RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589969.1

NFIC-209, Transcript of nuclear factor I C, humanhuman

TSL 3

Gene NFIC, Length 614 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIC-209ENST00000589969 TXNRD2Q9NNW7 524 aa24.94■■□□□ 1.58
NFIC-209ENST00000589969 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa24.94■■□□□ 1.58
NFIC-209ENST00000589969 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
NFIC-209ENST00000589969 ERVK-9P63128 1117 aa24.93■■□□□ 1.58
NFIC-209ENST00000589969 ERVK-24P63145 666 aa24.93■■□□□ 1.58
NFIC-209ENST00000589969 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa24.93■■□□□ 1.58
NFIC-209ENST00000589969 SDR42E1Q8WUS8 393 aa24.93■■□□□ 1.58
NFIC-209ENST00000589969 NUDT12Q9BQG2 462 aa24.93■■□□□ 1.58
NFIC-209ENST00000589969 SWAP70Q9UH65 585 aa24.93■■□□□ 1.58
NFIC-209ENST00000589969 TFRCP02786 760 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
NFIC-209ENST00000589969 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
NFIC-209ENST00000589969 UBE3CQ15386 1083 aa24.92■■□□□ 1.58
NFIC-209ENST00000589969 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
NFIC-209ENST00000589969 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
NFIC-209ENST00000589969 DPF3Q92784 378 aa24.92■■□□□ 1.58
NFIC-209ENST00000589969 DEFB118Q96PH6 123 aa24.92■■□□□ 1.58
NFIC-209ENST00000589969 ARMT1Q9H993 441 aa24.92■■□□□ 1.58
NFIC-209ENST00000589969 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa24.92■■□□□ 1.58
NFIC-209ENST00000589969 MBD4O95243 580 aa24.91■■□□□ 1.58
NFIC-209ENST00000589969 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa24.91■■□□□ 1.58
NFIC-209ENST00000589969 AMOTL1Q8IY63 956 aa24.91■■□□□ 1.58
NFIC-209ENST00000589969 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
NFIC-209ENST00000589969 ACER1Q8TDN7 264 aa24.91■■□□□ 1.58
NFIC-209ENST00000589969 DDRGK1Q96HY6 314 aa24.91■■□□□ 1.58
NFIC-209ENST00000589969 PAGR1Q9BTK6 254 aa24.91■■□□□ 1.58
NFIC-209ENST00000589969 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
NFIC-209ENST00000589969 DOCK3Q8IZD9 2030 aa24.91■■□□□ 1.58
NFIC-209ENST00000589969 VCAM1P19320 739 aa24.9■■□□□ 1.58
NFIC-209ENST00000589969 CCNA1P78396 465 aa24.9■■□□□ 1.58
NFIC-209ENST00000589969 SEPT2Q15019 361 aa24.9■■□□□ 1.58
NFIC-209ENST00000589969 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa24.9■■□□□ 1.58
NFIC-209ENST00000589969 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP24.9■■□□□ 1.58
NFIC-209ENST00000589969 ECHDC1Q9NTX5 307 aa24.9■■□□□ 1.58
NFIC-209ENST00000589969 RPTORQ8N122 1335 aa24.89■■□□□ 1.58
NFIC-209ENST00000589969 H0YGN5 161 aa24.89■■□□□ 1.58
NFIC-209ENST00000589969 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
NFIC-209ENST00000589969 GUCY1A2P33402 732 aa24.89■■□□□ 1.58
NFIC-209ENST00000589969 Q3C1V9 767 aa24.89■■□□□ 1.58
NFIC-209ENST00000589969 LBX2Q6XYB7 198 aa24.89■■□□□ 1.58
NFIC-209ENST00000589969 TMEM179Q6ZVK1 233 aa24.89■■□□□ 1.58
NFIC-209ENST00000589969 GPATCH3Q96I76 525 aa24.89■■□□□ 1.58
NFIC-209ENST00000589969 DCTPP1Q9H773 170 aa24.89■■□□□ 1.58
NFIC-209ENST00000589969 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
NFIC-209ENST00000589969 NAV1Q8NEY1 1877 aa24.89■■□□□ 1.57
NFIC-209ENST00000589969 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
NFIC-209ENST00000589969 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
NFIC-209ENST00000589969 CYP2B6P20813 491 aa24.88■■□□□ 1.57
NFIC-209ENST00000589969 PLEKHH3Q7Z736 793 aa24.88■■□□□ 1.57
NFIC-209ENST00000589969 PEX10O60683 326 aa24.87■■□□□ 1.57
NFIC-209ENST00000589969 GPR142Q7Z601 462 aa24.87■■□□□ 1.57
NFIC-209ENST00000589969 ANKLE1Q8NAG6 615 aa24.87■■□□□ 1.57
NFIC-209ENST00000589969 CCDC17Q96LX7 622 aa24.87■■□□□ 1.57
NFIC-209ENST00000589969 PORCNQ9H237 461 aa24.87■■□□□ 1.57
NFIC-209ENST00000589969 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
NFIC-209ENST00000589969 PCDH10Q9P2E7 1040 aa24.87■■□□□ 1.57
NFIC-209ENST00000589969 NR2E3Q9Y5X4 410 aa24.87■■□□□ 1.57
NFIC-209ENST00000589969 PRKAB2O43741 272 aa24.86■■□□□ 1.57
NFIC-209ENST00000589969 CYP2D6P10635 497 aa24.86■■□□□ 1.57
NFIC-209ENST00000589969 RGS2P41220 211 aa24.86■■□□□ 1.57
NFIC-209ENST00000589969 C12orf60Q5U649 245 aa24.86■■□□□ 1.57
NFIC-209ENST00000589969 POTEEQ6S8J3 1075 aa24.86■■□□□ 1.57
NFIC-209ENST00000589969 TRIB2Q92519 343 aa24.86■■□□□ 1.57
NFIC-209ENST00000589969 USP6NLQ92738 828 aa24.86■■□□□ 1.57
NFIC-209ENST00000589969 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
NFIC-209ENST00000589969 EVX2Q03828 476 aa24.85■■□□□ 1.57
NFIC-209ENST00000589969 SLFNL1Q499Z3 407 aa24.85■■□□□ 1.57
NFIC-209ENST00000589969 MORN1Q5T089 497 aa24.85■■□□□ 1.57
NFIC-209ENST00000589969 SH2D4AQ9H788 454 aa24.85■■□□□ 1.57
NFIC-209ENST00000589969 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa24.85■■□□□ 1.57
NFIC-209ENST00000589969 USP17L12C9JPN9 530 aa24.84■■□□□ 1.57
NFIC-209ENST00000589969 USP17L21D6R901 530 aa24.84■■□□□ 1.57
NFIC-209ENST00000589969 CNMDO75829 334 aa24.84■■□□□ 1.57
NFIC-209ENST00000589969 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
NFIC-209ENST00000589969 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa24.84■■□□□ 1.57
NFIC-209ENST00000589969 SLC44A5Q8NCS7 719 aa24.84■■□□□ 1.57
NFIC-209ENST00000589969 LPAR1Q92633 364 aa24.84■■□□□ 1.57
NFIC-209ENST00000589969 DYNLL2Q96FJ2 89 aa24.84■■□□□ 1.57
NFIC-209ENST00000589969 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa24.84■■□□□ 1.57
NFIC-209ENST00000589969 HOXC10Q9NYD6 342 aa24.84■■□□□ 1.57
NFIC-209ENST00000589969 A0A1W2PRG0 241 aa24.83■■□□□ 1.57
NFIC-209ENST00000589969 COG2Q14746 738 aa24.83■■□□□ 1.57
NFIC-209ENST00000589969 NECAB2Q7Z6G3 386 aa24.83■■□□□ 1.57
NFIC-209ENST00000589969 APBA2Q99767 749 aa24.83■■□□□ 1.57
NFIC-209ENST00000589969 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
NFIC-209ENST00000589969 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
NFIC-209ENST00000589969 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
NFIC-209ENST00000589969 CDK8P49336 464 aa24.82■■□□□ 1.56
NFIC-209ENST00000589969 TRIM32Q13049 653 aa24.82■■□□□ 1.56
NFIC-209ENST00000589969 C16orf86Q6ZW13 317 aa24.82■■□□□ 1.56
NFIC-209ENST00000589969 KBTBD3Q8NAB2 608 aa24.82■■□□□ 1.56
NFIC-209ENST00000589969 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
NFIC-209ENST00000589969 CEP290O15078 2479 aa24.81■■□□□ 1.56
NFIC-209ENST00000589969 SLC15A5A6NIM6 579 aa24.81■■□□□ 1.56
NFIC-209ENST00000589969 ICA1Q05084 483 aa24.81■■□□□ 1.56
NFIC-209ENST00000589969 MAP2K5Q13163 448 aa24.81■■□□□ 1.56
NFIC-209ENST00000589969 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
NFIC-209ENST00000589969 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
NFIC-209ENST00000589969 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa24.81■■□□□ 1.56
NFIC-209ENST00000589969 PLXNB2O15031 1838 aa24.81■■□□□ 1.56
NFIC-209ENST00000589969 CHGBP05060 677 aa24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.1 ms