RNA–Protein interactions for RNA: YMR287C

DSS1, Transcript of 3'-5' exoribonuclease, yeast

Gene DSS1, Length 2,910 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSS1	YMR287C	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	ALY1	P36117	915 aa		4.12	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	ARG2	P40360	574 aa		4.12	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	AIM21	P40563	679 aa		4.12	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	YMR206W	Q03695	313 aa		4.12	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	TMN2	Q04562	672 aa		4.12	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	YOR019W	Q99248	730 aa		4.12	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	SYN8	P31377	255 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	CTT1	P06115	562 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	ROX1	P25042	368 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	FLC2	P39719	783 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	MFM1	Q02783	413 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	YMR018W	Q04364	514 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	YPL191C	Q08930	360 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	ACF2	Q12168	779 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	WHI2	P12611	486 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	SPO16	P17122	198 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	LOT5	P34234	306 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	CTF4	Q01454	927 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	BAG7	Q12128	409 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	ZPS1	Q12512	249 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	COX1	P00401	534 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	PMS1	P14242	873 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	PDE1	P22434	369 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	SAE2	P46946	345 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	YDR131C	Q03899	556 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	YMC1	P32331	307 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	ORC2	P32833	620 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	MTH1	P35198	433 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	MRP7	P12687	371 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	MRPL36	P36531	177 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	MNN2	P38069	597 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	MAM1	P40065	302 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	SPO22	P40511	975 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	IME4	P41833	600 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	DSD1	P53095	428 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	JJJ1	P53863	590 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	CTI6	Q08923	506 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	CNS1	P33313	385 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	MET28	P40573	187 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	CPR8	P53728	308 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	ENT1	Q12518	454 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSS1	YMR287C	DJP1	P40564	432 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DSS1	YMR287C	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
DSS1	YMR287C	MFB1	Q04922	465 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DSS1	YMR287C	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
DSS1	YMR287C	YDL073W	Q07454	984 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DSS1	YMR287C	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DSS1	YMR287C	TGS1	Q12052	315 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DSS1	YMR287C	CHO1	P08456	276 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DSS1	YMR287C	GSY2	P27472	705 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DSS1	YMR287C	NUP120	P35729	1037 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DSS1	YMR287C	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
DSS1	YMR287C	RGI2	P40188	164 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DSS1	YMR287C	YPR003C	P53394	754 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DSS1	YMR287C	YAT1	P80235	687 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DSS1	YMR287C	PET111	P08468	800 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DSS1	YMR287C	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
DSS1	YMR287C	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
DSS1	YMR287C	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
DSS1	YMR287C	UME6	P39001	836 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DSS1	YMR287C	ERV46	P39727	415 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DSS1	YMR287C	MAK10	Q02197	733 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DSS1	YMR287C	PLM2	Q04383	521 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DSS1	YMR287C	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DSS1	YMR287C	YLR302C	O13544	120 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DSS1	YMR287C	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
DSS1	YMR287C	MUP3	P38734	546 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DSS1	YMR287C	JHD1	P40034	492 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DSS1	YMR287C	THI6	P41835	540 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DSS1	YMR287C	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
DSS1	YMR287C	CYK3	Q07533	885 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DSS1	YMR287C	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
DSS1	YMR287C	LTP1	P40347	161 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DSS1	YMR287C	GND2	P53319	492 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DSS1	YMR287C	YPL071C	Q02864	156 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DSS1	YMR287C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
DSS1	YMR287C	ERP4	Q12450	207 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DSS1	YMR287C	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
DSS1	YMR287C	OAR1	P35731	278 aa		4.06	□□□□□ -1.76
DSS1	YMR287C	FLO10	P36170	1169 aa		4.06	□□□□□ -1.76
DSS1	YMR287C	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
DSS1	YMR287C	PAC2	P39937	518 aa		4.06	□□□□□ -1.76

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