RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596951.5

FCHO1-218, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 2,979 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-218ENST00000596951 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa13.15□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 HPSEQ9Y251 543 aa13.15□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 EVX2Q03828 476 aa13.14□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 MTF1Q14872 753 aa13.14□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 LONRF3Q496Y0 759 aa13.14□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 SUGCTQ9HAC7 445 aa13.14□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 ABCF2Q9UG63 623 aa13.14□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP13.14□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa13.14□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 PDE8AO60658 829 aa13.14□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 BMP6P22004 513 aa13.14□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 TDO2P48775 406 aa13.14□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 CHMP4BP1P59074 171 aa13.14□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 SLC39A14Q15043 492 aa13.14□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 NTRK3Q16288 839 aa13.14□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 LEKR1Q6ZMV7 388 aa13.14□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 PNKPQ96T60 521 aa13.14□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 UTRNP46939 3433 aa13.14□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 FAM205CA6NFA0 338 aa13.14□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 MINDY4BA8MYZ0 360 aa13.14□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 CUTAO60888 179 aa13.14□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 OLFM4Q6UX06 510 aa13.14□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 ZNF34Q8IZ26 560 aa13.14□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 SLC12A7Q9Y666 1083 aa13.14□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 AKAP11Q9UKA4 1901 aa13.13□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 A0A0U1RQJ8 604 aa13.13□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 PRDM1O75626 825 aa13.13□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 PTPAQ15257 358 aa13.13□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 WWC2Q6AWC2 1192 aa13.13□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa13.13□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 OXER1Q8TDS5 423 aa13.13□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 ATRIPQ8WXE1 791 aa13.13□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 FAN1Q9Y2M0 1017 aa13.13□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa13.13□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 ERVV-1B6SEH8 477 aa13.13□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 POTEAQ6S8J7 498 aa13.13□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 USP49Q70CQ1 688 aa13.13□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 ADGRA1Q86SQ6 560 aa13.13□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 FBXL16Q8N461 479 aa13.13□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 GSG1L2A8MUP6 293 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 UBE3CQ15386 1083 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 FAM196AQ6ZSG2 479 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 HDXQ7Z353 690 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 JAG2Q9Y219 1238 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 IVLP07476 585 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 CASP1P29466 404 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 LPIN2Q92539 896 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 ABCB6Q9NP58 842 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 RAB21Q9UL25 225 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 L1RE1Q9UN81 338 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 CDHR2Q9BYE9 1310 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 BTAF1O14981 1849 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 MYO1BO43795 1136 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 TFRCP02786 760 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 PRR29P0C7W0 189 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 USP5P45974 858 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 TRIM29Q14134 588 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 PACS2Q86VP3 889 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 MAP3K14Q99558 947 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 LZTFL1Q9NQ48 299 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 LRP2BPQ9P2M1 347 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 FBXO3Q9UK99 471 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 SOWAHDA6NJG2 315 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 RPS6KA5O75582 802 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 RXRBP28702 533 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 PROM2Q8N271 834 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 CNNM3Q8NE01 707 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 COBLO75128 1261 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 FGFR2P21802 821 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 GYG1P46976 350 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 ICE2Q659A1 982 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 TBC1D9BQ66K14 1250 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 MFSD6Q6ZSS7 791 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 MSANTD4Q8NCY6 345 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 SLC5A1P13866 664 aa13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 ZNF18P17022 549 aa13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 MAP3K12Q12852 859 aa13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-218ENST00000596951 RESP18Q5W5W9 173 aa13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms