RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569298.1

KARS-211, Transcript of lysyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 2

Gene KARS, Length 589 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARS-211ENST00000569298 P4HA2O15460 535 aa7.3□□□□□ -1.24
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KARS-211ENST00000569298 STK10O94804 968 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 NPTXRO95502 500 aa7.3□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 FOSL1P15407 271 aa7.3□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 RFX1P22670 979 aa7.3□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 ZNF75DP51815 510 aa7.3□□□□□ -1.24
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KARS-211ENST00000569298 NEK9Q8TD19 979 aa7.3□□□□□ -1.24
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KARS-211ENST00000569298 USP33Q8TEY7 942 aa7.3□□□□□ -1.24
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KARS-211ENST00000569298 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa7.3□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 VPS18Q9P253 973 aa7.3□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 HDAC6Q9UBN7 1215 aa7.3□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 RABL2BQ9UNT1 228 aa7.3□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 COMMD10Q9Y6G5 202 aa7.3□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 WASF2Q9Y6W5 498 aa7.3□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 SH3TC1Q8TE82 1336 aa7.29□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa7.29□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 H3BQF6 201 aa7.29□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 BIRC5O15392 142 aa7.29□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 TTI1O43156 1089 aa7.29□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 ATP6V1G1O75348 118 aa7.29□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 BBOX1O75936 387 aa7.29□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 KIF4AO95239 1232 aa7.29□□□□□ -1.24
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KARS-211ENST00000569298 TXLNAP40222 546 aa7.29□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 NLRP5P59047 1200 aa7.29□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 ETF1P62495 437 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
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KARS-211ENST00000569298 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
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KARS-211ENST00000569298 INF2Q27J81 1249 aa7.29□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 CCDC40Q4G0X9 1142 aa7.29□□□□□ -1.24
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KARS-211ENST00000569298 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
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KARS-211ENST00000569298 KLHDC4Q8TBB5 520 aa7.29□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 AFAP1L1Q8TED9 768 aa7.29□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 TEKT4Q8WW24 435 aa7.29□□□□□ -1.24
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KARS-211ENST00000569298 USP26Q9BXU7 913 aa7.29□□□□□ -1.24
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KARS-211ENST00000569298 CAPN7Q9Y6W3 813 aa7.29□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 TOP2BQ02880 1626 aa7.29□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 GRIN2AQ12879 1464 aa7.29□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 SYNMO15061 1565 aa7.29□□□□□ -1.24
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KARS-211ENST00000569298 PBRM1Q86U86 1689 aa7.28□□□□□ -1.24
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KARS-211ENST00000569298 TMCC1O94876 653 aa7.28□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 SMARCA1P28370 1054 aa7.28□□□□□ -1.24
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KARS-211ENST00000569298 LBRQ14739 615 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 CCDC152Q4G0S7 254 aa7.28□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 CDC37L1Q7L3B6 337 aa7.28□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 IRGQQ8WZA9 623 aa7.28□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 FOXJ1Q92949 421 aa7.28□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 L3MBTL2Q969R5 705 aa7.28□□□□□ -1.24
KARS-211ENST00000569298 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
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