RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246139.9

CITED1-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED1, Length 1,231 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-201ENST00000246139 EVI5LQ96CN4 794 aa25.02■■□□□ 1.6
CITED1-201ENST00000246139 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa25.02■■□□□ 1.6
CITED1-201ENST00000246139 GJD2Q9UKL4 321 aa25.02■■□□□ 1.6
CITED1-201ENST00000246139 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CITED1-201ENST00000246139 MINDY4BA8MYZ0 360 aa25.01■■□□□ 1.59
CITED1-201ENST00000246139 MAPK4P31152 587 aa25.01■■□□□ 1.59
CITED1-201ENST00000246139 TDO2P48775 406 aa25.01■■□□□ 1.59
CITED1-201ENST00000246139 CHD1LQ86WJ1 897 aa25.01■■□□□ 1.59
CITED1-201ENST00000246139 STK11IPQ8N1F8 1099 aa25.01■■□□□ 1.59
CITED1-201ENST00000246139 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CITED1-201ENST00000246139 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa25.01■■□□□ 1.59
CITED1-201ENST00000246139 SGPL1O95470 568 aa25■■□□□ 1.59
CITED1-201ENST00000246139 CYP2B6P20813 491 aa25■■□□□ 1.59
CITED1-201ENST00000246139 ATP2B2Q01814 1243 aa25■■□□□ 1.59
CITED1-201ENST00000246139 NUCB1Q02818 461 aa25■■□□□ 1.59
CITED1-201ENST00000246139 ICA1Q05084 483 aa25■■□□□ 1.59
CITED1-201ENST00000246139 NUDT12Q9BQG2 462 aa25■■□□□ 1.59
CITED1-201ENST00000246139 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
CITED1-201ENST00000246139 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
CITED1-201ENST00000246139 CCNA1P78396 465 aa24.99■■□□□ 1.59
CITED1-201ENST00000246139 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
CITED1-201ENST00000246139 POTEEQ6S8J3 1075 aa24.99■■□□□ 1.59
CITED1-201ENST00000246139 CLEC10AQ8IUN9 316 aa24.99■■□□□ 1.59
CITED1-201ENST00000246139 IFNL3Q8IZI9 196 aa24.99■■□□□ 1.59
CITED1-201ENST00000246139 NACAP1Q9BZK3 213 aa24.99■■□□□ 1.59
CITED1-201ENST00000246139 TANGO6Q9C0B7 1094 aa24.99■■□□□ 1.59
CITED1-201ENST00000246139 PORCNQ9H237 461 aa24.99■■□□□ 1.59
CITED1-201ENST00000246139 SH2D4AQ9H788 454 aa24.99■■□□□ 1.59
CITED1-201ENST00000246139 MKNK2Q9HBH9 465 aa24.99■■□□□ 1.59
CITED1-201ENST00000246139 WDR78Q5VTH9 848 aa24.98■■□□□ 1.59
CITED1-201ENST00000246139 SIAH1Q8IUQ4 282 aa24.98■■□□□ 1.59
CITED1-201ENST00000246139 COG2Q14746 738 aa24.97■■□□□ 1.59
CITED1-201ENST00000246139 GPR142Q7Z601 462 aa24.97■■□□□ 1.59
CITED1-201ENST00000246139 PLEKHH3Q7Z736 793 aa24.97■■□□□ 1.59
CITED1-201ENST00000246139 SPICE1Q8N0Z3 855 aa24.97■■□□□ 1.59
CITED1-201ENST00000246139 SOCS4Q8WXH5 440 aa24.97■■□□□ 1.59
CITED1-201ENST00000246139 DEFB118Q96PH6 123 aa24.97■■□□□ 1.59
CITED1-201ENST00000246139 KANSL2Q9H9L4 492 aa24.97■■□□□ 1.59
CITED1-201ENST00000246139 HOXC10Q9NYD6 342 aa24.97■■□□□ 1.59
CITED1-201ENST00000246139 ALPK3Q96L96 1907 aa24.96■■□□□ 1.59
CITED1-201ENST00000246139 PLXNB2O15031 1838 aa24.96■■□□□ 1.59
CITED1-201ENST00000246139 CNMDO75829 334 aa24.96■■□□□ 1.59
CITED1-201ENST00000246139 TFRCP02786 760 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
CITED1-201ENST00000246139 HMGCRP04035 888 aa24.96■■□□□ 1.59
CITED1-201ENST00000246139 HTATIP2Q9BUP3 242 aa24.96■■□□□ 1.59
CITED1-201ENST00000246139 PRO3102Q9H379 93 aa24.96■■□□□ 1.59
CITED1-201ENST00000246139 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
CITED1-201ENST00000246139 TMX2Q9Y320 296 aa24.96■■□□□ 1.59
CITED1-201ENST00000246139 ROBO3Q96MS0 1386 aa24.95■■□□□ 1.59
CITED1-201ENST00000246139 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa24.95■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 EEF2P13639 858 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa24.95■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa24.95■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 LPAR1Q92633 364 aa24.95■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 BTBD7Q9P203 1132 aa24.95■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 LAMA3Q16787 3333 aa24.94■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 RAD21O60216 631 aa24.94■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 RASA1P20936 1047 aa24.94■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa24.94■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 LBX2Q6XYB7 198 aa24.94■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 RILPL2Q969X0 211 aa24.94■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa24.94■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 NAPBQ9H115 298 aa24.94■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 VCPKMTQ9H867 229 aa24.94■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 RGS2P41220 211 aa24.93■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 TRIM32Q13049 653 aa24.93■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP24.93■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 OSBPL3Q9H4L5 887 aa24.93■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 ZNF287Q9HBT7 754 aa24.93■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 HELLSQ9NRZ9 838 aa24.93■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 FLOT1O75955 427 aa24.92■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 TICAM2Q86XR7 235 aa24.92■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 TRIB2Q92519 343 aa24.92■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP24.92■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa24.92■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 MYH8P13535 1937 aa24.92■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 PRDM1O75626 825 aa24.91■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 MORN1Q5T089 497 aa24.91■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 FAM227BQ96M60 508 aa24.91■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 GOPCQ9HD26 462 aa24.91■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 RPTORQ8N122 1335 aa24.9■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 WDR46O15213 610 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 DSG3P32926 999 aa24.9■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 PLS1Q14651 629 aa24.9■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa24.9■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 A0A0D9SFI3 127 aa24.89■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 FOXP2O15409 715 aa24.89■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 PDE4BQ07343 736 aa24.89■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 PPARAQ07869 468 aa24.89■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 MAP2K5Q13163 448 aa24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms