RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597259.1

HERC3-212, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 313 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-212ENST00000597259 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
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HERC3-212ENST00000597259 ZBTB39O15060 712 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC3-212ENST00000597259 CYP27B1O15528 508 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC3-212ENST00000597259 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
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HERC3-212ENST00000597259 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 PHKG2P15735 406 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP7.33□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 PTPRAP18433 802 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
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