RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000099223.10

Snx16-202, Transcript of Sorting nexin-16, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Snx16, Length 2,512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16-202ENSMUST00000099223 Sgpp1Q9JI99 430 aa20.49■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 MetP16056 1379 aa20.49■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Krt24A1L317 512 aa20.49■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Frmd7A2AD83 703 aa20.49■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Wee1P47810 646 aa20.49■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Cct6aP80317 531 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 BcrQ6PAJ1 1270 aa20.49■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Papd7Q6PB75 542 aa20.49■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Lrsam1Q80ZI6 727 aa20.49■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Fam177a1Q8BR63 207 aa20.49■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Washc1Q8VDD8 475 aa20.49■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Apobec3Q99J72 440 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Tnni2P13412 182 aa20.48■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Meis3P97368 378 aa20.48■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Setdb2Q8C267 713 aa20.48■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Spice1Q8C804 860 aa20.48■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Klhl10Q9D5V2 608 aa20.48■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 MycbpQ9EQS3 103 aa20.48■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Irx5Q9JKQ4 484 aa20.48■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Tob2Q9JM55 345 aa20.48■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Mkrn1Q9QXP6 481 aa20.48■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Trim55G3X8Y1 545 aa20.48■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Slc4a4O88343 1079 aa20.48■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Igbp1Q61249 340 aa20.48■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Sema4bQ62179 823 aa20.48■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Trim6Q8BGE7 488 aa20.48■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Osbpl1aQ91XL9 950 aa20.48■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Ndufb9Q9CQJ8 179 aa20.48■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Pold4Q9CWP8 107 aa20.48■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Igsf9bE9PZ19 1328 aa20.48■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Ecm29Q6PDI5 1840 aa20.47■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Scgb2b11A0A087WR49 112 aa20.47■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Slc12a2P55012 1205 aa20.47■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Q3TYL0 343 aa20.47■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Nme8Q715T0 586 aa20.47■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Dusp9Q7TNL7 452 aa20.47■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Tldc1Q8K0P3 455 aa20.47■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Ubac1Q8VDI7 409 aa20.47■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 AvenQ9D9K3 342 aa20.47■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Lztfl1Q9JHQ5 299 aa20.47■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 C2cd2E9Q3C1 696 aa20.47■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 ByslO54825 436 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Snx12O70493 165 aa20.47■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Ttc26Q8BS45 554 aa20.47■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Zfp446Q8C9M8 523 aa20.47■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Rbm28Q8CGC6 750 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Cops6O88545 324 aa20.46■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Dnm2P39054 870 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Cd37Q61470 281 aa20.46■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Pram1Q6BCL1 675 aa20.46■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Def6Q8C2K1 630 aa20.46■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Dnajc7Q9QYI3 494 aa20.46■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Rad23bP54728 416 aa20.46■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Sec23aQ01405 765 aa20.46■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Gjb4Q02738 266 aa20.46■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Kdm7aQ3UWM4 940 aa20.46■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Cnga2Q62398 664 aa20.46■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Otop3Q80UF9 577 aa20.46■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Cgref1Q8R1U2 281 aa20.46■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Zkscan3Q91VW9 553 aa20.46■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Trap1Q9CQN1 706 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 Myh13B1AR69 1938 aa20.45■□□□□ 0.87
Snx16-202ENSMUST00000099223 1700017N19RikA0A087WPJ1 469 aa20.45■□□□□ 0.86
Snx16-202ENSMUST00000099223 Abtb2Q7TQI7 1024 aa20.45■□□□□ 0.86
Snx16-202ENSMUST00000099223 Znf638Q61464 1960 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
Snx16-202ENSMUST00000099223 Cyp26c1B2RXA7 518 aa20.45■□□□□ 0.86
Snx16-202ENSMUST00000099223 Arhgap6O54834 987 aa20.45■□□□□ 0.86
Snx16-202ENSMUST00000099223 Stap2Q8R0L1 411 aa20.45■□□□□ 0.86
Snx16-202ENSMUST00000099223 GzmnQ920S1 248 aa20.45■□□□□ 0.86
Snx16-202ENSMUST00000099223 Apopt1Q9CQW7 192 aa20.45■□□□□ 0.86
Snx16-202ENSMUST00000099223 Cap2Q9CYT6 476 aa20.45■□□□□ 0.86
Snx16-202ENSMUST00000099223 Arap2Q8BZ05 1703 aa20.44■□□□□ 0.86
Snx16-202ENSMUST00000099223 Akap11E9Q777 1895 aa20.44■□□□□ 0.86
Snx16-202ENSMUST00000099223 A0A1Y7VML8 143 aa20.44■□□□□ 0.86
Snx16-202ENSMUST00000099223 Gm21969J3QJZ1 289 aa20.44■□□□□ 0.86
Snx16-202ENSMUST00000099223 Ddx3yQ62095 658 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
Snx16-202ENSMUST00000099223 Trp53inp1Q9QXE4 239 aa20.44■□□□□ 0.86
Snx16-202ENSMUST00000099223 Palm3A2TJV2 734 aa20.44■□□□□ 0.86
Snx16-202ENSMUST00000099223 Nck2O55033 380 aa20.44■□□□□ 0.86
Snx16-202ENSMUST00000099223 MyclP10166 368 aa20.44■□□□□ 0.86
Snx16-202ENSMUST00000099223 Stim2P83093 746 aa20.44■□□□□ 0.86
Snx16-202ENSMUST00000099223 Plbd2Q3TCN2 594 aa20.44■□□□□ 0.86
Snx16-202ENSMUST00000099223 Exoc5Q3TPX4 708 aa20.44■□□□□ 0.86
Snx16-202ENSMUST00000099223 Sco1Q5SUC9 284 aa20.44■□□□□ 0.86
Snx16-202ENSMUST00000099223 Hdac4Q6NZM9 1076 aa20.44■□□□□ 0.86
Snx16-202ENSMUST00000099223 Gnl3lQ6PGG6 577 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
Snx16-202ENSMUST00000099223 Baiap3Q80TT2 1134 aa20.44■□□□□ 0.86
Snx16-202ENSMUST00000099223 Calml3Q9D6P8 149 aa20.44■□□□□ 0.86
Snx16-202ENSMUST00000099223 Dennd3A2RT67 1274 aa20.43■□□□□ 0.86
Snx16-202ENSMUST00000099223 Ano9P86044 747 aa20.43■□□□□ 0.86
Snx16-202ENSMUST00000099223 DSCC1Q14AI0 399 aa20.43■□□□□ 0.86
Snx16-202ENSMUST00000099223 Gngt1Q61012 74 aa20.43■□□□□ 0.86
Snx16-202ENSMUST00000099223 Hook2Q7TMK6 716 aa20.43■□□□□ 0.86
Snx16-202ENSMUST00000099223 Mylk2Q8VCR8 613 aa20.43■□□□□ 0.86
Snx16-202ENSMUST00000099223 AfdnQ9QZQ1 1820 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
Snx16-202ENSMUST00000099223 Sipa1l3G3X9J0 1776 aa20.43■□□□□ 0.86
Snx16-202ENSMUST00000099223 Znf609Q8BZ47 1413 aa20.43■□□□□ 0.86
Snx16-202ENSMUST00000099223 Ube3aO08759 870 aa20.43■□□□□ 0.86
Snx16-202ENSMUST00000099223 Ube3cQ80U95 1083 aa20.43■□□□□ 0.86
Snx16-202ENSMUST00000099223 Eif4enif1Q9EST3 983 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15.9 ms