RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
USP3-AS1-208ENST00000560962 CALM1P0DP23 149 aa20.72■□□□□ 0.91
USP3-AS1-208ENST00000560962 CALM2P0DP24 149 aa20.72■□□□□ 0.91
USP3-AS1-208ENST00000560962 CALM3P0DP25 149 aa20.72■□□□□ 0.91
USP3-AS1-208ENST00000560962 EIF6P56537 245 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
USP3-AS1-208ENST00000560962 TCP10Q12799 353 aa20.72■□□□□ 0.91
USP3-AS1-208ENST00000560962 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa20.72■□□□□ 0.91
USP3-AS1-208ENST00000560962 SYT17Q9BSW7 474 aa20.72■□□□□ 0.91
USP3-AS1-208ENST00000560962 ATRNL1Q5VV63 1379 aa20.72■□□□□ 0.91
USP3-AS1-208ENST00000560962 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
USP3-AS1-208ENST00000560962 TROAPQ12815 778 aa20.71■□□□□ 0.91
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
USP3-AS1-208ENST00000560962 PI4KBQ9UBF8 816 aa20.71■□□□□ 0.91
USP3-AS1-208ENST00000560962 PLIN4Q96Q06 1357 aa20.71■□□□□ 0.91
USP3-AS1-208ENST00000560962 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
USP3-AS1-208ENST00000560962 SPDYE2Q495Y8 402 aa20.71■□□□□ 0.91
USP3-AS1-208ENST00000560962 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
USP3-AS1-208ENST00000560962 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa20.71■□□□□ 0.91
USP3-AS1-208ENST00000560962 NBPF11Q86T75 865 aa20.71■□□□□ 0.91
USP3-AS1-208ENST00000560962 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMOD2Q9NZR1 351 aa20.71■□□□□ 0.91
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa20.7■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa20.7■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRIM22Q8IYM9 498 aa20.7■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 KAT14Q9H8E8 782 aa20.7■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 STK36Q9NRP7 1315 aa20.7■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 GUCY1A2P33402 732 aa20.69■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 SHMT1P34896 483 aa20.69■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 NOVP48745 357 aa20.69■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 FKBP1CQ5VVH2 108 aa20.69■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 RGS22Q8NE09 1264 aa20.69■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 DPF2Q92785 391 aa20.69■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 PLEKHA8P1O95397 391 aa20.69■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 LMNB1P20700 586 aa20.69■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 MYOZ2Q9NPC6 264 aa20.69■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 SIPA1L1O43166 1804 aa20.69■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 MBD3O95983 291 aa20.68■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 KRT40Q6A162 431 aa20.68■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 CLRN2A0PK11 232 aa20.67■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 WNT10BO00744 389 aa20.67■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 PNMA1Q8ND90 353 aa20.67■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 WASF1Q92558 559 aa20.67■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 MAP3K14Q99558 947 aa20.67■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP20.67■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 DNAJC18Q9H819 358 aa20.67■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 STX8Q9UNK0 236 aa20.67■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 MYH15Q9Y2K3 1946 aa20.67■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 MYO1BO43795 1136 aa20.67■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLURP2P0DP57 97 aa20.67■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRIM29Q14134 588 aa20.67■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM151AQ8WW52 585 aa20.67■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 SPATA32Q96LK8 384 aa20.67■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC17Q96LX7 622 aa20.67■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF541Q9H0D2 1346 aa20.66■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa20.66■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 SHTN1A0MZ66 631 aa20.66■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 KIF28PB7ZC32 967 aa20.66■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 TCP10L2B9ZVM9 353 aa20.66■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 DEXIO95424 95 aa20.66■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 AKR1B1P15121 316 aa20.66■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 UBE2HP62256 183 aa20.66■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 CEP95Q96GE4 821 aa20.66■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM47Q9BQJ4 181 aa20.66■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 MTMR7Q9Y216 660 aa20.66■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 MYH6P13533 1939 aa20.66■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 CNTNAP1P78357 1384 aa20.65■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa20.65■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 FUT2Q10981 343 aa20.65■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 TATDN1Q6P1N9 297 aa20.65■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMTC3Q6ZXV5 915 aa20.65■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM83AQ86UY5 434 aa20.65■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 GJA3Q9Y6H8 435 aa20.65■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 MYH8P13535 1937 aa20.65■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP20.64■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 MTMR4Q9NYA4 1195 aa20.64■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM63CQ9P1W3 806 aa20.64■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 CFAP45Q9UL16 551 aa20.64■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 V9GY48 417 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.9
USP3-AS1-208ENST00000560962 NBPF9Q3BBW0 867 aa20.64■□□□□ 0.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 MICALL2Q8IY33 904 aa20.64■□□□□ 0.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 CSRNP1Q96S65 589 aa20.64■□□□□ 0.89
USP3-AS1-208ENST00000560962 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms