RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 STAG1Q8WVM7 1258 aa20.57■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CEP95Q96GE4 821 aa20.57■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 VCPKMTQ9H867 229 aa20.57■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GOPCQ9HD26 462 aa20.57■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NYAP2Q9P242 653 aa20.57■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MYH8P13535 1937 aa20.57■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SOX10P56693 466 aa20.56■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AKNAD1Q5T1N1 836 aa20.56■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CASC1Q6TDU7 716 aa20.56■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MFSD6Q6ZSS7 791 aa20.56■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 INCENPQ9NQS7 918 aa20.56■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MTMR4Q9NYA4 1195 aa20.56■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TTLL1O95922 423 aa20.55■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HERVK_113P62684 666 aa20.55■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM110CQ1W6H9 321 aa20.55■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TBC1D10CQ8IV04 446 aa20.55■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SPICE1Q8N0Z3 855 aa20.55■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa20.55■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TANGO6Q9C0B7 1094 aa20.55■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NBPF3Q9H094 633 aa20.55■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EFCC1Q9HA90 598 aa20.55■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CLIP2Q9UDT6 1046 aa20.55■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRIM17Q9Y577 477 aa20.55■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 WDR46O15213 610 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RAD21O60216 631 aa20.54■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NT5C2P49902 561 aa20.54■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa20.54■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa20.54■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OTOP1Q7RTM1 612 aa20.54■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa20.54■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HPS5Q9UPZ3 1129 aa20.54■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TACC3Q9Y6A5 838 aa20.54■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CDC45O75419 566 aa20.53■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ESR2Q92731 530 aa20.53■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa20.53■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 STX8Q9UNK0 236 aa20.53■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GNRH1P01148 92 aa20.52■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PSMC4P43686 418 aa20.52■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FCGRTP55899 365 aa20.52■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PTH1RQ03431 593 aa20.52■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa20.52■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MKL1Q969V6 931 aa20.52■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa20.52■□□□□ 0.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NEDD4P46934 1319 aa20.52■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MORF4L1Q9UBU8 362 aa20.51■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 F5H6K3 240 aa20.5■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NMT2O60551 498 aa20.5■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CAP1Q01518 475 aa20.5■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KLRC3Q07444 240 aa20.5■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 COG2Q14746 738 aa20.5■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa20.5■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa20.5■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PAGR1Q9BTK6 254 aa20.5■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CNNM2Q9H8M5 875 aa20.5■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ANO2Q9NQ90 1003 aa20.5■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IL17RBQ9NRM6 502 aa20.5■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FLOT1O75955 427 aa20.49■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NDUFB10O96000 172 aa20.49■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LBX2Q6XYB7 198 aa20.49■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MAP4K1Q92918 833 aa20.49■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRIM47Q96LD4 638 aa20.49■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KRT23Q9C075 422 aa20.49■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa20.49■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HOXC10Q9NYD6 342 aa20.49■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa20.49■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HTTP42858 3142 aa20.49■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CYP21A2P08686 494 aa20.48■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HOXD10P28358 340 aa20.48■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CTGFP29279 349 aa20.48■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRMT2P55345 433 aa20.48■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ERVK-9P63128 1117 aa20.48■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ERVK-24P63145 666 aa20.48■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM83BQ5T0W9 1011 aa20.48■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TXNRD2Q9NNW7 524 aa20.48■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RBPJLQ9UBG7 517 aa20.48■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PTPN22Q9Y2R2 807 aa20.48■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MYPNQ86TC9 1320 aa20.48■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LAMA4Q16363 1823 aa20.48■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 B4E1Z4 1266 aa20.47■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KDM4AO75164 1064 aa20.47■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NOVP48745 357 aa20.47■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRDNQ13061 729 aa20.47■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IQCA1Q86XH1 822 aa20.47■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DSG3P32926 999 aa20.46■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCNA1P78396 465 aa20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms