RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394765.7

UBXN6-202, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN6, Length 1,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-202ENST00000394765 USP17L2Q6R6M4 530 aa20.86■□□□□ 0.93
UBXN6-202ENST00000394765 NBPF11Q86T75 865 aa20.86■□□□□ 0.93
UBXN6-202ENST00000394765 KLRG1Q96E93 195 aa20.86■□□□□ 0.93
UBXN6-202ENST00000394765 ZNF341Q9BYN7 854 aa20.86■□□□□ 0.93
UBXN6-202ENST00000394765 SMC3Q9UQE7 1217 aa20.86■□□□□ 0.93
UBXN6-202ENST00000394765 FDPSP14324 419 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
UBXN6-202ENST00000394765 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa20.85■□□□□ 0.93
UBXN6-202ENST00000394765 CCDC178Q5BJE1 867 aa20.85■□□□□ 0.93
UBXN6-202ENST00000394765 DCAF15Q66K64 600 aa20.85■□□□□ 0.93
UBXN6-202ENST00000394765 CDC37L1Q7L3B6 337 aa20.85■□□□□ 0.93
UBXN6-202ENST00000394765 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
UBXN6-202ENST00000394765 DDAH1O94760 285 aa20.85■□□□□ 0.93
UBXN6-202ENST00000394765 DGKZQ13574 1117 aa20.85■□□□□ 0.93
UBXN6-202ENST00000394765 ZNF112Q9UJU3 913 aa20.85■□□□□ 0.93
UBXN6-202ENST00000394765 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
UBXN6-202ENST00000394765 NID2Q14112 1375 aa20.84■□□□□ 0.93
UBXN6-202ENST00000394765 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa20.84■□□□□ 0.93
UBXN6-202ENST00000394765 CPLX1O14810 134 aa20.84■□□□□ 0.93
UBXN6-202ENST00000394765 FOSBP53539 338 aa20.84■□□□□ 0.93
UBXN6-202ENST00000394765 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
UBXN6-202ENST00000394765 SLC35G1Q2M3R5 365 aa20.84■□□□□ 0.93
UBXN6-202ENST00000394765 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa20.84■□□□□ 0.93
UBXN6-202ENST00000394765 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa20.84■□□□□ 0.93
UBXN6-202ENST00000394765 NYAP2Q9P242 653 aa20.84■□□□□ 0.93
UBXN6-202ENST00000394765 MAD2L2Q9UI95 211 aa20.84■□□□□ 0.93
UBXN6-202ENST00000394765 AIFM3Q96NN9 605 aa20.83■□□□□ 0.93
UBXN6-202ENST00000394765 ZNF408Q9H9D4 720 aa20.83■□□□□ 0.93
UBXN6-202ENST00000394765 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 PDHBP11177 359 aa20.83■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 SPICE1Q8N0Z3 855 aa20.83■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP20.83■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 GJB4Q9NTQ9 266 aa20.83■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 ASNSP08243 561 aa20.82■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 GSE1Q14687 1217 aa20.82■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 GRM4Q14833 912 aa20.82■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 PIBF1Q8WXW3 757 aa20.82■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 MKL1Q969V6 931 aa20.82■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 FUT2Q10981 343 aa20.81■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 SCYL3Q8IZE3 742 aa20.81■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa20.81■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 CALM1P0DP23 149 aa20.81■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 CALM2P0DP24 149 aa20.81■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 CALM3P0DP25 149 aa20.81■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 RCAN1P53805 252 aa20.81■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 TMTC3Q6ZXV5 915 aa20.81■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 KCTD1Q719H9 257 aa20.81■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 LDHDQ86WU2 507 aa20.81■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 HOOK2Q96ED9 719 aa20.81■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 SLC26A6Q9BXS9 759 aa20.81■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 UBA5Q9GZZ9 404 aa20.81■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 F5H6K3 240 aa20.8■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 CYTH3O43739 400 aa20.8■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 KLRC3Q07444 240 aa20.8■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 VGLL4Q14135 290 aa20.8■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 TTBK2Q6IQ55 1244 aa20.8■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 CLMNQ96JQ2 1002 aa20.8■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 GPCPD1Q9NPB8 672 aa20.8■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 ZDHHC9Q9Y397 364 aa20.8■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 SNHG28P0DPA3 235 aa20.79■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 IFNAR1P17181 557 aa20.79■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 PTPRAP18433 802 aa20.79■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa20.79■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa20.79■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 NDUFB10O96000 172 aa20.78■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 SYT1P21579 422 aa20.78■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 SLFN13Q68D06 897 aa20.78■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 TMX2Q9Y320 296 aa20.78■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 KLRF2D3W0D1 207 aa20.78■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 SLC16A2P36021 539 aa20.78■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa20.78■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 ZHX2Q9Y6X8 837 aa20.78■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa20.77■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 MYH4Q9Y623 1939 aa20.77■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa20.77■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 MAP3K9P80192 1104 aa20.77■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 GUCY1B3Q02153 619 aa20.77■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 CCDC96Q2M329 555 aa20.77■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 V9GY48 417 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 ATAD5Q96QE3 1844 aa20.77■□□□□ 0.92
UBXN6-202ENST00000394765 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
UBXN6-202ENST00000394765 KIF5BP33176 963 aa20.76■□□□□ 0.91
UBXN6-202ENST00000394765 NF2P35240 595 aa20.76■□□□□ 0.91
UBXN6-202ENST00000394765 SLC1A4P43007 532 aa20.76■□□□□ 0.91
UBXN6-202ENST00000394765 ZNF543Q08ER8 600 aa20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms