RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM139	Q8IV31	216 aa		20.99	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		20.99	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	20.99	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		20.99	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	20.99	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	ORC4	O43929	436 aa		20.98	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	ERFE	Q4G0M1	354 aa		20.98	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		20.98	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	20.98	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	GSDMA	Q96QA5	445 aa		20.98	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	20.98	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		20.98	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	20.98	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	CTR9	Q6PD62	1173 aa		20.98	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		20.98	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		20.98	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	DHX58	Q96C10	678 aa		20.98	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1B0GUL6	1792 aa		20.97	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	20.97	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	NR1I3	Q14994	352 aa		20.97	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF827	Q17R98	1081 aa		20.97	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	USP49	Q70CQ1	688 aa		20.97	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		20.97	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	20.97	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	20.97	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		20.97	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1B0GTH6	734 aa		20.96	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		20.96	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	TRAPPC10	P48553	1259 aa		20.96	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	SPATA1	Q5VX52	437 aa		20.96	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		20.96	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	TC2N	Q8N9U0	490 aa		20.96	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	SHISA4	Q96DD7	197 aa		20.96	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		20.96	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	20.96	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		20.96	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	NT5C2	P49902	561 aa		20.96	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		20.96	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	20.96	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	20.96	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	PAGE5	Q96GU1	130 aa		20.96	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		20.96	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	20.96	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	USP17L12	C9JPN9	530 aa		20.95	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	USP17L21	D6R901	530 aa		20.95	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		20.95	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	TTC38	Q5R3I4	469 aa		20.95	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	KRT222	Q8N1A0	295 aa		20.95	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	TNFRSF25	Q93038	417 aa		20.95	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	20.95	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	EPSTI1	Q96J88	318 aa		20.95	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	20.95	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		20.95	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	20.95	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	SCN7A	Q01118	1682 aa		20.95	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	TPM1	P09493	284 aa		20.95	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	20.95	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	20.95	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		20.95	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		20.94	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	FAM205C	A6NFA0	338 aa		20.94	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	PRDM1	O75626	825 aa		20.94	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	20.94	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	20.94	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	MNS1	Q8NEH6	495 aa		20.94	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	PANX2	Q96RD6	677 aa		20.94	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		20.94	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		20.93	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		20.93	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		20.93	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	DPYD	Q12882	1025 aa		20.93	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	20.93	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	UBXN4	Q92575	508 aa		20.93	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		20.93	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	MED15	Q96RN5	788 aa		20.93	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	20.93	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		20.93	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	20.93	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	20.93	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	COL4A1	P02462	1669 aa		20.93	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		20.93	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		20.93	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559		A0A087X0B3	334 aa		20.93	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	20.93	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	AFM	P43652	599 aa		20.93	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	CUL4B	Q13620	913 aa		20.93	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		20.93	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		20.93	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		20.93	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	IQUB	Q8NA54	791 aa		20.93	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF384	Q8TF68	577 aa		20.93	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	NYX	Q9GZU5	481 aa		20.93	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	NRAP	Q86VF7	1730 aa		20.93	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		20.92	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		20.92	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	20.92	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	SMIM22	K7EJ46	135 aa		20.92	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	MECOM	Q03112	1051 aa		20.92	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	NPY5R	Q15761	445 aa		20.92	■□□□□ 0.94
RRN3-205	ENST00000563559	SBK1	Q52WX2	424 aa		20.92	■□□□□ 0.94

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