RNA–Protein interactions for RNA: YOL137W

BSC6, Transcript of Protein of unknown function with 8 putative transmembrane segments, yeast

Gene BSC6, Length 1,494 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BSC6	YOL137W	NHX1	Q04121	633 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BSC6	YOL137W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
BSC6	YOL137W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
BSC6	YOL137W	STE6	P12866	1290 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BSC6	YOL137W	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
BSC6	YOL137W	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
BSC6	YOL137W	SPT16	P32558	1035 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
BSC6	YOL137W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
BSC6	YOL137W	YHR182W	P38870	785 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BSC6	YOL137W	YEL028W	P39989	153 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BSC6	YOL137W	SPO74	P45819	413 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BSC6	YOL137W	CSN9	Q03981	162 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BSC6	YOL137W	ARA2	Q04212	335 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BSC6	YOL137W	AIM32	Q04689	311 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BSC6	YOL137W	GLO2	Q05584	274 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BSC6	YOL137W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
BSC6	YOL137W	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
BSC6	YOL137W	MCH5	Q08777	521 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BSC6	YOL137W	NBP2	Q12163	236 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BSC6	YOL137W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	AEP1	P32493	518 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	EAP1	P36041	632 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	HPM1	P40481	377 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	IAH1	P41734	238 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	AIF1	P52923	378 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	13.58	□□□□□ -0.24	not detected
BSC6	YOL137W	HEH2	Q03281	663 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	SPC2	Q04969	178 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	GET4	Q12125	312 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	GAL80	P04387	435 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	SEC15	P22224	910 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	GIP1	P38229	639 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	SLM4	P38247	162 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	LAM1	P38851	1228 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	RAD55	P38953	406 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	CDC1	P40986	491 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	MET14	Q02196	202 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	HRD3	Q05787	833 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	ATG17	Q06410	417 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	REC8	Q12188	680 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	RGR1	P19263	1082 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	TYR1	P20049	452 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	BUD2	P33314	1104 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	ASK1	P35734	292 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	DRE2	P36152	348 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	YBR259W	P38338	688 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	YGL108C	P53139	140 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	GND2	P53319	492 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	YNL034W	P53963	612 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	YNL018C	P53976	612 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	GRX8	Q05926	109 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	APE1	P14904	514 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	DAL1	P32375	460 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	BCK2	P33306	851 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	DSF2	P38213	736 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	ARN1	P38731	627 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	PIK1	P39104	1066 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	FMP10	P40098	244 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	GUF1	P46943	645 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	MET13	P53128	600 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	SPC98	P53540	846 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	ASI2	P53895	289 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	HDA3	Q06623	655 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	GPM2	Q12008	311 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	13.55	□□□□□ -0.24	not detected
BSC6	YOL137W	COX6	P00427	148 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	MST1	P07236	462 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	YIH1	P25637	258 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	TKL2	P33315	681 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	YHL026C	P38740	315 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	GCV2	P49095	1034 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	ALT2	P52892	507 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	YGR035C	P53222	116 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	DYN3	Q04949	312 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	SEC10	Q06245	871 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	SYT1	Q06836	1226 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	ARP7	Q12406	477 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	ATR1	P13090	542 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	YJR061W	P40355	935 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	PRM2	P40534	656 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	FMP32	P43557	207 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	YPR097W	Q06839	1073 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	CCP1	P00431	361 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	ADY2	P25613	283 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	URK1	P27515	501 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BSC6	YOL137W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24

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