RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294964.5

PKDCC-201, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKDCC, Length 2,502 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-201ENST00000294964 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
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PKDCC-201ENST00000294964 CTAGE9A4FU28 777 aa27.85■■■□□ 2.05
PKDCC-201ENST00000294964 MBD4O95243 580 aa27.85■■■□□ 2.05
PKDCC-201ENST00000294964 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP27.85■■■□□ 2.05
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PKDCC-201ENST00000294964 SHC4Q6S5L8 630 aa27.84■■■□□ 2.05
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PKDCC-201ENST00000294964 TUBB2BQ9BVA1 445 aa27.84■■■□□ 2.05
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PKDCC-201ENST00000294964 KRT40Q6A162 431 aa27.82■■■□□ 2.04
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PKDCC-201ENST00000294964 ZSWIM5Q9P217 1185 aa27.82■■■□□ 2.04
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PKDCC-201ENST00000294964 TMEM67Q5HYA8 995 aa27.82■■■□□ 2.04
PKDCC-201ENST00000294964 VPS37DQ86XT2 251 aa27.82■■■□□ 2.04
PKDCC-201ENST00000294964 LPIN2Q92539 896 aa27.82■■■□□ 2.04
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PKDCC-201ENST00000294964 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
PKDCC-201ENST00000294964 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP27.81■■■□□ 2.04
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PKDCC-201ENST00000294964 ZNF34Q8IZ26 560 aa27.81■■■□□ 2.04
PKDCC-201ENST00000294964 IFNL3Q8IZI9 196 aa27.81■■■□□ 2.04
PKDCC-201ENST00000294964 TAF1LQ8IZX4 1826 aa27.81■■■□□ 2.04
PKDCC-201ENST00000294964 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa27.81■■■□□ 2.04
PKDCC-201ENST00000294964 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
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PKDCC-201ENST00000294964 C4BP0C0L5 1744 aa27.78■■■□□ 2.04
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PKDCC-201ENST00000294964 CPLX3Q8WVH0 158 aa27.77■■■□□ 2.04
PKDCC-201ENST00000294964 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
PKDCC-201ENST00000294964 EBAG9O00559 213 aa27.76■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 SLC5A1P13866 664 aa27.76■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 IARSP41252 1262 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 NTRK3Q16288 839 aa27.76■■■□□ 2.03
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