RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393928.5

P3H4-202, Transcript of prolyl 3-hydroxylase family member 4 (non-enzymatic), humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene P3H4, Length 2,601 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H4-202ENST00000393928 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.16■■□□□ 1.14
P3H4-202ENST00000393928 COL4A5P29400 1685 aa22.16■■□□□ 1.14
P3H4-202ENST00000393928 SCG2P13521 617 aa22.15■■□□□ 1.14
P3H4-202ENST00000393928 SHMT1P34896 483 aa22.15■■□□□ 1.14
P3H4-202ENST00000393928 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
P3H4-202ENST00000393928 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa22.15■■□□□ 1.14
P3H4-202ENST00000393928 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.15■■□□□ 1.14
P3H4-202ENST00000393928 A0A087WWV3 80 aa22.15■■□□□ 1.14
P3H4-202ENST00000393928 XBP1P17861 261 aa22.15■■□□□ 1.14
P3H4-202ENST00000393928 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
P3H4-202ENST00000393928 NPY5RQ15761 445 aa22.15■■□□□ 1.14
P3H4-202ENST00000393928 CFAP100Q494V2 611 aa22.15■■□□□ 1.14
P3H4-202ENST00000393928 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa22.15■■□□□ 1.14
P3H4-202ENST00000393928 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
P3H4-202ENST00000393928 PSMD14O00487 310 aa22.14■■□□□ 1.14
P3H4-202ENST00000393928 CCDC178Q5BJE1 867 aa22.14■■□□□ 1.14
P3H4-202ENST00000393928 DNAJC18Q9H819 358 aa22.14■■□□□ 1.14
P3H4-202ENST00000393928 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
P3H4-202ENST00000393928 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 FAM160A1Q05DH4 1040 aa22.14■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 SERPINA10Q9UK55 444 aa22.14■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 SPECC1Q5M775 1068 aa22.13■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.13■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 USP17L5A8MUK1 530 aa22.13■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 KLRF2D3W0D1 207 aa22.13■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 WNT7AO00755 349 aa22.13■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 KRT2P35908 639 aa22.13■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 PSMD1Q99460 953 aa22.13■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 MRIQ9BWK5 157 aa22.13■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 VAT1LQ9HCJ6 419 aa22.13■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 PIM2Q9P1W9 311 aa22.13■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.13■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 HLA-DOAP06340 250 aa22.12■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 NLRP5P59047 1200 aa22.12■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 ATP2B2Q01814 1243 aa22.12■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 TYW1BQ6NUM6 668 aa22.12■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 TOP1P11387 765 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 GRIN1Q05586 938 aa22.12■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 TYRO3Q06418 890 aa22.12■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 UBA5Q9GZZ9 404 aa22.12■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 A0A1W2PQ27 194 aa22.11■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 A0A1W2PQ64 194 aa22.11■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 A0A1W2PQD8 194 aa22.11■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 KINO60870 393 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 CCDC192P0DO97 292 aa22.11■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 CLRN2A0PK11 232 aa22.11■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 NT5C2P49902 561 aa22.11■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 SHC4Q6S5L8 630 aa22.11■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 HOMER1Q86YM7 354 aa22.11■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 PFKFB1P16118 471 aa22.1■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 POLD1P28340 1107 aa22.1■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 RILPL1Q5EBL4 403 aa22.1■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 IDI2Q9BXS1 227 aa22.1■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 RASGRP4Q8TDF6 673 aa22.1■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 MTFR1LQ9H019 292 aa22.1■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.09■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 SWAP70Q9UH65 585 aa22.09■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 TCP10L2B9ZVM9 353 aa22.09■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 PPP6R2O75170 966 aa22.09■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 CCDC125Q86Z20 511 aa22.09■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 TNFRSF25Q93038 417 aa22.09■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 SDF4Q9BRK5 362 aa22.09■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 MYH8P13535 1937 aa22.08■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.08■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 CMA1P23946 247 aa22.08■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 NOVP48745 357 aa22.08■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 GNAQP50148 359 aa22.08■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 WWC2Q6AWC2 1192 aa22.08■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa22.08■■□□□ 1.13
P3H4-202ENST00000393928 ZNF202O95125 648 aa22.08■■□□□ 1.12
P3H4-202ENST00000393928 VIL1P09327 827 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
P3H4-202ENST00000393928 PDHBP11177 359 aa22.08■■□□□ 1.12
P3H4-202ENST00000393928 TGFB2P61812 414 aa22.08■■□□□ 1.12
P3H4-202ENST00000393928 ANO6Q4KMQ2 910 aa22.08■■□□□ 1.12
P3H4-202ENST00000393928 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
P3H4-202ENST00000393928 PI4KBQ9UBF8 816 aa22.08■■□□□ 1.12
P3H4-202ENST00000393928 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.07■■□□□ 1.12
P3H4-202ENST00000393928 GPCPD1Q9NPB8 672 aa22.07■■□□□ 1.12
P3H4-202ENST00000393928 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
P3H4-202ENST00000393928 RAD21O60216 631 aa22.07■■□□□ 1.12
P3H4-202ENST00000393928 ZNF174Q15697 407 aa22.07■■□□□ 1.12
P3H4-202ENST00000393928 GMLQ99445 158 aa22.07■■□□□ 1.12
P3H4-202ENST00000393928 BRMS1Q9HCU9 246 aa22.07■■□□□ 1.12
P3H4-202ENST00000393928 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
P3H4-202ENST00000393928 SHTN1A0MZ66 631 aa22.06■■□□□ 1.12
P3H4-202ENST00000393928 GDF11O95390 407 aa22.06■■□□□ 1.12
P3H4-202ENST00000393928 PLCB2Q00722 1185 aa22.06■■□□□ 1.12
P3H4-202ENST00000393928 NIM1KQ8IY84 436 aa22.06■■□□□ 1.12
P3H4-202ENST00000393928 JMYQ8N9B5 988 aa22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms