RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 VCPKMTQ9H867 229 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF287Q9HBT7 754 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLIN4Q96Q06 1357 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
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PTPRCAP-201ENST00000326294 ERVK-9P63128 1117 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERVK-24P63145 666 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP2B2Q01814 1243 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALX1Q15699 326 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 TTC22Q5TAA0 569 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAET1EQ8TD07 263 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 LPAR1Q92633 364 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 PAGR1Q9BTK6 254 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 CNMDO75829 334 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 FLT3LGP49771 235 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDE4BQ07343 736 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 LBX2Q6XYB7 198 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPICE1Q8N0Z3 855 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 COA7Q96BR5 231 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP23.28■■□□□ 1.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZMYM6O95789 1325 aa23.28■■□□□ 1.32
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PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 CTDSPL2Q05D32 466 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q3C1V9 767 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 NBPF11Q86T75 865 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 TANGO6Q9C0B7 1094 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa23.27■■□□□ 1.32
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PTPRCAP-201ENST00000326294 GRK4P32298 578 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 PORCNQ9H237 461 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 NYAP2Q9P242 653 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANAPC4Q9UJX5 808 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 TACC3Q9Y6A5 838 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 HIP1O00291 1037 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 FGAP02671 866 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 IRF5Q13568 498 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 NEDD1Q8NHV4 660 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 CEP95Q96GE4 821 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 GOPCQ9HD26 462 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 BTBD7Q9P203 1132 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 BRCA2P51587 3418 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 POTEFA5A3E0 1075 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 COG2Q14746 738 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM47AQ5JRC9 791 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLAIN1Q8ND83 568 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 INCENPQ9NQS7 918 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 GJD2Q9UKL4 321 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADCY3O60266 1144 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSPY3P0CV98 308 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSPY8P0CW00 308 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
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PTPRCAP-201ENST00000326294 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 FLOT1O75955 427 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYCP01106 439 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 ELNP15502 786 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAPK4P31152 587 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 DSG3P32926 999 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 TFAP4Q01664 338 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 HOXC10Q9NYD6 342 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 ORC4O43929 436 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 FGRP09769 529 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 MTFR1Q15390 333 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM83BQ5T0W9 1011 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR142Q7Z601 462 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 PXYLP1Q8TE99 480 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATG4CQ96DT6 458 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 NBPF3Q9H094 633 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL25Q9H293 177 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLIP2Q9UDT6 1046 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAD21O60216 631 aa23.2■■□□□ 1.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 TTLL1O95922 423 aa23.2■■□□□ 1.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 NDUFB10O96000 172 aa23.2■■□□□ 1.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 HAND2P61296 217 aa23.2■■□□□ 1.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCNA1P78396 465 aa23.2■■□□□ 1.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 MKL1Q969V6 931 aa23.2■■□□□ 1.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM106CQ9BVX2 250 aa23.2■■□□□ 1.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBXO28Q9NVF7 368 aa23.2■■□□□ 1.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 F5H6K3 240 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLRC3Q07444 240 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLEKHH3Q7Z736 793 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBC1D10CQ8IV04 446 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 SOCS4Q8WXH5 440 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF236Q9UL36 1845 aa23.18■■□□□ 1.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSPY2A6NKD2 308 aa23.18■■□□□ 1.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 INHAP05111 366 aa23.18■■□□□ 1.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBXN2AP68543 259 aa23.18■■□□□ 1.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
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