RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543190.5

LTBR-211, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LTBR, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-211ENST00000543190 LAMA3Q16787 3333 aa22.62■■□□□ 1.21
LTBR-211ENST00000543190 USP17L15C9J2P7 530 aa22.62■■□□□ 1.21
LTBR-211ENST00000543190 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.62■■□□□ 1.21
LTBR-211ENST00000543190 USP17L11C9JVI0 530 aa22.62■■□□□ 1.21
LTBR-211ENST00000543190 USP17L18D6R9N7 530 aa22.62■■□□□ 1.21
LTBR-211ENST00000543190 USP17L22D6RA61 530 aa22.62■■□□□ 1.21
LTBR-211ENST00000543190 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.62■■□□□ 1.21
LTBR-211ENST00000543190 USP17L19D6RCP7 530 aa22.62■■□□□ 1.21
LTBR-211ENST00000543190 USP17L20D6RJB6 530 aa22.62■■□□□ 1.21
LTBR-211ENST00000543190 PLCD1P51178 756 aa22.62■■□□□ 1.21
LTBR-211ENST00000543190 USP17L24Q0WX57 530 aa22.62■■□□□ 1.21
LTBR-211ENST00000543190 ABCB5Q2M3G0 1257 aa22.62■■□□□ 1.21
LTBR-211ENST00000543190 MORN1Q5T089 497 aa22.62■■□□□ 1.21
LTBR-211ENST00000543190 DPF3Q92784 378 aa22.62■■□□□ 1.21
LTBR-211ENST00000543190 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
LTBR-211ENST00000543190 ZNF236Q9UL36 1845 aa22.61■■□□□ 1.21
LTBR-211ENST00000543190 A0A0G2JMZ2 1700 aa22.61■■□□□ 1.21
LTBR-211ENST00000543190 A0A1W2PPC1 479 aa22.61■■□□□ 1.21
LTBR-211ENST00000543190 ATP5JP18859 108 aa22.61■■□□□ 1.21
LTBR-211ENST00000543190 PDE3AQ14432 1141 aa22.61■■□□□ 1.21
LTBR-211ENST00000543190 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.61■■□□□ 1.21
LTBR-211ENST00000543190 TRIB2Q92519 343 aa22.61■■□□□ 1.21
LTBR-211ENST00000543190 PARP14Q460N5 1801 aa22.61■■□□□ 1.21
LTBR-211ENST00000543190 FRMPD3Q5JV73 1810 aa22.6■■□□□ 1.21
LTBR-211ENST00000543190 TFRCP02786 760 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
LTBR-211ENST00000543190 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
LTBR-211ENST00000543190 GUCY1A2P33402 732 aa22.6■■□□□ 1.21
LTBR-211ENST00000543190 CABP5Q9NP86 173 aa22.6■■□□□ 1.21
LTBR-211ENST00000543190 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
LTBR-211ENST00000543190 OGDHLQ9ULD0 1010 aa22.6■■□□□ 1.21
LTBR-211ENST00000543190 ZNF532Q9HCE3 1301 aa22.59■■□□□ 1.21
LTBR-211ENST00000543190 VCAM1P19320 739 aa22.59■■□□□ 1.21
LTBR-211ENST00000543190 Q3C1V9 767 aa22.59■■□□□ 1.21
LTBR-211ENST00000543190 GPR142Q7Z601 462 aa22.59■■□□□ 1.21
LTBR-211ENST00000543190 PORCNQ9H237 461 aa22.59■■□□□ 1.21
LTBR-211ENST00000543190 COG6Q9Y2V7 657 aa22.59■■□□□ 1.21
LTBR-211ENST00000543190 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
LTBR-211ENST00000543190 CCNA1P78396 465 aa22.58■■□□□ 1.21
LTBR-211ENST00000543190 NECAB2Q7Z6G3 386 aa22.58■■□□□ 1.21
LTBR-211ENST00000543190 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22.58■■□□□ 1.21
LTBR-211ENST00000543190 SWAP70Q9UH65 585 aa22.58■■□□□ 1.21
LTBR-211ENST00000543190 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.58■■□□□ 1.21
LTBR-211ENST00000543190 GOLIM4O00461 696 aa22.57■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 CNMDO75829 334 aa22.57■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 HOXC6P09630 235 aa22.57■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 ADD2P35612 726 aa22.57■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 RGS2P41220 211 aa22.57■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 PLEKHH3Q7Z736 793 aa22.57■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 APBA2Q99767 749 aa22.57■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 HAUS7Q99871 368 aa22.57■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 PAG1Q9NWQ8 432 aa22.57■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 IGHA2P01877 340 aa22.56■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.56■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 UBE3CQ15386 1083 aa22.56■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 CHRDL2Q6WN34 429 aa22.56■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 FEZ1Q99689 392 aa22.56■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 MCM9Q9NXL9 1143 aa22.56■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 EVI5O60447 810 aa22.55■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 ACER1Q8TDN7 264 aa22.55■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.21e-6■■■□□ 15.4
LTBR-211ENST00000543190 NBPF3Q9H094 633 aa22.55■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 CYP2B6P20813 491 aa22.54■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 TRIM32Q13049 653 aa22.54■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.54■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 LCORLQ8N3X6 602 aa22.54■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 DNAH12Q6ZR08 3092 aa22.53■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 SLC15A5A6NIM6 579 aa22.53■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 PEX10O60683 326 aa22.53■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 MAP2K5Q13163 448 aa22.53■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 SEPT2Q15019 361 aa22.53■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 SDR42E1Q8WUS8 393 aa22.53■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 LPAR1Q92633 364 aa22.53■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 CCDC17Q96LX7 622 aa22.53■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.53■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 A0A1W2PRG0 241 aa22.52■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 COL6A1P12109 1028 aa22.52■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 PTPREP23469 700 aa22.52■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 GRB14Q14449 540 aa22.52■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 C12orf60Q5U649 245 aa22.52■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 MB21D1Q8N884 522 aa22.52■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 PAGR1Q9BTK6 254 aa22.52■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.52■■□□□ 1.2
LTBR-211ENST00000543190 STRNO43815 780 aa22.51■■□□□ 1.19
LTBR-211ENST00000543190 BMP8BP34820 402 aa22.51■■□□□ 1.19
LTBR-211ENST00000543190 COG2Q14746 738 aa22.51■■□□□ 1.19
LTBR-211ENST00000543190 LHX8Q68G74 356 aa22.51■■□□□ 1.19
LTBR-211ENST00000543190 SHCBP1Q8NEM2 672 aa22.51■■□□□ 1.19
LTBR-211ENST00000543190 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
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