RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 BRMS1Q9HCU9 246 aa30.88■■■□□ 2.53
HOXD8-201ENST00000313173 SERPINB13Q9UIV8 391 aa30.88■■■□□ 2.53
HOXD8-201ENST00000313173 A0A1B0GVL5 298 aa30.87■■■□□ 2.53
HOXD8-201ENST00000313173 STAG2Q8N3U4 1231 aa30.87■■■□□ 2.53
HOXD8-201ENST00000313173 CEP95Q96GE4 821 aa30.87■■■□□ 2.53
HOXD8-201ENST00000313173 SERPINA10Q9UK55 444 aa30.87■■■□□ 2.53
HOXD8-201ENST00000313173 TOP1P11387 765 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
HOXD8-201ENST00000313173 NDUFA8P51970 172 aa30.86■■■□□ 2.53
HOXD8-201ENST00000313173 PDLIM2Q96JY6 352 aa30.86■■■□□ 2.53
HOXD8-201ENST00000313173 MRVI1Q9Y6F6 885 aa30.86■■■□□ 2.53
HOXD8-201ENST00000313173 HLA-DOAP06340 250 aa30.86■■■□□ 2.53
HOXD8-201ENST00000313173 NFIAQ12857 509 aa30.86■■■□□ 2.53
HOXD8-201ENST00000313173 PSMD1Q99460 953 aa30.86■■■□□ 2.53
HOXD8-201ENST00000313173 LZTS2Q9BRK4 669 aa30.86■■■□□ 2.53
HOXD8-201ENST00000313173 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP30.85■■■□□ 2.53
HOXD8-201ENST00000313173 YDJCA8MPS7 323 aa30.85■■■□□ 2.53
HOXD8-201ENST00000313173 NPY5RQ15761 445 aa30.85■■■□□ 2.53
HOXD8-201ENST00000313173 SASS6Q6UVJ0 657 aa30.85■■■□□ 2.53
HOXD8-201ENST00000313173 PIM2Q9P1W9 311 aa30.85■■■□□ 2.53
HOXD8-201ENST00000313173 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
HOXD8-201ENST00000313173 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP30.84■■■□□ 2.53
HOXD8-201ENST00000313173 IDI2Q9BXS1 227 aa30.84■■■□□ 2.53
HOXD8-201ENST00000313173 EHD4Q9H223 541 aa30.84■■■□□ 2.53
HOXD8-201ENST00000313173 CABP5Q9NP86 173 aa30.84■■■□□ 2.53
HOXD8-201ENST00000313173 CUTAO60888 179 aa30.83■■■□□ 2.53
HOXD8-201ENST00000313173 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa30.83■■■□□ 2.53
HOXD8-201ENST00000313173 TNFRSF25Q93038 417 aa30.83■■■□□ 2.53
HOXD8-201ENST00000313173 SH3GLB2Q9NR46 395 aa30.83■■■□□ 2.53
HOXD8-201ENST00000313173 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa30.82■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 NPM3O75607 178 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 AKR1B1P15121 316 aa30.82■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 PFKFB1P16118 471 aa30.82■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 FAM200AQ8TCP9 573 aa30.82■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 MTMR4Q9NYA4 1195 aa30.82■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 CEP131Q9UPN4 1083 aa30.82■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa30.81■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 SHMT1P34896 483 aa30.81■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 PIBF1Q8WXW3 757 aa30.81■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 CD2APQ9Y5K6 639 aa30.81■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 SLC35G1Q2M3R5 365 aa30.81■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 MTMR7Q9Y216 660 aa30.81■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa30.81■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 SIPA1L1O43166 1804 aa30.8■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 NLRP5P59047 1200 aa30.8■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 RESP18Q5W5W9 173 aa30.8■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 SHC4Q6S5L8 630 aa30.8■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 SPZ1Q9BXG8 430 aa30.8■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 HPSEQ9Y251 543 aa30.8■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP30.79■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 CALML3P27482 149 aa30.79■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 ANO6Q4KMQ2 910 aa30.79■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 ZFPM1Q8IX07 1006 aa30.79■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 FAM198AQ9UFP1 575 aa30.79■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP30.79■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 FAM205CA6NFA0 338 aa30.79■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 KLRF2D3W0D1 207 aa30.79■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 CYTH3O43739 400 aa30.79■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP30.79■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF202O95125 648 aa30.78■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 CACNB3P54284 484 aa30.78■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 TRIM75PA6NK02 468 aa30.77■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 PTPREP23469 700 aa30.77■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 SMARCA1P28370 1054 aa30.77■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 CLIC6Q96NY7 704 aa30.77■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 SDF4Q9BRK5 362 aa30.77■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 VPS33BQ9H267 617 aa30.77■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 CAVIN2O95810 425 aa30.77■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 GOLGA8HP0CJ92 632 aa30.77■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 SOGA3Q5TF21 947 aa30.77■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 RASGRP2Q7LDG7 609 aa30.77■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 TIGD1Q96MW7 591 aa30.77■■■□□ 2.52
HOXD8-201ENST00000313173 CFAP100Q494V2 611 aa30.76■■■□□ 2.51
HOXD8-201ENST00000313173 LARGE2Q8N3Y3 721 aa30.76■■■□□ 2.51
HOXD8-201ENST00000313173 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP30.76■■■□□ 2.51
HOXD8-201ENST00000313173 SYKP43405 635 aa30.75■■■□□ 2.51
HOXD8-201ENST00000313173 TCP10Q12799 353 aa30.75■■■□□ 2.51
HOXD8-201ENST00000313173 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
HOXD8-201ENST00000313173 USP17L2Q6R6M4 530 aa30.75■■■□□ 2.51
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC17Q96LX7 622 aa30.75■■■□□ 2.51
HOXD8-201ENST00000313173 COL4A5P29400 1685 aa30.75■■■□□ 2.51
HOXD8-201ENST00000313173 TTLL1O95922 423 aa30.75■■■□□ 2.51
HOXD8-201ENST00000313173 BMP15O95972 392 aa30.75■■■□□ 2.51
HOXD8-201ENST00000313173 ATP2B1P20020 1258 aa30.75■■■□□ 2.51
HOXD8-201ENST00000313173 STX1AQ16623 288 aa30.75■■■□□ 2.51
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC148Q8NFR7 591 aa30.75■■■□□ 2.51
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
HOXD8-201ENST00000313173 PI4KBQ9UBF8 816 aa30.75■■■□□ 2.51
HOXD8-201ENST00000313173 WWC2Q6AWC2 1192 aa30.74■■■□□ 2.51
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
HOXD8-201ENST00000313173 DNAJC18Q9H819 358 aa30.74■■■□□ 2.51
HOXD8-201ENST00000313173 SPON1Q9HCB6 807 aa30.74■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms