RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	PROC	P04070	461 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	CDK5R2	Q13319	367 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	KCT2	Q8NC54	265 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	FAM13C	Q8NE31	585 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	GML	Q99445	158 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	ARHGEF11	O15085	1522 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	6.67	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	MLEC	Q14165	292 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	SLC6A19	Q695T7	634 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	SHISA5	Q8N114	240 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	CRBN	Q96SW2	442 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	FOXQ1	Q9C009	403 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	UACA	Q9BZF9	1416 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	FGR	P09769	529 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	ADM	P35318	185 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	ARSH	Q5FYA8	562 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	FBXL6	Q8N531	539 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	LRIG2	O94898	1065 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	ATP2B1	P20020	1258 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	ETFB	P38117	255 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	RIN3	Q8TB24	985 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	ATG4C	Q96DT6	458 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	SHD	Q96IW2	340 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	GMIP	Q9P107	970 aa		6.65	□□□□□ -1.34
LINS1-210	ENST00000560934	ATP10B	O94823	1461 aa		6.65	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	ABCA8	O94911	1581 aa		6.65	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	LEFTY1	O75610	366 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	IMPDH2	P12268	514 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	CAP2	P40123	477 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	GIPR	P48546	466 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	KIF2C	Q99661	725 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	MIPEP	Q99797	713 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	SLITRK5	O94991	958 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	FURIN	P09958	794 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	FAM87A	P0C7U9	286 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	6.63	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	RNF43	Q68DV7	783 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	CDH24	Q86UP0	819 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	GATA6	Q92908	595 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		6.62	□□□□□ -1.35
LINS1-210	ENST00000560934	FAM170B	A6NMN3	283 aa		6.62	□□□□□ -1.35

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