RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYP2C19P33261 490 aa15.96■□□□□ 0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa15.96■□□□□ 0.14
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KBTBD13C9JR72 458 aa15.9■□□□□ 0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COBLO75128 1261 aa15.9■□□□□ 0.14
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NCAPG2Q86XI2 1143 aa15.9■□□□□ 0.14
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPICE1Q8N0Z3 855 aa15.9■□□□□ 0.14
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PAG1Q9NWQ8 432 aa15.9■□□□□ 0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa15.9■□□□□ 0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMX2Q9Y320 296 aa15.9■□□□□ 0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WDR46O15213 610 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRKAB2O43741 272 aa15.89■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HMMRO75330 724 aa15.89■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADD2P35612 726 aa15.89■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SIAH1Q8IUQ4 282 aa15.89■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAML3Q96JK9 1138 aa15.89■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa15.89■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CUL9Q8IWT3 2517 aa15.88■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POTEB2H3BUK9 544 aa15.88■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MS4A1P11836 297 aa15.88■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNX17Q15036 470 aa15.88■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLFNL1Q499Z3 407 aa15.88■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa15.88■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BCL11AQ9H165 835 aa15.88■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BOLA2Q9H3K6 86 aa15.88■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZBED9Q6R2W3 1325 aa15.88■□□□□ 0.13
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa15.88■□□□□ 0.13
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