.22□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 GRB14Q14449 540 aa10.22□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 UBE3CQ15386 1083 aa10.22□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 C12orf60Q5U649 245 aa10.22□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 NECAB2Q7Z6G3 386 aa10.22□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 GDF15Q99988 308 aa10.22□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 CABP5Q9NP86 173 aa10.22□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 USP17L12C9JPN9 530 aa10.21□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 USP17L21D6R901 530 aa10.21□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 EVI5O60447 810 aa10.21□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 CDK8P49336 464 aa10.21□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM179Q6ZVK1 233 aa10.21□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 C16orf86Q6ZW13 317 aa10.21□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRPV1Q8NER1 839 aa10.21□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP10.21□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 LRRCC1Q9C099 1032 aa10.21□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 BCL11AQ9H165 835 aa10.21□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa10.21□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 SWAP70Q9UH65 585 aa10.21□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMX2Q9Y320 296 aa10.21□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 NR2E3Q9Y5X4 410 aa10.21□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 ROBO3Q96MS0 1386 aa10.21□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa10.21□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC15A5A6NIM6 579 aa10.2□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 MYH7BA7E2Y1 1941 aa10.2□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 TSHZ3Q63HK5 1081 aa10.2□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 C7orf61Q8IZ16 206 aa10.2□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 NBPF3Q9H094 633 aa10.2□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 C11orf49Q9H6J7 331 aa10.2□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 DCTPP1Q9H773 170 aa10.2□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 STAP2Q9UGK3 403 aa10.2□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 GSG1L2A8MUP6 293 aa10.19□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 CYBAP13498 195 aa10.19□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 COG2Q14746 738 aa10.19□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 CTR9Q6PD62 1173 aa10.19□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 OSBP2Q969R2 916 aa10.19□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 ATG4CQ96DT6 458 aa10.19□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPATC1LQ9H0A9 340 aa10.19□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 VCPKMTQ9H867 229 aa10.19□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 FBXO28Q9NVF7 368 aa10.19□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa10.19□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 SALL3Q9BXA9 1300 aa10.18□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A1W2PPC1 479 aa10.18□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 COBLO75128 1261 aa10.18□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 EEF2P13639 858 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 SYN1P17600 705 aa10.18□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 ERCC3P19447 782 aa10.18□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 CYP2C19P33261 490 aa10.18□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 BMP8BP34820 402 aa10.18□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCNA1P78396 465 aa10.18□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 ICA1Q05084 483 aa10.18□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 LRRC26Q2I0M4 334 aa10.18□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPICE1Q8N0Z3 855 aa10.18□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 KBTBD3Q8NAB2 608 aa10.18□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 SHCBP1Q8NEM2 672 aa10.18□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 REPS2Q8NFH8 660 aa10.18□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 LPAR1Q92633 364 aa10.18□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 LRCH3Q96II8 777 aa10.18□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCDC17Q96LX7 622 aa10.18□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 TANGO6Q9C0B7 1094 aa10.18□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP10.18□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 ECHDC1Q9NTX5 307 aa10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms