RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559573.3

FAM227B-208, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, human

TSL 3

Gene FAM227B, Length 2,204 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM227B-208	ENST00000559573	BACH2	Q9BYV9	841 aa		12.04	□□□□□ -0.48
FAM227B-208	ENST00000559573	USP17L5	A8MUK1	530 aa		12.03	□□□□□ -0.48
FAM227B-208	ENST00000559573	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
FAM227B-208	ENST00000559573	SNAPC2	Q13487	334 aa		12.03	□□□□□ -0.48
FAM227B-208	ENST00000559573	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
FAM227B-208	ENST00000559573	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		12.03	□□□□□ -0.48
FAM227B-208	ENST00000559573	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		12.03	□□□□□ -0.48
FAM227B-208	ENST00000559573	NEDD4	P46934	1319 aa		12.03	□□□□□ -0.48
FAM227B-208	ENST00000559573	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
FAM227B-208	ENST00000559573	GTF2A2	P52657	109 aa		12.03	□□□□□ -0.48
FAM227B-208	ENST00000559573	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
FAM227B-208	ENST00000559573	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
FAM227B-208	ENST00000559573	FEZ1	Q99689	392 aa		12.03	□□□□□ -0.48
FAM227B-208	ENST00000559573	EHD4	Q9H223	541 aa		12.03	□□□□□ -0.48
FAM227B-208	ENST00000559573	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
FAM227B-208	ENST00000559573	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		12.03	□□□□□ -0.48
FAM227B-208	ENST00000559573	ASNS	P08243	561 aa		12.02	□□□□□ -0.48
FAM227B-208	ENST00000559573	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.48
FAM227B-208	ENST00000559573	CTGF	P29279	349 aa		12.02	□□□□□ -0.48
FAM227B-208	ENST00000559573	TFAP4	Q01664	338 aa		12.02	□□□□□ -0.48
FAM227B-208	ENST00000559573	CEP95	Q96GE4	821 aa		12.02	□□□□□ -0.48
FAM227B-208	ENST00000559573	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		12.02	□□□□□ -0.48
FAM227B-208	ENST00000559573	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		12.02	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	LAMB1	P07942	1786 aa		12.02	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	SGSM2	O43147	1006 aa		12.01	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	GNAT2	P19087	354 aa		12.01	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	BACE1	P56817	501 aa		12.01	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	NFKBIB	Q15653	356 aa		12.01	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		12.01	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		12.01	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		12.01	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		12.01	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		12.01	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		12.01	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573		B4E1Z4	1266 aa		12.01	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	USP17L10	C9JJH3	530 aa		12.01	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	CETP	P11597	493 aa		12.01	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	ICA1	Q05084	483 aa		12.01	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	SREBF2	Q12772	1141 aa		12.01	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	SBK1	Q52WX2	424 aa		12.01	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		12.01	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	CABP5	Q9NP86	173 aa		12.01	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	LAMA3	Q16787	3333 aa		12	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	CYP21A2	P08686	494 aa		12	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	SNAP25	P60880	206 aa		12	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		12	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		12	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	CERS3	Q8IU89	383 aa		12	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		12	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		12	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		12	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	SENP2	Q9HC62	589 aa		12	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	STX8	Q9UNK0	236 aa		12	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	TSPY2	A6NKD2	308 aa		11.99	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	GPR25	O00155	361 aa		11.99	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	CAPN15	O75808	1086 aa		11.99	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	TSPY3	P0CV98	308 aa		11.99	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	TSPY8	P0CW00	308 aa		11.99	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	SLC4A3	P48751	1232 aa		11.99	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	CPVL	Q9H3G5	476 aa		11.99	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		11.99	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF213	O14771	459 aa		11.99	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	DTNB	O60941	627 aa		11.99	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	KDM4A	O75164	1064 aa		11.99	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	CPA1	P15085	419 aa		11.99	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	VCAM1	P19320	739 aa		11.99	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		11.99	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		11.99	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	SEC24B	O95487	1268 aa		11.98	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573		Q3C1V9	767 aa		11.98	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		11.98	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	11.98	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	MYH4	Q9Y623	1939 aa		11.98	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		11.98	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	CXCL11	O14625	94 aa		11.98	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	CA12	O43570	354 aa		11.98	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		11.98	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		11.98	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		11.98	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
FAM227B-208	ENST00000559573	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		11.98	□□□□□ -0.49

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms