RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 PDE6AP16499 860 aa14.92□□□□□ -0.02
PRAME-208ENST00000438888 USP14P54578 494 aa14.92□□□□□ -0.02
PRAME-208ENST00000438888 CCNA1P78396 465 aa14.92□□□□□ -0.02
PRAME-208ENST00000438888 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa14.92□□□□□ -0.02
PRAME-208ENST00000438888 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PRAME-208ENST00000438888 SDR42E1Q8WUS8 393 aa14.92□□□□□ -0.02
PRAME-208ENST00000438888 USP6NLQ92738 828 aa14.92□□□□□ -0.02
PRAME-208ENST00000438888 BOLA2Q9H3K6 86 aa14.92□□□□□ -0.02
PRAME-208ENST00000438888 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PRAME-208ENST00000438888 MCM9Q9NXL9 1143 aa14.92□□□□□ -0.02
PRAME-208ENST00000438888 PFASO15067 1338 aa14.92□□□□□ -0.02
PRAME-208ENST00000438888 ZNF532Q9HCE3 1301 aa14.92□□□□□ -0.02
PRAME-208ENST00000438888 MAP2K5Q13163 448 aa14.91□□□□□ -0.02
PRAME-208ENST00000438888 SEPT2Q15019 361 aa14.91□□□□□ -0.02
PRAME-208ENST00000438888 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PRAME-208ENST00000438888 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa14.91□□□□□ -0.02
PRAME-208ENST00000438888 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PRAME-208ENST00000438888 HAUS7Q99871 368 aa14.91□□□□□ -0.02
PRAME-208ENST00000438888 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PRAME-208ENST00000438888 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa14.91□□□□□ -0.02
PRAME-208ENST00000438888 BTBD7Q9P203 1132 aa14.91□□□□□ -0.02
PRAME-208ENST00000438888 A0A1W2PPC1 479 aa14.9□□□□□ -0.02
PRAME-208ENST00000438888 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PRAME-208ENST00000438888 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa14.9□□□□□ -0.02
PRAME-208ENST00000438888 CYP2D6P10635 497 aa14.9□□□□□ -0.02
PRAME-208ENST00000438888 GUCY1A2P33402 732 aa14.9□□□□□ -0.02
PRAME-208ENST00000438888 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PRAME-208ENST00000438888 LCORLQ8N3X6 602 aa14.9□□□□□ -0.02
PRAME-208ENST00000438888 SLC44A5Q8NCS7 719 aa14.9□□□□□ -0.02
PRAME-208ENST00000438888 GDF15Q99988 308 aa14.9□□□□□ -0.02
PRAME-208ENST00000438888 FLRT1Q9NZU1 646 aa14.9□□□□□ -0.02
PRAME-208ENST00000438888 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa14.9□□□□□ -0.02
PRAME-208ENST00000438888 NAV1Q8NEY1 1877 aa14.9□□□□□ -0.02
PRAME-208ENST00000438888 SDSP20132 328 aa14.89□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 CNGA1P29973 690 aa14.89□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 SLFNL1Q499Z3 407 aa14.89□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 MFSD14CQ5VZR4 134 aa14.89□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 LHX8Q68G74 356 aa14.89□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 TANGO6Q9C0B7 1094 aa14.89□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 ARMT1Q9H993 441 aa14.89□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 MYH7P12883 1935 aa14.88□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 A0A1W2PRG0 241 aa14.88□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 PTPREP23469 700 aa14.88□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 GABPAQ06546 454 aa14.88□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 LRRC26Q2I0M4 334 aa14.88□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 CLEC10AQ8IUN9 316 aa14.88□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 RILPL2Q969X0 211 aa14.88□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 EVI5LQ96CN4 794 aa14.88□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 DYNLL2Q96FJ2 89 aa14.88□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 PAG1Q9NWQ8 432 aa14.88□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 SLC15A5A6NIM6 579 aa14.87□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 PRKAB2O43741 272 aa14.87□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 MBD4O95243 580 aa14.87□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 COL6A1P12109 1028 aa14.87□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 CYP2C19P33261 490 aa14.87□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 ATP2B2Q01814 1243 aa14.87□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 NPLOC4Q8TAT6 608 aa14.87□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa14.86□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 BMP8BP34820 402 aa14.86□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 GRB14Q14449 540 aa14.86□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 PLS1Q14651 629 aa14.86□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 LBX2Q6XYB7 198 aa14.86□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 SPICE1Q8N0Z3 855 aa14.86□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 SMIM22K7EJ46 135 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 CDC45O75419 566 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 CHGBP05060 677 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 AKR1B1P15121 316 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 ANO1Q5XXA6 986 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 TMEM179Q6ZVK1 233 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 Q7L0L9 218 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 DPP9Q86TI2 863 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 TDHQ8IZJ6 230 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 FSD1Q9BTV5 496 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 FLOT1O75955 427 aa14.84□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 ERCC3P19447 782 aa14.84□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 ADORA2AP29274 412 aa14.84□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 ICA1Q05084 483 aa14.84□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 COG2Q14746 738 aa14.84□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 KBTBD3Q8NAB2 608 aa14.84□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 SLC17A8Q8NDX2 589 aa14.84□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 TRPV1Q8NER1 839 aa14.84□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 SPATC1LQ9H0A9 340 aa14.84□□□□□ -0.03
PRAME-208ENST00000438888 RAD21O60216 631 aa14.83□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 HOXC6P09630 235 aa14.83□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 ADD2P35612 726 aa14.83□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 NCAPG2Q86XI2 1143 aa14.83□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 DEFB123Q8N688 67 aa14.83□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 ATG4CQ96DT6 458 aa14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms