RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358071.8

RAD9B-201, Transcript of RAD9 checkpoint clamp component B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAD9B, Length 2,843 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9B-201ENST00000358071 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 SLC30A10Q6XR72 485 aa8.33□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 TMTC3Q6ZXV5 915 aa8.33□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa8.33□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 CLSTN2Q9H4D0 955 aa8.33□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 STK32BQ9NY57 414 aa8.33□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 RTEL1Q9NZ71 1219 aa8.33□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 CLIP2Q9UDT6 1046 aa8.33□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 COL4A5P29400 1685 aa8.33□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 ESPNB1AK53 854 aa8.33□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 KINO60870 393 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 AFMP43652 599 aa8.33□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 CRKP46108 304 aa8.33□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 ZNF165P49910 485 aa8.33□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 LRMPQ12912 555 aa8.33□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa8.33□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 TMEM260Q9NX78 707 aa8.33□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 SNED1Q8TER0 1413 aa8.32□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 VWA3AA6NCI4 1184 aa8.32□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 DEXIO95424 95 aa8.32□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 CCDC192P0DO97 292 aa8.32□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 KCNA3P22001 575 aa8.32□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 ALDH1B1P30837 517 aa8.32□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 NLRP5P59047 1200 aa8.32□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 GOLGA8FQ08AF8 430 aa8.32□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa8.32□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 PIGSQ96S52 555 aa8.32□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 CSRNP2Q9H175 543 aa8.32□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 CDKL5O76039 1030 aa8.32□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 WWC2Q6AWC2 1192 aa8.32□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 ADALQ6DHV7 355 aa8.32□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 SASS6Q6UVJ0 657 aa8.32□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 KIF3AQ9Y496 699 aa8.32□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 KLRF2D3W0D1 207 aa8.31□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 FGRP09769 529 aa8.31□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 FAM160A1Q05DH4 1040 aa8.31□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 SLC39A14Q15043 492 aa8.31□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 IL17AQ16552 155 aa8.31□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 INF2Q27J81 1249 aa8.31□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 AOPEPQ8N6M6 819 aa8.31□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 COA1Q9GZY4 146 aa8.31□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 VEZTQ9HBM0 779 aa8.31□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 POLR3EQ9NVU0 708 aa8.31□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 FAM198AQ9UFP1 575 aa8.31□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa8.31□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 TIAM2Q8IVF5 1701 aa8.31□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 ATP1A3P13637 1013 aa8.31□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 BMP6P22004 513 aa8.31□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 DACT2Q5SW24 774 aa8.31□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa8.31□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 BLZF1Q9H2G9 400 aa8.31□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 WDR19Q8NEZ3 1342 aa8.31□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 LTBP1Q14766 1721 aa8.31□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 NAV1Q8NEY1 1877 aa8.3□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 PSMD14O00487 310 aa8.3□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 ORC4O43929 436 aa8.3□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 SYKP43405 635 aa8.3□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 PPP4CP60510 307 aa8.3□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 CCDC173Q0VFZ6 552 aa8.3□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 PTGDRQ13258 359 aa8.3□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa8.3□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 C7orf43Q8WVR3 580 aa8.3□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 DHX58Q96C10 678 aa8.3□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 PHF20Q9BVI0 1012 aa8.3□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 SERTAD1Q9UHV2 236 aa8.3□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 SCG2P13521 617 aa8.3□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 ERCC3P19447 782 aa8.3□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 SHMT1P34896 483 aa8.3□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 ECE1P42892 770 aa8.3□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 SEPT2Q15019 361 aa8.3□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 UBE2SQ16763 222 aa8.3□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 NBPF9Q3BBW0 867 aa8.3□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 SBK1Q52WX2 424 aa8.3□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 LARGE2Q8N3Y3 721 aa8.3□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 TEKT1Q969V4 418 aa8.3□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 PPP1R9BQ96SB3 815 aa8.3□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 TMEM39BQ9GZU3 492 aa8.3□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 TMEM60Q9H2L4 133 aa8.3□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 NRXN2Q9P2S2 1712 aa8.3□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RAD9B-201ENST00000358071 PTGS1P23219 599 aa8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms