RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa10.65□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 NTSR2O95665 410 aa10.65□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 UQCRHP07919 91 aa10.65□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 FDPSP14324 419 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF75DP51815 510 aa10.65□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 GUCY1B3Q02153 619 aa10.65□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 RASGRF1Q13972 1273 aa10.65□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP10.65□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP10.65□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 ANO1Q5XXA6 986 aa10.65□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 APOA5Q6Q788 366 aa10.65□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 CLEC4GQ6UXB4 293 aa10.65□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 MFSD6Q6ZSS7 791 aa10.65□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 TRIM22Q8IYM9 498 aa10.65□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 SYNE4Q8N205 404 aa10.65□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 TMTC2Q8N394 836 aa10.65□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC00301Q8NCQ3 95 aa10.65□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 ALG1Q9BT22 464 aa10.65□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 DNAJC25Q9H1X3 360 aa10.65□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 WWC3Q9ULE0 1092 aa10.65□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP10.65□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC12A7Q9Y666 1083 aa10.65□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 SLIT2O94813 1529 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 NEDD4P46934 1319 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 DYNC1I1O14576 645 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 PCP11498 1178 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 IARSP41252 1262 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 MMP16P51512 607 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 PPP2R5BQ15173 497 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 AKNAD1Q5T1N1 836 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 PLA2G4DQ86XP0 818 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 IFNL3Q8IZI9 196 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 ENGASEQ8NFI3 743 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 STAG1Q8WVM7 1258 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 TIGD1Q96MW7 591 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 BPIFA3Q9BQP9 254 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 SDF4Q9BRK5 362 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 CHD4Q14839 1912 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 B4E1Z4 1266 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 PPP6R2O75170 966 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 CAVIN4Q5BKX8 364 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 CYB5R4Q7L1T6 521 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 MICU3Q86XE3 530 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 SPC24Q8NBT2 197 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 LY9Q9HBG7 655 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 LRP2BPQ9P2M1 347 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 PCDHA7Q9UN72 937 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 BCL9LQ86UU0 1499 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 NRDCO43847 1150 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 IGSF3O75054 1194 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 ADAMTS2O95450 1211 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 CMA1P23946 247 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 NT5C2P49902 561 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 CHRNDQ07001 517 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 UBE4AQ14139 1066 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 WTAPQ15007 396 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 RTN1Q16799 776 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 GRIPAP1Q4V328 841 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 ILDR2Q71H61 639 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 VPS37DQ86XT2 251 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 CYP4X1Q8N118 509 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 KIAA1524Q8TCG1 905 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 UBAC1Q9BSL1 405 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP10.62□□□□□ -0.713e-9■□□□□ 9.2
EFTUD2-222ENST00000592408 NYXQ9GZU5 481 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 ARMT1Q9H993 441 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 CLIP2Q9UDT6 1046 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 DENND2AQ9ULE3 1009 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 MAST2Q6P0Q8 1798 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF804BA4D1E1 1349 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 ECM29Q5VYK3 1845 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM177BA6PVY3 158 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 SMTNL1A8MU46 457 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 HOXA2O43364 376 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-222ENST00000592408 MYO1BO43795 1136 aa10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.9 ms