RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534219.5

PTPRJ-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRJ, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-206ENST00000534219 USP17L15C9J2P7 530 aa30.03■■■□□ 2.4
PTPRJ-206ENST00000534219 USP17L13C9JLJ4 530 aa30.03■■■□□ 2.4
PTPRJ-206ENST00000534219 USP17L11C9JVI0 530 aa30.03■■■□□ 2.4
PTPRJ-206ENST00000534219 USP17L18D6R9N7 530 aa30.03■■■□□ 2.4
PTPRJ-206ENST00000534219 USP17L22D6RA61 530 aa30.03■■■□□ 2.4
PTPRJ-206ENST00000534219 USP17L17D6RBQ6 530 aa30.03■■■□□ 2.4
PTPRJ-206ENST00000534219 USP17L19D6RCP7 530 aa30.03■■■□□ 2.4
PTPRJ-206ENST00000534219 USP17L20D6RJB6 530 aa30.03■■■□□ 2.4
PTPRJ-206ENST00000534219 INHAP05111 366 aa30.03■■■□□ 2.4
PTPRJ-206ENST00000534219 GUCY1A2P33402 732 aa30.03■■■□□ 2.4
PTPRJ-206ENST00000534219 USP17L24Q0WX57 530 aa30.03■■■□□ 2.4
PTPRJ-206ENST00000534219 SLC44A5Q8NCS7 719 aa30.03■■■□□ 2.4
PTPRJ-206ENST00000534219 PAGR1Q9BTK6 254 aa30.03■■■□□ 2.4
PTPRJ-206ENST00000534219 TXNRD2Q9NNW7 524 aa30.03■■■□□ 2.4
PTPRJ-206ENST00000534219 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
PTPRJ-206ENST00000534219 GJB1P08034 283 aa30.02■■■□□ 2.4
PTPRJ-206ENST00000534219 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
PTPRJ-206ENST00000534219 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
PTPRJ-206ENST00000534219 RBPJLQ9UBG7 517 aa30.02■■■□□ 2.4
PTPRJ-206ENST00000534219 NAV1Q8NEY1 1877 aa30.02■■■□□ 2.4
PTPRJ-206ENST00000534219 USP17L12C9JPN9 530 aa30.01■■■□□ 2.39
PTPRJ-206ENST00000534219 USP17L21D6R901 530 aa30.01■■■□□ 2.39
PTPRJ-206ENST00000534219 KBTBD3Q8NAB2 608 aa30.01■■■□□ 2.39
PTPRJ-206ENST00000534219 UNC93B1Q9H1C4 597 aa30.01■■■□□ 2.39
PTPRJ-206ENST00000534219 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
PTPRJ-206ENST00000534219 MGAMO43451 1857 aa30■■■□□ 2.39
PTPRJ-206ENST00000534219 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa30■■■□□ 2.39
PTPRJ-206ENST00000534219 VCAM1P19320 739 aa30■■■□□ 2.39
PTPRJ-206ENST00000534219 GJA8P48165 433 aa30■■■□□ 2.39
PTPRJ-206ENST00000534219 CRBNQ96SW2 442 aa30■■■□□ 2.39
PTPRJ-206ENST00000534219 ERVK-9P63128 1117 aa29.99■■■□□ 2.39
PTPRJ-206ENST00000534219 ERVK-24P63145 666 aa29.99■■■□□ 2.39
PTPRJ-206ENST00000534219 C12orf60Q5U649 245 aa29.99■■■□□ 2.39
PTPRJ-206ENST00000534219 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa29.99■■■□□ 2.39
PTPRJ-206ENST00000534219 TMEM179Q6ZVK1 233 aa29.99■■■□□ 2.39
PTPRJ-206ENST00000534219 SHISA4Q96DD7 197 aa29.99■■■□□ 2.39
PTPRJ-206ENST00000534219 Q3C1V9 767 aa29.98■■■□□ 2.39
PTPRJ-206ENST00000534219 GJD2Q9UKL4 321 aa29.98■■■□□ 2.39
PTPRJ-206ENST00000534219 MAPK4P31152 587 aa29.97■■■□□ 2.39
PTPRJ-206ENST00000534219 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
PTPRJ-206ENST00000534219 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
PTPRJ-206ENST00000534219 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
PTPRJ-206ENST00000534219 A0A1W2PRG0 241 aa29.96■■■□□ 2.39
PTPRJ-206ENST00000534219 SMIM22K7EJ46 135 aa29.96■■■□□ 2.39
PTPRJ-206ENST00000534219 ERC2O15083 957 aa29.96■■■□□ 2.39
PTPRJ-206ENST00000534219 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
PTPRJ-206ENST00000534219 AKR1B1P15121 316 aa29.96■■■□□ 2.39
PTPRJ-206ENST00000534219 CDK8P49336 464 aa29.96■■■□□ 2.39
PTPRJ-206ENST00000534219 CTR9Q6PD62 1173 aa29.96■■■□□ 2.39
PTPRJ-206ENST00000534219 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
PTPRJ-206ENST00000534219 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
PTPRJ-206ENST00000534219 TTC41PQ6P2S7 1318 aa29.96■■■□□ 2.39
PTPRJ-206ENST00000534219 CYP2B6P20813 491 aa29.95■■■□□ 2.39
PTPRJ-206ENST00000534219 APPBP2Q92624 585 aa29.95■■■□□ 2.39
PTPRJ-206ENST00000534219 NUDT12Q9BQG2 462 aa29.95■■■□□ 2.39
PTPRJ-206ENST00000534219 PORCNQ9H237 461 aa29.95■■■□□ 2.39
PTPRJ-206ENST00000534219 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa29.95■■■□□ 2.39
PTPRJ-206ENST00000534219 SGPL1O95470 568 aa29.94■■■□□ 2.38
PTPRJ-206ENST00000534219 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
PTPRJ-206ENST00000534219 POTEEQ6S8J3 1075 aa29.94■■■□□ 2.38
PTPRJ-206ENST00000534219 C16orf86Q6ZW13 317 aa29.94■■■□□ 2.38
PTPRJ-206ENST00000534219 OSBP2Q969R2 916 aa29.94■■■□□ 2.38
PTPRJ-206ENST00000534219 CCDC17Q96LX7 622 aa29.94■■■□□ 2.38
PTPRJ-206ENST00000534219 DEFB118Q96PH6 123 aa29.94■■■□□ 2.38
PTPRJ-206ENST00000534219 HMGCRP04035 888 aa29.93■■■□□ 2.38
PTPRJ-206ENST00000534219 ICA1Q05084 483 aa29.93■■■□□ 2.38
PTPRJ-206ENST00000534219 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
PTPRJ-206ENST00000534219 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
PTPRJ-206ENST00000534219 SOCS4Q8WXH5 440 aa29.93■■■□□ 2.38
PTPRJ-206ENST00000534219 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa29.93■■■□□ 2.38
PTPRJ-206ENST00000534219 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
PTPRJ-206ENST00000534219 TFRCP02786 760 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
PTPRJ-206ENST00000534219 CCNA1P78396 465 aa29.92■■■□□ 2.38
PTPRJ-206ENST00000534219 GPR142Q7Z601 462 aa29.92■■■□□ 2.38
PTPRJ-206ENST00000534219 PLEKHH3Q7Z736 793 aa29.92■■■□□ 2.38
PTPRJ-206ENST00000534219 CLEC10AQ8IUN9 316 aa29.92■■■□□ 2.38
PTPRJ-206ENST00000534219 TANGO6Q9C0B7 1094 aa29.92■■■□□ 2.38
PTPRJ-206ENST00000534219 CNMDO75829 334 aa29.91■■■□□ 2.38
PTPRJ-206ENST00000534219 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
PTPRJ-206ENST00000534219 ANKRD45Q5TZF3 282 aa29.91■■■□□ 2.38
PTPRJ-206ENST00000534219 WDR78Q5VTH9 848 aa29.91■■■□□ 2.38
PTPRJ-206ENST00000534219 PI4K2BQ8TCG2 481 aa29.91■■■□□ 2.38
PTPRJ-206ENST00000534219 SH2D4AQ9H788 454 aa29.91■■■□□ 2.38
PTPRJ-206ENST00000534219 GSG1L2A8MUP6 293 aa29.9■■■□□ 2.38
PTPRJ-206ENST00000534219 MX1P20591 662 aa29.9■■■□□ 2.38
PTPRJ-206ENST00000534219 ATP2B2Q01814 1243 aa29.9■■■□□ 2.38
PTPRJ-206ENST00000534219 STK11IPQ8N1F8 1099 aa29.9■■■□□ 2.38
PTPRJ-206ENST00000534219 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
PTPRJ-206ENST00000534219 MINDY4BA8MYZ0 360 aa29.89■■■□□ 2.38
PTPRJ-206ENST00000534219 GPAA1O43292 621 aa29.89■■■□□ 2.38
PTPRJ-206ENST00000534219 APPP05067 770 aa29.89■■■□□ 2.38
PTPRJ-206ENST00000534219 TRIM32Q13049 653 aa29.89■■■□□ 2.38
PTPRJ-206ENST00000534219 COG2Q14746 738 aa29.89■■■□□ 2.38
PTPRJ-206ENST00000534219 TRIB2Q92519 343 aa29.89■■■□□ 2.38
PTPRJ-206ENST00000534219 FSD1Q9BTV5 496 aa29.89■■■□□ 2.38
PTPRJ-206ENST00000534219 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP29.89■■■□□ 2.38
PTPRJ-206ENST00000534219 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
PTPRJ-206ENST00000534219 HOXC10Q9NYD6 342 aa29.89■■■□□ 2.38
PTPRJ-206ENST00000534219 BTBD7Q9P203 1132 aa29.89■■■□□ 2.38
PTPRJ-206ENST00000534219 M0R2C6 588 aa29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms