RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428098.5

DDX39B-208, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 817 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-208ENST00000428098 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
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DDX39B-208ENST00000428098 MSRAQ9UJ68 235 aa14.76□□□□□ -0.05
DDX39B-208ENST00000428098 PALD1Q9ULE6 856 aa14.76□□□□□ -0.05
DDX39B-208ENST00000428098 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
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DDX39B-208ENST00000428098 STRNO43815 780 aa14.75□□□□□ -0.05
DDX39B-208ENST00000428098 GH2P01242 217 aa14.75□□□□□ -0.05
DDX39B-208ENST00000428098 LDHCP07864 332 aa14.75□□□□□ -0.05
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DDX39B-208ENST00000428098 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa14.75□□□□□ -0.05
DDX39B-208ENST00000428098 ACER1Q8TDN7 264 aa14.75□□□□□ -0.05
DDX39B-208ENST00000428098 CD320Q9NPF0 282 aa14.75□□□□□ -0.05
DDX39B-208ENST00000428098 GINM1Q9NU53 330 aa14.75□□□□□ -0.05
DDX39B-208ENST00000428098 HMG20BQ9P0W2 317 aa14.75□□□□□ -0.05
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DDX39B-208ENST00000428098 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.058e-13■□□□□ 9.9
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DDX39B-208ENST00000428098 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
DDX39B-208ENST00000428098 SLC28A3Q9HAS3 691 aa14.74□□□□□ -0.05
DDX39B-208ENST00000428098 FBXO3Q9UK99 471 aa14.74□□□□□ -0.05
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DDX39B-208ENST00000428098 RAB30Q15771 203 aa14.73□□□□□ -0.05
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DDX39B-208ENST00000428098 WDR63Q8IWG1 891 aa14.73□□□□□ -0.05
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DDX39B-208ENST00000428098 HERVK_113Q902F9 699 aa14.73□□□□□ -0.05
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DDX39B-208ENST00000428098 RARBP10826 455 aa14.72□□□□□ -0.05
DDX39B-208ENST00000428098 IL15P40933 162 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
DDX39B-208ENST00000428098 CDK7P50613 346 aa14.72□□□□□ -0.05
DDX39B-208ENST00000428098 ACLYP53396 1101 aa14.72□□□□□ -0.05
DDX39B-208ENST00000428098 RABGGTBP53611 331 aa14.72□□□□□ -0.05
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DDX39B-208ENST00000428098 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa14.72□□□□□ -0.05
DDX39B-208ENST00000428098 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
DDX39B-208ENST00000428098 RAI14Q9P0K7 980 aa14.72□□□□□ -0.05
DDX39B-208ENST00000428098 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
DDX39B-208ENST00000428098 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
DDX39B-208ENST00000428098 KRT40Q6A162 431 aa14.71□□□□□ -0.05
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DDX39B-208ENST00000428098 SPATA5Q8NB90 893 aa14.71□□□□□ -0.05
DDX39B-208ENST00000428098 FEZ1Q99689 392 aa14.71□□□□□ -0.05
DDX39B-208ENST00000428098 SPATC1LQ9H0A9 340 aa14.71□□□□□ -0.05
DDX39B-208ENST00000428098 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.057e-11■■■■□ 20.8
DDX39B-208ENST00000428098 MTCH2Q9Y6C9 303 aa14.71□□□□□ -0.05
DDX39B-208ENST00000428098 FLT1P17948 1338 aa14.7□□□□□ -0.06
DDX39B-208ENST00000428098 A0A1B0GUL7 405 aa14.7□□□□□ -0.06
DDX39B-208ENST00000428098 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
DDX39B-208ENST00000428098 CYP2C18P33260 490 aa14.7□□□□□ -0.06
DDX39B-208ENST00000428098 KCNA10Q16322 511 aa14.7□□□□□ -0.06
DDX39B-208ENST00000428098 TATDN1Q6P1N9 297 aa14.7□□□□□ -0.06
DDX39B-208ENST00000428098 ADGRA1Q86SQ6 560 aa14.7□□□□□ -0.06
DDX39B-208ENST00000428098 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
DDX39B-208ENST00000428098 SHCBP1Q8NEM2 672 aa14.7□□□□□ -0.06
DDX39B-208ENST00000428098 KLHDC9Q8NEP7 349 aa14.7□□□□□ -0.06
DDX39B-208ENST00000428098 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
DDX39B-208ENST00000428098 STARD7Q9NQZ5 370 aa14.7□□□□□ -0.06
DDX39B-208ENST00000428098 GBF1Q92538 1859 aa14.69□□□□□ -0.06
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DDX39B-208ENST00000428098 USP14P54578 494 aa14.69□□□□□ -0.06
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DDX39B-208ENST00000428098 COG2Q14746 738 aa14.69□□□□□ -0.06
DDX39B-208ENST00000428098 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
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DDX39B-208ENST00000428098 TMEM199Q8N511 208 aa14.69□□□□□ -0.06
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DDX39B-208ENST00000428098 TRIM34Q9BYJ4 488 aa14.69□□□□□ -0.06
DDX39B-208ENST00000428098 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa14.69□□□□□ -0.06
DDX39B-208ENST00000428098 IL23AQ9NPF7 189 aa14.69□□□□□ -0.06
DDX39B-208ENST00000428098 WDFY4Q6ZS81 3184 aa14.69□□□□□ -0.06
DDX39B-208ENST00000428098 ZNF236Q9UL36 1845 aa14.69□□□□□ -0.06
DDX39B-208ENST00000428098 MYADML2A6NDP7 307 aa14.68□□□□□ -0.06
DDX39B-208ENST00000428098 EPOPA6NHQ4 379 aa14.68□□□□□ -0.06
DDX39B-208ENST00000428098 FGBP02675 491 aa14.68□□□□□ -0.06
DDX39B-208ENST00000428098 GUCY1A2P33402 732 aa14.68□□□□□ -0.06
DDX39B-208ENST00000428098 NHLH1Q02575 133 aa14.68□□□□□ -0.06
DDX39B-208ENST00000428098 RAB3GAP1Q15042 981 aa14.68□□□□□ -0.06
DDX39B-208ENST00000428098 OTOP2Q7RTS6 562 aa14.68□□□□□ -0.06
DDX39B-208ENST00000428098 ABRAQ8N0Z2 381 aa14.68□□□□□ -0.06
DDX39B-208ENST00000428098 SLC5A4Q9NY91 659 aa14.68□□□□□ -0.06
DDX39B-208ENST00000428098 HOXC10Q9NYD6 342 aa14.68□□□□□ -0.06
DDX39B-208ENST00000428098 NRBP1Q9UHY1 535 aa14.68□□□□□ -0.06
DDX39B-208ENST00000428098 ZNF521Q96K83 1311 aa14.67□□□□□ -0.06
DDX39B-208ENST00000428098 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
DDX39B-208ENST00000428098 PGK2P07205 417 aa14.67□□□□□ -0.06
DDX39B-208ENST00000428098 TFCP2Q12800 502 aa14.67□□□□□ -0.06
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