RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586654.5

EFTUD2-206, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 585 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-206ENST00000586654 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-206ENST00000586654 FOCADQ5VW36 1801 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-206ENST00000586654 USP17L10C9JJH3 530 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-206ENST00000586654 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-206ENST00000586654 GH2P01242 217 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-206ENST00000586654 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-206ENST00000586654 TATDN1Q6P1N9 297 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-206ENST00000586654 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-206ENST00000586654 USP26Q9BXU7 913 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-206ENST00000586654 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-206ENST00000586654 HTTP42858 3142 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-206ENST00000586654 ATAD5Q96QE3 1844 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-206ENST00000586654 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-206ENST00000586654 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-206ENST00000586654 ADD2P35612 726 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-206ENST00000586654 FLT3LGP49771 235 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-206ENST00000586654 PLCD1P51178 756 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-206ENST00000586654 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-206ENST00000586654 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-206ENST00000586654 MTFR1Q15390 333 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-206ENST00000586654 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-206ENST00000586654 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-206ENST00000586654 LCORLQ8N3X6 602 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-206ENST00000586654 SLAIN1Q8ND83 568 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-206ENST00000586654 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP11.66□□□□□ -0.541e-6■■□□□ 11.9
EFTUD2-206ENST00000586654 LOC285556D6RIA3 1793 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-206ENST00000586654 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-206ENST00000586654 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-206ENST00000586654 UBXN2AP68543 259 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-206ENST00000586654 GABPAQ06546 454 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-206ENST00000586654 IRF5Q13568 498 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-206ENST00000586654 SLFNL1Q499Z3 407 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-206ENST00000586654 USP17L2Q6R6M4 530 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-206ENST00000586654 SDR42E1Q8WUS8 393 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-206ENST00000586654 COA7Q96BR5 231 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-206ENST00000586654 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-206ENST00000586654 EMILIN3Q9NT22 766 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-206ENST00000586654 MCM9Q9NXL9 1143 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-206ENST00000586654 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-206ENST00000586654 MYH1P12882 1939 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 ADCY3O60266 1144 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 MBD4O95243 580 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 SHMT1P34896 483 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 RAB3GAP1Q15042 981 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 RABEP1Q15276 862 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 ABCB5Q2M3G0 1257 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 HSCBQ8IWL3 235 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 PXYLP1Q8TE99 480 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 C12orf42Q96LP6 360 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 FEZ1Q99689 392 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 ARMT1Q9H993 441 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 CABP5Q9NP86 173 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 MORF4L1Q9UBU8 362 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 A0A0D9SFI3 127 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 PRKAB2O43741 272 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 CHGBP05060 677 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 GJB1P08034 283 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 CYP2D6P10635 497 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 CCL5P13501 91 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 ELNP15502 786 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 GUCY1A2P33402 732 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 ANAPC15P60006 121 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 HERVK_113P62684 666 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 EVX2Q03828 476 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 UBE3CQ15386 1083 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 NKX2-3Q8TAU0 364 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 ACER1Q8TDN7 264 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 SHISA4Q96DD7 197 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 FAM227BQ96M60 508 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 RNF208Q9H0X6 261 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 HELLSQ9NRZ9 838 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 TAOK2Q9UL54 1235 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 MGAMO43451 1857 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 CCDC171Q6TFL3 1326 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 DOCK3Q8IZD9 2030 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 INHAP05111 366 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 GJA8P48165 433 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 USP14P54578 494 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 UNC93B1Q9H1C4 597 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 TXNRD2Q9NNW7 524 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 USP17L15C9J2P7 530 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 USP17L13C9JLJ4 530 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 USP17L11C9JVI0 530 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 USP17L18D6R9N7 530 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 USP17L22D6RA61 530 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 USP17L17D6RBQ6 530 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 USP17L19D6RCP7 530 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 USP17L20D6RJB6 530 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 PEX10O60683 326 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-206ENST00000586654 USP17L24Q0WX57 530 aa11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms