RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415164.5

UBXN4-202, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-202ENST00000415164 GABPAQ06546 454 aa23.36■■□□□ 1.33
UBXN4-202ENST00000415164 COG2Q14746 738 aa23.36■■□□□ 1.33
UBXN4-202ENST00000415164 ANO1Q5XXA6 986 aa23.36■■□□□ 1.33
UBXN4-202ENST00000415164 CLEC10AQ8IUN9 316 aa23.36■■□□□ 1.33
UBXN4-202ENST00000415164 MIER1Q8N108 512 aa23.36■■□□□ 1.33
UBXN4-202ENST00000415164 KIF1BPQ96EK5 621 aa23.36■■□□□ 1.33
UBXN4-202ENST00000415164 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
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UBXN4-202ENST00000415164 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
UBXN4-202ENST00000415164 ADORA2AP29274 412 aa23.35■■□□□ 1.33
UBXN4-202ENST00000415164 LRIT3Q3SXY7 679 aa23.35■■□□□ 1.33
UBXN4-202ENST00000415164 SPICE1Q8N0Z3 855 aa23.35■■□□□ 1.33
UBXN4-202ENST00000415164 HOXC10Q9NYD6 342 aa23.35■■□□□ 1.33
UBXN4-202ENST00000415164 PRKAB2O43741 272 aa23.34■■□□□ 1.33
UBXN4-202ENST00000415164 MSCO60682 206 aa23.34■■□□□ 1.33
UBXN4-202ENST00000415164 HMMRO75330 724 aa23.34■■□□□ 1.33
UBXN4-202ENST00000415164 ERCC3P19447 782 aa23.34■■□□□ 1.33
UBXN4-202ENST00000415164 SLFNL1Q499Z3 407 aa23.34■■□□□ 1.33
UBXN4-202ENST00000415164 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
UBXN4-202ENST00000415164 TMEM179Q6ZVK1 233 aa23.34■■□□□ 1.33
UBXN4-202ENST00000415164 NCAPG2Q86XI2 1143 aa23.34■■□□□ 1.33
UBXN4-202ENST00000415164 TRPV1Q8NER1 839 aa23.34■■□□□ 1.33
UBXN4-202ENST00000415164 LPAR1Q92633 364 aa23.34■■□□□ 1.33
UBXN4-202ENST00000415164 SPATC1LQ9H0A9 340 aa23.34■■□□□ 1.33
UBXN4-202ENST00000415164 BOLA2Q9H3K6 86 aa23.34■■□□□ 1.33
UBXN4-202ENST00000415164 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa23.34■■□□□ 1.33
UBXN4-202ENST00000415164 FLOT1O75955 427 aa23.33■■□□□ 1.33
UBXN4-202ENST00000415164 MBD4O95243 580 aa23.33■■□□□ 1.33
UBXN4-202ENST00000415164 HOXC6P09630 235 aa23.33■■□□□ 1.33
UBXN4-202ENST00000415164 ICA1Q05084 483 aa23.33■■□□□ 1.33
UBXN4-202ENST00000415164 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa23.33■■□□□ 1.33
UBXN4-202ENST00000415164 SWAP70Q9UH65 585 aa23.33■■□□□ 1.33
UBXN4-202ENST00000415164 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa23.33■■□□□ 1.33
UBXN4-202ENST00000415164 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa23.32■■□□□ 1.32
UBXN4-202ENST00000415164 RAD21O60216 631 aa23.32■■□□□ 1.32
UBXN4-202ENST00000415164 MS4A1P11836 297 aa23.32■■□□□ 1.32
UBXN4-202ENST00000415164 AKR1B1P15121 316 aa23.32■■□□□ 1.32
UBXN4-202ENST00000415164 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa23.32■■□□□ 1.32
UBXN4-202ENST00000415164 AMOTL1Q8IY63 956 aa23.32■■□□□ 1.32
UBXN4-202ENST00000415164 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP23.32■■□□□ 1.32
UBXN4-202ENST00000415164 PAG1Q9NWQ8 432 aa23.32■■□□□ 1.32
UBXN4-202ENST00000415164 COG6Q9Y2V7 657 aa23.32■■□□□ 1.32
UBXN4-202ENST00000415164 COL6A3P12111 3177 aa23.32■■□□□ 1.32
UBXN4-202ENST00000415164 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa23.31■■□□□ 1.32
UBXN4-202ENST00000415164 KBTBD13C9JR72 458 aa23.31■■□□□ 1.32
UBXN4-202ENST00000415164 DNM1LO00429 736 aa23.31■■□□□ 1.32
UBXN4-202ENST00000415164 CYBAP13498 195 aa23.31■■□□□ 1.32
UBXN4-202ENST00000415164 RTP1P59025 263 aa23.31■■□□□ 1.32
UBXN4-202ENST00000415164 GPR153Q6NV75 609 aa23.31■■□□□ 1.32
UBXN4-202ENST00000415164 ATG4CQ96DT6 458 aa23.31■■□□□ 1.32
UBXN4-202ENST00000415164 DSG3P32926 999 aa23.3■■□□□ 1.32
UBXN4-202ENST00000415164 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
UBXN4-202ENST00000415164 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP23.3■■□□□ 1.321e-6■■■□□ 15.4
UBXN4-202ENST00000415164 SH2D4AQ9H788 454 aa23.3■■□□□ 1.32
UBXN4-202ENST00000415164 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
UBXN4-202ENST00000415164 SLC5A4Q9NY91 659 aa23.3■■□□□ 1.32
UBXN4-202ENST00000415164 STRNO43815 780 aa23.29■■□□□ 1.32
UBXN4-202ENST00000415164 ADD2P35612 726 aa23.29■■□□□ 1.32
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UBXN4-202ENST00000415164 SMIM22K7EJ46 135 aa23.28■■□□□ 1.32
UBXN4-202ENST00000415164 COBLO75128 1261 aa23.28■■□□□ 1.32
UBXN4-202ENST00000415164 RAB11FIP3O75154 756 aa23.28■■□□□ 1.32
UBXN4-202ENST00000415164 OLFML2BQ68BL8 750 aa23.28■■□□□ 1.32
UBXN4-202ENST00000415164 MB21D1Q8N884 522 aa23.28■■□□□ 1.32
UBXN4-202ENST00000415164 SHCBP1Q8NEM2 672 aa23.28■■□□□ 1.32
UBXN4-202ENST00000415164 VCPKMTQ9H867 229 aa23.28■■□□□ 1.32
UBXN4-202ENST00000415164 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa23.28■■□□□ 1.32
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UBXN4-202ENST00000415164 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.28■■□□□ 1.32
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UBXN4-202ENST00000415164 CHGBP05060 677 aa23.27■■□□□ 1.32
UBXN4-202ENST00000415164 CDK8P49336 464 aa23.27■■□□□ 1.32
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UBXN4-202ENST00000415164 FAM161BQ96MY7 647 aa23.27■■□□□ 1.32
UBXN4-202ENST00000415164 MROH8Q9H579 483 aa23.27■■□□□ 1.32
UBXN4-202ENST00000415164 TMX2Q9Y320 296 aa23.27■■□□□ 1.32
UBXN4-202ENST00000415164 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa23.27■■□□□ 1.32
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UBXN4-202ENST00000415164 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa23.26■■□□□ 1.31
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UBXN4-202ENST00000415164 SEPT4O43236 478 aa23.25■■□□□ 1.31
UBXN4-202ENST00000415164 SIAH1Q8IUQ4 282 aa23.25■■□□□ 1.31
UBXN4-202ENST00000415164 STK11IPQ8N1F8 1099 aa23.25■■□□□ 1.31
UBXN4-202ENST00000415164 EEF2P13639 858 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
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UBXN4-202ENST00000415164 ADCYAP1R1P41586 468 aa23.24■■□□□ 1.31
UBXN4-202ENST00000415164 C12orf60Q5U649 245 aa23.24■■□□□ 1.31
UBXN4-202ENST00000415164 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa23.24■■□□□ 1.31
UBXN4-202ENST00000415164 MAML3Q96JK9 1138 aa23.24■■□□□ 1.31
UBXN4-202ENST00000415164 CCDC17Q96LX7 622 aa23.24■■□□□ 1.31
UBXN4-202ENST00000415164 MMP19Q99542 508 aa23.24■■□□□ 1.31
UBXN4-202ENST00000415164 HAUS7Q99871 368 aa23.24■■□□□ 1.31
UBXN4-202ENST00000415164 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa23.24■■□□□ 1.31
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