RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551473.5

CS-228, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-228ENST00000551473 GNAI3P08754 354 aa14.63□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 PI16Q6UXB8 463 aa14.63□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 CERS3Q8IU89 383 aa14.63□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 SLC5A4Q9NY91 659 aa14.63□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 FLRT1Q9NZU1 646 aa14.63□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 CNMDO75829 334 aa14.62□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 CYBAP13498 195 aa14.62□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 JAG1P78504 1218 aa14.62□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 SNX17Q15036 470 aa14.62□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 TJAP1Q5JTD0 557 aa14.62□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 C9orf50Q5SZB4 431 aa14.62□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 C1orf53Q5VUE5 145 aa14.62□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 OLFML2BQ68BL8 750 aa14.62□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa14.62□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 DPP9Q86TI2 863 aa14.62□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 BADQ92934 168 aa14.62□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 FRMPD3Q5JV73 1810 aa14.62□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 STRNO43815 780 aa14.61□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 GH2P01242 217 aa14.61□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 CYP2C19P33261 490 aa14.61□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 MCAMP43121 646 aa14.61□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 MTX1Q13505 466 aa14.61□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa14.61□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 PALD1Q9ULE6 856 aa14.61□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa14.61□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 LTBP2Q14767 1821 aa14.6□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 SEPT4O43236 478 aa14.6□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 TRIM60Q495X7 471 aa14.6□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 CCDC158Q5M9N0 1113 aa14.6□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 POTEEQ6S8J3 1075 aa14.6□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 NPLOC4Q8TAT6 608 aa14.6□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 MEIS3Q99687 375 aa14.6□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 CABP5Q9NP86 173 aa14.6□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 PDLIM7Q9NR12 457 aa14.6□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 TACC3Q9Y6A5 838 aa14.6□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 TNFRSF10AO00220 468 aa14.59□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 VCAM1P19320 739 aa14.59□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 RAB3GAP1Q15042 981 aa14.59□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 TTC39AQ5SRH9 613 aa14.59□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 TATDN1Q6P1N9 297 aa14.59□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 TRPV1Q8NER1 839 aa14.59□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 EHD4Q9H223 541 aa14.59□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 SIPA1L1O43166 1804 aa14.59□□□□□ -0.07
CS-228ENST00000551473 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 IGHA2P01877 340 aa14.58□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 COL9A1P20849 921 aa14.58□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 ADORA2AP29274 412 aa14.58□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 SLFN5Q08AF3 891 aa14.58□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 SHCBP1Q8NEM2 672 aa14.58□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 HOXC10Q9NYD6 342 aa14.58□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 BTBD7Q9P203 1132 aa14.58□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 SERPINB13Q9UIV8 391 aa14.58□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 CLTBP09497 229 aa14.57□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 ADCYAP1R1P41586 468 aa14.57□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 USP5P45974 858 aa14.57□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 ABCB5Q2M3G0 1257 aa14.57□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 TTC6Q86TZ1 520 aa14.57□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 NRBP1Q9UHY1 535 aa14.57□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 VCANP13611 3396 aa14.57□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 TRIM43BA6NCK2 446 aa14.56□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 RAG1P15918 1043 aa14.56□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 COG2Q14746 738 aa14.56□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 LRRC41Q15345 812 aa14.56□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 RNF180Q86T96 592 aa14.56□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 ABRAQ8N0Z2 381 aa14.56□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 MB21D1Q8N884 522 aa14.56□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 SPATC1LQ9H0A9 340 aa14.56□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 MROH8Q9H579 483 aa14.56□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 GPR108Q9NPR9 543 aa14.56□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 RLFQ13129 1914 aa14.56□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 ZNF236Q9UL36 1845 aa14.55□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 TLE2Q04725 743 aa14.55□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 FPGSQ05932 587 aa14.55□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 ANO1Q5XXA6 986 aa14.55□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa14.55□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 ADGRA1Q86SQ6 560 aa14.55□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 SNRKQ9NRH2 765 aa14.55□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 PHF24Q9UPV7 400 aa14.55□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 KIAA0355O15063 1070 aa14.54□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 GNAI2P04899 355 aa14.54□□□□□ -0.08
CS-228ENST00000551473 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms