RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253754.7

PDLIM4-201, Transcript of PDZ and LIM domain 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDLIM4, Length 2,282 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM4-201ENST00000253754 CSRNP2Q9H175 543 aa21.44■■□□□ 1.02
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PDLIM4-201ENST00000253754 CALM2P0DP24 149 aa21.43■■□□□ 1.02
PDLIM4-201ENST00000253754 CALM3P0DP25 149 aa21.43■■□□□ 1.02
PDLIM4-201ENST00000253754 XBP1P17861 261 aa21.43■■□□□ 1.02
PDLIM4-201ENST00000253754 BMP6P22004 513 aa21.43■■□□□ 1.02
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PDLIM4-201ENST00000253754 PDE4BQ07343 736 aa21.43■■□□□ 1.02
PDLIM4-201ENST00000253754 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
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PDLIM4-201ENST00000253754 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
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PDLIM4-201ENST00000253754 DLEC1Q9Y238 1755 aa21.42■■□□□ 1.02
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PDLIM4-201ENST00000253754 C12orf60Q5U649 245 aa21.41■■□□□ 1.02
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PDLIM4-201ENST00000253754 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
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PDLIM4-201ENST00000253754 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa21.4■■□□□ 1.02
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PDLIM4-201ENST00000253754 CEP131Q9UPN4 1083 aa21.4■■□□□ 1.02
PDLIM4-201ENST00000253754 DYNC1I1O14576 645 aa21.4■■□□□ 1.02
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PDLIM4-201ENST00000253754 POSTNQ15063 836 aa21.4■■□□□ 1.02
PDLIM4-201ENST00000253754 TMC6Q7Z403 805 aa21.4■■□□□ 1.02
PDLIM4-201ENST00000253754 SLC16A10Q8TF71 515 aa21.4■■□□□ 1.02
PDLIM4-201ENST00000253754 CNKSR1Q969H4 720 aa21.4■■□□□ 1.02
PDLIM4-201ENST00000253754 TPM4P67936 248 aa21.39■■□□□ 1.02
PDLIM4-201ENST00000253754 FANCCQ00597 558 aa21.39■■□□□ 1.02
PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF174Q15697 407 aa21.39■■□□□ 1.02
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PDLIM4-201ENST00000253754 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
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PDLIM4-201ENST00000253754 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
PDLIM4-201ENST00000253754 MAN1B1Q9UKM7 699 aa21.39■■□□□ 1.01
PDLIM4-201ENST00000253754 GTF2IP78347 998 aa21.38■■□□□ 1.01
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PDLIM4-201ENST00000253754 NLRP5P59047 1200 aa21.35■■□□□ 1.01
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PDLIM4-201ENST00000253754 TTC38Q5R3I4 469 aa21.35■■□□□ 1.01
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PDLIM4-201ENST00000253754 BAG3O95817 575 aa21.35■■□□□ 1.01
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