RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC30A9Q6PML9 568 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 L3MBTL2Q969R5 705 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 FERD3LQ96RJ6 166 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 INSRP06213 1382 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 FGAP02671 866 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 USP8P40818 1118 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 FCHSD1Q86WN1 690 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 HVCN1Q96D96 273 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 USP26Q9BXU7 913 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 PPCSQ9HAB8 311 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 NPHP1O15259 732 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 KIAA0754O94854 1291 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 NFKBIAP25963 317 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 ITSN1Q15811 1721 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 VIMP08670 466 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 PDGFRBP09619 1106 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 PCP11498 1178 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 HOXD12P35452 270 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 PSMD7P51665 324 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 CBLBQ13191 982 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 LAPTM5Q13571 262 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 MIGA1Q8NAN2 632 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM76AQ8TAV0 307 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 GORASP1Q9BQQ3 440 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 MTMR12Q9C0I1 747 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 PTPRHQ9HD43 1115 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 LZTS1Q9Y250 596 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 A6NCN8 305 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 CEP104O60308 925 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC4A1P02730 911 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 RAB3GAP1Q15042 981 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 ELF2Q15723 593 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 C16orf54Q6UWD8 224 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 HOMER3Q9NSC5 361 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 EFR3BQ9Y2G0 817 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 FESP07332 822 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 CNGA1P29973 690 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 PTPN14Q15678 1187 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 PCSK7Q16549 785 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 Q3C1V9 767 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 SIX5Q8N196 739 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 NPLOC4Q8TAT6 608 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 EID1Q9Y6B2 187 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF254O75437 659 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 PIK3C2GO75747 1445 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 GBE1Q04446 702 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 CBX3Q13185 183 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 PDE3BQ13370 1112 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 TAF11Q15544 211 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 BBS9Q3SYG4 887 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 KRT27Q7Z3Y8 459 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 MFN1Q8IWA4 741 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 MIPOL1Q8TD10 442 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 NEK1Q96PY6 1258 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 OCEL1Q9H607 264 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 NDUFAB1O14561 156 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 SCNN1DP51172 638 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 SMTNP53814 917 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 SNX16P57768 344 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF445P59923 1031 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 ALPK1Q96QP1 1244 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 TANGO6Q9C0B7 1094 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 ASAP1Q9ULH1 1129 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 CHMP3Q9Y3E7 222 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 IVLP07476 585 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 RPL17P18621 184 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 NEK2P51955 445 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 OXCT1P55809 520 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 TPM4P67936 248 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC121Q6ZUS5 278 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC150Q8NCX0 1101 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 PREBQ9HCU5 417 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 190.6 ms