RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592965.2

MBD3-211, Transcript of methyl-CpG binding domain protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene MBD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3-211ENST00000592965 CYP2D6P10635 497 aa28.07■■■□□ 2.08
MBD3-211ENST00000592965 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa28.07■■■□□ 2.08
MBD3-211ENST00000592965 RBPJLQ9UBG7 517 aa28.07■■■□□ 2.08
MBD3-211ENST00000592965 SWAP70Q9UH65 585 aa28.07■■■□□ 2.08
MBD3-211ENST00000592965 USP17L15C9J2P7 530 aa28.06■■■□□ 2.08
MBD3-211ENST00000592965 USP17L13C9JLJ4 530 aa28.06■■■□□ 2.08
MBD3-211ENST00000592965 USP17L11C9JVI0 530 aa28.06■■■□□ 2.08
MBD3-211ENST00000592965 USP17L18D6R9N7 530 aa28.06■■■□□ 2.08
MBD3-211ENST00000592965 USP17L22D6RA61 530 aa28.06■■■□□ 2.08
MBD3-211ENST00000592965 USP17L17D6RBQ6 530 aa28.06■■■□□ 2.08
MBD3-211ENST00000592965 USP17L19D6RCP7 530 aa28.06■■■□□ 2.08
MBD3-211ENST00000592965 USP17L20D6RJB6 530 aa28.06■■■□□ 2.08
MBD3-211ENST00000592965 PRKAB2O43741 272 aa28.06■■■□□ 2.08
MBD3-211ENST00000592965 USP17L24Q0WX57 530 aa28.06■■■□□ 2.08
MBD3-211ENST00000592965 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
MBD3-211ENST00000592965 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa28.06■■■□□ 2.08
MBD3-211ENST00000592965 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
MBD3-211ENST00000592965 GPATCH3Q96I76 525 aa28.06■■■□□ 2.08
MBD3-211ENST00000592965 CHGBP05060 677 aa28.05■■■□□ 2.08
MBD3-211ENST00000592965 VCAM1P19320 739 aa28.05■■■□□ 2.08
MBD3-211ENST00000592965 ERVK-9P63128 1117 aa28.05■■■□□ 2.08
MBD3-211ENST00000592965 ERVK-24P63145 666 aa28.05■■■□□ 2.08
MBD3-211ENST00000592965 SEPT2Q15019 361 aa28.05■■■□□ 2.08
MBD3-211ENST00000592965 GCC1Q96CN9 775 aa28.05■■■□□ 2.08
MBD3-211ENST00000592965 PEX10O60683 326 aa28.04■■■□□ 2.08
MBD3-211ENST00000592965 HMGCRP04035 888 aa28.04■■■□□ 2.08
MBD3-211ENST00000592965 CAPN2P17655 700 aa28.04■■■□□ 2.08
MBD3-211ENST00000592965 MAPK4P31152 587 aa28.04■■■□□ 2.08
MBD3-211ENST00000592965 POTEEQ6S8J3 1075 aa28.04■■■□□ 2.08
MBD3-211ENST00000592965 SLC44A5Q8NCS7 719 aa28.04■■■□□ 2.08
MBD3-211ENST00000592965 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
MBD3-211ENST00000592965 SGPL1O95470 568 aa28.03■■■□□ 2.08
MBD3-211ENST00000592965 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa28.03■■■□□ 2.08
MBD3-211ENST00000592965 TMEM179Q6ZVK1 233 aa28.03■■■□□ 2.08
MBD3-211ENST00000592965 SOCS4Q8WXH5 440 aa28.03■■■□□ 2.08
MBD3-211ENST00000592965 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa28.03■■■□□ 2.08
MBD3-211ENST00000592965 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
MBD3-211ENST00000592965 RRP1P56182 461 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
MBD3-211ENST00000592965 C12orf60Q5U649 245 aa28.02■■■□□ 2.08
MBD3-211ENST00000592965 DYNLL2Q96FJ2 89 aa28.02■■■□□ 2.08
MBD3-211ENST00000592965 DDRGK1Q96HY6 314 aa28.02■■■□□ 2.08
MBD3-211ENST00000592965 PAGR1Q9BTK6 254 aa28.02■■■□□ 2.08
MBD3-211ENST00000592965 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa28.02■■■□□ 2.08
MBD3-211ENST00000592965 Q3C1V9 767 aa28.01■■■□□ 2.07
MBD3-211ENST00000592965 LBX2Q6XYB7 198 aa28.01■■■□□ 2.07
MBD3-211ENST00000592965 AMOTL1Q8IY63 956 aa28.01■■■□□ 2.07
MBD3-211ENST00000592965 KBTBD3Q8NAB2 608 aa28.01■■■□□ 2.07
MBD3-211ENST00000592965 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
MBD3-211ENST00000592965 PORCNQ9H237 461 aa28.01■■■□□ 2.07
MBD3-211ENST00000592965 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa28.01■■■□□ 2.07
MBD3-211ENST00000592965 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
MBD3-211ENST00000592965 DEFB118Q96PH6 123 aa28■■■□□ 2.07
MBD3-211ENST00000592965 NUDT12Q9BQG2 462 aa28■■■□□ 2.07
MBD3-211ENST00000592965 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
MBD3-211ENST00000592965 RLFQ13129 1914 aa27.99■■■□□ 2.07
MBD3-211ENST00000592965 A0A1W2PRG0 241 aa27.99■■■□□ 2.07
MBD3-211ENST00000592965 USP17L12C9JPN9 530 aa27.99■■■□□ 2.07
MBD3-211ENST00000592965 USP17L21D6R901 530 aa27.99■■■□□ 2.07
MBD3-211ENST00000592965 CNMDO75829 334 aa27.99■■■□□ 2.07
MBD3-211ENST00000592965 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
MBD3-211ENST00000592965 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
MBD3-211ENST00000592965 CCDC17Q96LX7 622 aa27.99■■■□□ 2.07
MBD3-211ENST00000592965 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa27.99■■■□□ 2.07
MBD3-211ENST00000592965 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP27.99■■■□□ 2.071e-7■■□□□ 14.5
MBD3-211ENST00000592965 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa27.98■■■□□ 2.07
MBD3-211ENST00000592965 CCNA1P78396 465 aa27.98■■■□□ 2.07
MBD3-211ENST00000592965 TSHZ3Q63HK5 1081 aa27.98■■■□□ 2.07
MBD3-211ENST00000592965 C16orf86Q6ZW13 317 aa27.98■■■□□ 2.07
MBD3-211ENST00000592965 GPR142Q7Z601 462 aa27.98■■■□□ 2.07
MBD3-211ENST00000592965 TRIB2Q92519 343 aa27.98■■■□□ 2.07
MBD3-211ENST00000592965 USP6NLQ92738 828 aa27.98■■■□□ 2.07
MBD3-211ENST00000592965 A0A0G2JMZ2 1700 aa27.98■■■□□ 2.07
MBD3-211ENST00000592965 AKR1B1P15121 316 aa27.97■■■□□ 2.07
MBD3-211ENST00000592965 CYP2B6P20813 491 aa27.97■■■□□ 2.07
MBD3-211ENST00000592965 CDK8P49336 464 aa27.97■■■□□ 2.07
MBD3-211ENST00000592965 PLEKHH3Q7Z736 793 aa27.97■■■□□ 2.07
MBD3-211ENST00000592965 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
MBD3-211ENST00000592965 TTC41PQ6P2S7 1318 aa27.96■■■□□ 2.07
MBD3-211ENST00000592965 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
MBD3-211ENST00000592965 SMIM22K7EJ46 135 aa27.96■■■□□ 2.07
MBD3-211ENST00000592965 MORN1Q5T089 497 aa27.96■■■□□ 2.07
MBD3-211ENST00000592965 CTR9Q6PD62 1173 aa27.96■■■□□ 2.07
MBD3-211ENST00000592965 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
MBD3-211ENST00000592965 APPBP2Q92624 585 aa27.96■■■□□ 2.07
MBD3-211ENST00000592965 HTATIP2Q9BUP3 242 aa27.96■■■□□ 2.07
MBD3-211ENST00000592965 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
MBD3-211ENST00000592965 RPTORQ8N122 1335 aa27.95■■■□□ 2.07
MBD3-211ENST00000592965 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
MBD3-211ENST00000592965 TFRCP02786 760 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
MBD3-211ENST00000592965 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
MBD3-211ENST00000592965 ICA1Q05084 483 aa27.95■■■□□ 2.06
MBD3-211ENST00000592965 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa27.95■■■□□ 2.06
MBD3-211ENST00000592965 LPAR1Q92633 364 aa27.95■■■□□ 2.06
MBD3-211ENST00000592965 SH2D4AQ9H788 454 aa27.95■■■□□ 2.06
MBD3-211ENST00000592965 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa27.95■■■□□ 2.06
MBD3-211ENST00000592965 PARP14Q460N5 1801 aa27.95■■■□□ 2.06
MBD3-211ENST00000592965 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa27.94■■■□□ 2.06
MBD3-211ENST00000592965 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
MBD3-211ENST00000592965 RGS2P41220 211 aa27.94■■■□□ 2.06
MBD3-211ENST00000592965 TRIM32Q13049 653 aa27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms