RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262498.7

CFAP20-201, Transcript of cilia and flagella associated protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CFAP20, Length 1,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP20-201ENST00000262498 TRANK1O15050 2925 aa14.62□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 USP17L15C9J2P7 530 aa14.62□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 USP17L13C9JLJ4 530 aa14.62□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 KBTBD13C9JR72 458 aa14.62□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 USP17L11C9JVI0 530 aa14.62□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 USP17L18D6R9N7 530 aa14.62□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 USP17L22D6RA61 530 aa14.62□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 USP17L17D6RBQ6 530 aa14.62□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 USP17L19D6RCP7 530 aa14.62□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 USP17L20D6RJB6 530 aa14.62□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 SEPT4O43236 478 aa14.62□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 MCAMP43121 646 aa14.62□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 CCNA1P78396 465 aa14.62□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 USP17L24Q0WX57 530 aa14.62□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 TFCP2Q12800 502 aa14.62□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 OLFML2BQ68BL8 750 aa14.62□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa14.62□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa14.62□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 FERMT2Q96AC1 680 aa14.62□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 ASB2Q96Q27 587 aa14.62□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 C1orf115Q9H7X2 142 aa14.62□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 KIAA0355O15063 1070 aa14.61□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 COBLO75128 1261 aa14.61□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 GH2P01242 217 aa14.61□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 VCAM1P19320 739 aa14.61□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 PPP4CP60510 307 aa14.61□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 MAP3K12Q12852 859 aa14.61□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 FAM47AQ5JRC9 791 aa14.61□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa14.61□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 WDR78Q5VTH9 848 aa14.61□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa14.61□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 FAM122AQ96E09 287 aa14.61□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 RAI14Q9P0K7 980 aa14.61□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 PIEZO1Q92508 2521 aa14.61□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 ADORA2AP29274 412 aa14.6□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 TATDN1Q6P1N9 297 aa14.6□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 CEP85Q6P2H3 762 aa14.6□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 PHF24Q9UPV7 400 aa14.6□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 TACC3Q9Y6A5 838 aa14.6□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa14.6□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 CLTBP09497 229 aa14.6□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 ADGRE1Q14246 886 aa14.6□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 ACER1Q8TDN7 264 aa14.6□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa14.6□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 PBX2P40425 430 aa14.59□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 NUCB1Q02818 461 aa14.59□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 AKNAD1Q5T1N1 836 aa14.59□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 C16orf59Q7L2K0 433 aa14.59□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 TIFAQ96CG3 184 aa14.59□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 THEGQ9P2T0 379 aa14.59□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 AKAP2Q9Y2D5 859 aa14.59□□□□□ -0.07
CFAP20-201ENST00000262498 FPGSQ05932 587 aa14.58□□□□□ -0.08
CFAP20-201ENST00000262498 FAAP100Q0VG06 881 aa14.58□□□□□ -0.08
CFAP20-201ENST00000262498 RASIP1Q5U651 963 aa14.58□□□□□ -0.08
CFAP20-201ENST00000262498 DPP9Q86TI2 863 aa14.58□□□□□ -0.08
CFAP20-201ENST00000262498 PPM1EQ8WY54 764 aa14.58□□□□□ -0.08
CFAP20-201ENST00000262498 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CFAP20-201ENST00000262498 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.089e-7■□□□□ 8.8
CFAP20-201ENST00000262498 PBX4Q9BYU1 374 aa14.58□□□□□ -0.08
CFAP20-201ENST00000262498 PRDM12Q9H4Q4 367 aa14.58□□□□□ -0.08
CFAP20-201ENST00000262498 MUC6Q6W4X9 2439 aa14.57□□□□□ -0.08
CFAP20-201ENST00000262498 GRXCR1A8MXD5 290 aa14.57□□□□□ -0.08
CFAP20-201ENST00000262498 STRNO43815 780 aa14.57□□□□□ -0.08
CFAP20-201ENST00000262498 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CFAP20-201ENST00000262498 RAG1P15918 1043 aa14.57□□□□□ -0.08
CFAP20-201ENST00000262498 GUCY1A2P33402 732 aa14.57□□□□□ -0.08
CFAP20-201ENST00000262498 CHD1LQ86WJ1 897 aa14.57□□□□□ -0.08
CFAP20-201ENST00000262498 NEUROD6Q96NK8 337 aa14.57□□□□□ -0.08
CFAP20-201ENST00000262498 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CFAP20-201ENST00000262498 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CFAP20-201ENST00000262498 DCTPP1Q9H773 170 aa14.57□□□□□ -0.08
CFAP20-201ENST00000262498 LRP2BPQ9P2M1 347 aa14.57□□□□□ -0.08
CFAP20-201ENST00000262498 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa14.56□□□□□ -0.08
CFAP20-201ENST00000262498 PLCG2P16885 1265 aa14.56□□□□□ -0.08
CFAP20-201ENST00000262498 ERCC3P19447 782 aa14.56□□□□□ -0.08
CFAP20-201ENST00000262498 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CFAP20-201ENST00000262498 ATP8B2P98198 1209 aa14.56□□□□□ -0.08
CFAP20-201ENST00000262498 MTX1Q13505 466 aa14.56□□□□□ -0.08
CFAP20-201ENST00000262498 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CFAP20-201ENST00000262498 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa14.56□□□□□ -0.08
CFAP20-201ENST00000262498 SIRT2Q8IXJ6 389 aa14.56□□□□□ -0.08
CFAP20-201ENST00000262498 MAML3Q96JK9 1138 aa14.56□□□□□ -0.08
CFAP20-201ENST00000262498 FEZ1Q99689 392 aa14.56□□□□□ -0.08
CFAP20-201ENST00000262498 SPATC1LQ9H0A9 340 aa14.56□□□□□ -0.08
CFAP20-201ENST00000262498 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CFAP20-201ENST00000262498 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CFAP20-201ENST00000262498 A0A1W2PQY0 241 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms