RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566677.1

C15orf41-209, Transcript of chromosome 15 open reading frame 41, humanhuman

TSL 2

Gene C15orf41, Length 5,843 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf41-209ENST00000566677 DUOX1Q9NRD9 1551 aa4.93□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 GOLGA8AA7E2F4 631 aa4.93□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 SNAP23O00161 211 aa4.93□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 NEBLO76041 1014 aa4.93□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 FGAP02671 866 aa4.93□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 CAPN2P17655 700 aa4.93□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 APOBRQ0VD83 1088 aa4.93□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 ADCK5Q3MIX3 580 aa4.93□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 AMIGO3Q86WK7 504 aa4.93□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 RASEFQ8IZ41 740 aa4.93□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 NECAB1Q8N987 351 aa4.93□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 NUP133Q8WUM0 1156 aa4.93□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 ESR2Q92731 530 aa4.93□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 BRF1Q92994 677 aa4.93□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 IL25Q9H293 177 aa4.93□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 TUBBP07437 444 aa4.93□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 FERP16591 822 aa4.93□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP4.93□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 CCT2P78371 535 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 DOK7Q18PE1 504 aa4.93□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 IQCA1Q86XH1 822 aa4.93□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 TSG101Q99816 390 aa4.93□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 HDAC9Q9UKV0 1011 aa4.93□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 LIG1P18858 919 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 GTF2IP78347 998 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 WTAPQ15007 396 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 CAMK4Q16566 473 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 KLHL40Q2TBA0 621 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 CHST3Q7LGC8 479 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 TBC1D16Q8TBP0 767 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 TMEM87BQ96K49 555 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 ZHX3Q9H4I2 956 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 CTAGE15A4D2H0 777 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 KDM4AO75164 1064 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 CTAGE8P0CG41 777 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 CATIPQ7Z7H3 387 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 CTAGE6Q86UF2 777 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 CTAGE4Q8IX94 777 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 TMTC2Q8N394 836 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 MIPOL1Q8TD10 442 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 TCEANC2Q96MN5 208 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 CAMKK2Q96RR4 588 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 MCM9Q9NXL9 1143 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 B4E1Z4 1266 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 STX6O43752 255 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 CYP21A2P08686 494 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 KLRK1P26718 216 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 BTDP43251 543 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 NAA25Q14CX7 972 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 TSGA10IPQ3SY00 556 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 MFSD14BQ5SR56 506 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 CCDC50Q8IVM0 306 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 TMOD2Q9NZR1 351 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 RNF40O75150 1001 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 SLU7O95391 586 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 HLA-DOAP06340 250 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 PICALMQ13492 652 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 CCDC93Q567U6 631 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 TMC6Q7Z403 805 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 POTEDQ86YR6 584 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 LMNTD2Q8IXW0 634 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 TEX11Q8IYF3 940 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 RTKN2Q8IZC4 609 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 PPFIBP2Q8ND30 876 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 KCNB2Q92953 911 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 CD209Q9NNX6 404 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 PPIP5K2O43314 1243 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 KIF4AO95239 1232 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 TSPY3P0CV98 308 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 TSPY8P0CW00 308 aa4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 IKQ13123 557 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
C15orf41-209ENST00000566677 ME3Q16798 604 aa4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms