RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551155.1

CS-224, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-224ENST00000551155 PTPN18Q99952 460 aa11.11□□□□□ -0.63
CS-224ENST00000551155 TMOD4Q9NZQ9 345 aa11.11□□□□□ -0.63
CS-224ENST00000551155 LAMA4Q16363 1823 aa11.11□□□□□ -0.63
CS-224ENST00000551155 BTBD19C9JJ37 291 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-224ENST00000551155 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP11.1□□□□□ -0.63
CS-224ENST00000551155 SGSM2O43147 1006 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-224ENST00000551155 RASA1P20936 1047 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-224ENST00000551155 NT5C2P49902 561 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-224ENST00000551155 USP14P54578 494 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-224ENST00000551155 JAG1P78504 1218 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-224ENST00000551155 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP11.1□□□□□ -0.63
CS-224ENST00000551155 SEPT2Q15019 361 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-224ENST00000551155 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
CS-224ENST00000551155 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
CS-224ENST00000551155 SH3D19Q5HYK7 790 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-224ENST00000551155 GADL1Q6ZQY3 521 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-224ENST00000551155 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
CS-224ENST00000551155 SKAP1Q86WV1 359 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-224ENST00000551155 STK11IPQ8N1F8 1099 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-224ENST00000551155 FEZ1Q99689 392 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-224ENST00000551155 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
CS-224ENST00000551155 SH2D4AQ9H788 454 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-224ENST00000551155 KANSL2Q9H9L4 492 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-224ENST00000551155 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-224ENST00000551155 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-224ENST00000551155 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
CS-224ENST00000551155 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-224ENST00000551155 LOC285556D6RIA3 1793 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-224ENST00000551155 SMIM22K7EJ46 135 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-224ENST00000551155 PDHXO00330 501 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-224ENST00000551155 CDC45O75419 566 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-224ENST00000551155 TSPY3P0CV98 308 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-224ENST00000551155 TSPY8P0CW00 308 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-224ENST00000551155 AKR1B1P15121 316 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-224ENST00000551155 MTMR2Q13614 643 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-224ENST00000551155 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
CS-224ENST00000551155 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-224ENST00000551155 USP17L2Q6R6M4 530 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-224ENST00000551155 MFSD6Q6ZSS7 791 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-224ENST00000551155 FAM43AQ8N2R8 423 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-224ENST00000551155 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-224ENST00000551155 PNMA3Q9UL41 463 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-224ENST00000551155 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-224ENST00000551155 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
CS-224ENST00000551155 MYH4Q9Y623 1939 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 TSPY2A6NKD2 308 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 ORC4O43929 436 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 PRDM1O75626 825 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 TBC1D8O95759 1140 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 FGRP09769 529 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 GUCY1A2P33402 732 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 LBX1P52954 281 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 HMGCS2P54868 508 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 TFAP4Q01664 338 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 ICA1Q05084 483 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 CTDSPL2Q05D32 466 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 MOGSQ13724 837 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 AKNAD1Q5T1N1 836 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 PRDM10Q9NQV6 1147 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 TOMM22Q9NS69 142 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 OSBPP22059 807 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 HAND2P61296 217 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 CRHR2Q13324 411 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 GPAT2Q6NUI2 795 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 NEDD1Q8NHV4 660 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 STAG1Q8WVM7 1258 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 LPAR1Q92633 364 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 MAP4K1Q92918 833 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 C12orf42Q96LP6 360 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 IL25Q9H293 177 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 CNNM2Q9H8M5 875 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 NYAP2Q9P242 653 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 TSKSQ9UJT2 592 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP11.07□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 TMX2Q9Y320 296 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 PLIN4Q96Q06 1357 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 GPR25O00155 361 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 TLR2O60603 784 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 TTLL1O95922 423 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 EEF2P13639 858 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 ATP2B2Q01814 1243 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 PTH1RQ03431 593 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 ACER1Q8TDN7 264 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 ESR2Q92731 530 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 KRT23Q9C075 422 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 GOPCQ9HD26 462 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 EMILIN3Q9NT22 766 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 MTMR4Q9NYA4 1195 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 A0A1W2PRG0 241 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-224ENST00000551155 USP17L15C9J2P7 530 aa11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms