RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409025.5

USP39-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP39, Length 1,946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-202ENST00000409025 PIBF1Q8WXW3 757 aa21.8■■□□□ 1.08
USP39-202ENST00000409025 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
USP39-202ENST00000409025 CEP131Q9UPN4 1083 aa21.8■■□□□ 1.08
USP39-202ENST00000409025 MTMR7Q9Y216 660 aa21.8■■□□□ 1.08
USP39-202ENST00000409025 MRVI1Q9Y6F6 885 aa21.8■■□□□ 1.08
USP39-202ENST00000409025 CUTAO60888 179 aa21.8■■□□□ 1.08
USP39-202ENST00000409025 KCNA3P22001 575 aa21.8■■□□□ 1.08
USP39-202ENST00000409025 NLRP5P59047 1200 aa21.8■■□□□ 1.08
USP39-202ENST00000409025 YDJCA8MPS7 323 aa21.79■■□□□ 1.08
USP39-202ENST00000409025 IDI2Q9BXS1 227 aa21.79■■□□□ 1.08
USP39-202ENST00000409025 EHD4Q9H223 541 aa21.79■■□□□ 1.08
USP39-202ENST00000409025 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
USP39-202ENST00000409025 SH3GLB2Q9NR46 395 aa21.79■■□□□ 1.08
USP39-202ENST00000409025 KIF13BQ9NQT8 1826 aa21.79■■□□□ 1.08
USP39-202ENST00000409025 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
USP39-202ENST00000409025 AKR1B1P15121 316 aa21.78■■□□□ 1.08
USP39-202ENST00000409025 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
USP39-202ENST00000409025 PDLIM2Q96JY6 352 aa21.78■■□□□ 1.08
USP39-202ENST00000409025 MTMR4Q9NYA4 1195 aa21.78■■□□□ 1.08
USP39-202ENST00000409025 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
USP39-202ENST00000409025 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa21.78■■□□□ 1.08
USP39-202ENST00000409025 NPM3O75607 178 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
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USP39-202ENST00000409025 CALML3P27482 149 aa21.78■■□□□ 1.08
USP39-202ENST00000409025 FAM200AQ8TCP9 573 aa21.78■■□□□ 1.08
USP39-202ENST00000409025 SDF4Q9BRK5 362 aa21.78■■□□□ 1.08
USP39-202ENST00000409025 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa21.78■■□□□ 1.08
USP39-202ENST00000409025 PSME4Q14997 1843 aa21.77■■□□□ 1.08
USP39-202ENST00000409025 KLRF2D3W0D1 207 aa21.77■■□□□ 1.08
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USP39-202ENST00000409025 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
USP39-202ENST00000409025 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa21.76■■□□□ 1.07
USP39-202ENST00000409025 ZNF202O95125 648 aa21.76■■□□□ 1.07
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USP39-202ENST00000409025 CACNB3P54284 484 aa21.76■■□□□ 1.07
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USP39-202ENST00000409025 SOGA3Q5TF21 947 aa21.76■■□□□ 1.07
USP39-202ENST00000409025 SHC4Q6S5L8 630 aa21.76■■□□□ 1.07
USP39-202ENST00000409025 LARGE2Q8N3Y3 721 aa21.76■■□□□ 1.07
USP39-202ENST00000409025 TNFRSF25Q93038 417 aa21.76■■□□□ 1.07
USP39-202ENST00000409025 SPZ1Q9BXG8 430 aa21.76■■□□□ 1.07
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USP39-202ENST00000409025 TRIM75PA6NK02 468 aa21.76■■□□□ 1.07
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USP39-202ENST00000409025 TCP10Q12799 353 aa21.76■■□□□ 1.07
USP39-202ENST00000409025 RESP18Q5W5W9 173 aa21.76■■□□□ 1.07
USP39-202ENST00000409025 ZFPM1Q8IX07 1006 aa21.76■■□□□ 1.07
USP39-202ENST00000409025 FAM198AQ9UFP1 575 aa21.76■■□□□ 1.07
USP39-202ENST00000409025 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa21.75■■□□□ 1.07
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USP39-202ENST00000409025 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
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USP39-202ENST00000409025 HPSEQ9Y251 543 aa21.75■■□□□ 1.07
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USP39-202ENST00000409025 PTPREP23469 700 aa21.74■■□□□ 1.07
USP39-202ENST00000409025 SYKP43405 635 aa21.74■■□□□ 1.07
USP39-202ENST00000409025 SLC35G1Q2M3R5 365 aa21.74■■□□□ 1.07
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USP39-202ENST00000409025 USP17L2Q6R6M4 530 aa21.74■■□□□ 1.07
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USP39-202ENST00000409025 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP21.74■■□□□ 1.07
USP39-202ENST00000409025 TIGD1Q96MW7 591 aa21.74■■□□□ 1.07
USP39-202ENST00000409025 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
USP39-202ENST00000409025 PI4KBQ9UBF8 816 aa21.74■■□□□ 1.07
USP39-202ENST00000409025 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
USP39-202ENST00000409025 BMP15O95972 392 aa21.74■■□□□ 1.07
USP39-202ENST00000409025 POLD1P28340 1107 aa21.74■■□□□ 1.07
USP39-202ENST00000409025 STX1AQ16623 288 aa21.74■■□□□ 1.07
USP39-202ENST00000409025 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
USP39-202ENST00000409025 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
USP39-202ENST00000409025 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
USP39-202ENST00000409025 PIM2Q9P1W9 311 aa21.74■■□□□ 1.07
USP39-202ENST00000409025 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
USP39-202ENST00000409025 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
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USP39-202ENST00000409025 TRIM34Q9BYJ4 488 aa21.73■■□□□ 1.07
USP39-202ENST00000409025 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
USP39-202ENST00000409025 CLIP2Q9UDT6 1046 aa21.73■■□□□ 1.07
USP39-202ENST00000409025 PCDHA4Q9UN74 947 aa21.73■■□□□ 1.07
USP39-202ENST00000409025 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
USP39-202ENST00000409025 USP17L5A8MUK1 530 aa21.72■■□□□ 1.07
USP39-202ENST00000409025 WWC2Q6AWC2 1192 aa21.72■■□□□ 1.07
USP39-202ENST00000409025 GALNT17Q6IS24 598 aa21.72■■□□□ 1.07
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USP39-202ENST00000409025 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa21.72■■□□□ 1.07
USP39-202ENST00000409025 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
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USP39-202ENST00000409025 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
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USP39-202ENST00000409025 VIL1P09327 827 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
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