RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531897.5

PUF60-216, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 5

Gene PUF60, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-216ENST00000531897 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP26.61■■□□□ 1.85
PUF60-216ENST00000531897 PLIN4Q96Q06 1357 aa26.6■■□□□ 1.85
PUF60-216ENST00000531897 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP26.6■■□□□ 1.85
PUF60-216ENST00000531897 PRDM1O75626 825 aa26.6■■□□□ 1.85
PUF60-216ENST00000531897 TSPY3P0CV98 308 aa26.6■■□□□ 1.85
PUF60-216ENST00000531897 TSPY8P0CW00 308 aa26.6■■□□□ 1.85
PUF60-216ENST00000531897 HAND2P61296 217 aa26.6■■□□□ 1.85
PUF60-216ENST00000531897 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP26.6■■□□□ 1.857e-6■■■□□ 16
PUF60-216ENST00000531897 MTMR2Q13614 643 aa26.6■■□□□ 1.85
PUF60-216ENST00000531897 AKNAD1Q5T1N1 836 aa26.6■■□□□ 1.85
PUF60-216ENST00000531897 GADL1Q6ZQY3 521 aa26.6■■□□□ 1.85
PUF60-216ENST00000531897 MFSD6Q6ZSS7 791 aa26.6■■□□□ 1.85
PUF60-216ENST00000531897 STAG1Q8WVM7 1258 aa26.6■■□□□ 1.85
PUF60-216ENST00000531897 TOMM22Q9NS69 142 aa26.6■■□□□ 1.85
PUF60-216ENST00000531897 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa26.6■■□□□ 1.85
PUF60-216ENST00000531897 FGRP09769 529 aa26.59■■□□□ 1.85
PUF60-216ENST00000531897 GUCY1A2P33402 732 aa26.59■■□□□ 1.85
PUF60-216ENST00000531897 USP17L2Q6R6M4 530 aa26.59■■□□□ 1.85
PUF60-216ENST00000531897 PTPN18Q99952 460 aa26.59■■□□□ 1.85
PUF60-216ENST00000531897 CFHR5Q9BXR6 569 aa26.59■■□□□ 1.85
PUF60-216ENST00000531897 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa26.59■■□□□ 1.85
PUF60-216ENST00000531897 ANO2Q9NQ90 1003 aa26.59■■□□□ 1.85
PUF60-216ENST00000531897 PCNTO95613 3336 aa26.59■■□□□ 1.85
PUF60-216ENST00000531897 PTPRFP10586 1907 aa26.59■■□□□ 1.85
PUF60-216ENST00000531897 TSPY2A6NKD2 308 aa26.58■■□□□ 1.85
PUF60-216ENST00000531897 BTBD19C9JJ37 291 aa26.58■■□□□ 1.85
PUF60-216ENST00000531897 TRPA1O75762 1119 aa26.58■■□□□ 1.85
PUF60-216ENST00000531897 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
PUF60-216ENST00000531897 HMGCS2P54868 508 aa26.58■■□□□ 1.85
PUF60-216ENST00000531897 MAP4K1Q92918 833 aa26.58■■□□□ 1.85
PUF60-216ENST00000531897 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa26.58■■□□□ 1.85
PUF60-216ENST00000531897 LOC285556D6RIA3 1793 aa26.57■■□□□ 1.84
PUF60-216ENST00000531897 PTH1RQ03431 593 aa26.57■■□□□ 1.84
PUF60-216ENST00000531897 NEDD1Q8NHV4 660 aa26.57■■□□□ 1.84
PUF60-216ENST00000531897 CNNM2Q9H8M5 875 aa26.57■■□□□ 1.84
PUF60-216ENST00000531897 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
PUF60-216ENST00000531897 TFAP4Q01664 338 aa26.56■■□□□ 1.84
PUF60-216ENST00000531897 MOGSQ13724 837 aa26.56■■□□□ 1.84
PUF60-216ENST00000531897 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
PUF60-216ENST00000531897 FAM43AQ8N2R8 423 aa26.56■■□□□ 1.84
PUF60-216ENST00000531897 ESR2Q92731 530 aa26.56■■□□□ 1.84
PUF60-216ENST00000531897 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
PUF60-216ENST00000531897 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa26.56■■□□□ 1.84
PUF60-216ENST00000531897 PNMA3Q9UL41 463 aa26.56■■□□□ 1.84
PUF60-216ENST00000531897 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
PUF60-216ENST00000531897 PDHXO00330 501 aa26.55■■□□□ 1.84
PUF60-216ENST00000531897 TBC1D10CQ8IV04 446 aa26.55■■□□□ 1.84
PUF60-216ENST00000531897 C12orf42Q96LP6 360 aa26.55■■□□□ 1.84
PUF60-216ENST00000531897 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
PUF60-216ENST00000531897 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa26.55■■□□□ 1.84
PUF60-216ENST00000531897 FOXN1O15353 648 aa26.54■■□□□ 1.84
PUF60-216ENST00000531897 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
PUF60-216ENST00000531897 ACER1Q8TDN7 264 aa26.54■■□□□ 1.84
PUF60-216ENST00000531897 KRT23Q9C075 422 aa26.54■■□□□ 1.84
PUF60-216ENST00000531897 NYAP2Q9P242 653 aa26.54■■□□□ 1.84
PUF60-216ENST00000531897 TMX2Q9Y320 296 aa26.54■■□□□ 1.84
PUF60-216ENST00000531897 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
PUF60-216ENST00000531897 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa26.53■■□□□ 1.84
PUF60-216ENST00000531897 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
PUF60-216ENST00000531897 REC8O95072 547 aa26.53■■□□□ 1.84
PUF60-216ENST00000531897 EEF2P13639 858 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
PUF60-216ENST00000531897 ATP2B2Q01814 1243 aa26.53■■□□□ 1.84
PUF60-216ENST00000531897 TRDNQ13061 729 aa26.53■■□□□ 1.84
PUF60-216ENST00000531897 FAM47AQ5JRC9 791 aa26.53■■□□□ 1.84
PUF60-216ENST00000531897 GPAT2Q6NUI2 795 aa26.53■■□□□ 1.84
PUF60-216ENST00000531897 LPAR1Q92633 364 aa26.53■■□□□ 1.84
PUF60-216ENST00000531897 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP26.53■■□□□ 1.84
PUF60-216ENST00000531897 NBPF3Q9H094 633 aa26.53■■□□□ 1.84
PUF60-216ENST00000531897 GOPCQ9HD26 462 aa26.53■■□□□ 1.84
PUF60-216ENST00000531897 TTLL1O95922 423 aa26.52■■□□□ 1.84
PUF60-216ENST00000531897 OSBPP22059 807 aa26.52■■□□□ 1.84
PUF60-216ENST00000531897 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
PUF60-216ENST00000531897 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
PUF60-216ENST00000531897 RNF20Q5VTR2 975 aa26.52■■□□□ 1.84
PUF60-216ENST00000531897 MTMR4Q9NYA4 1195 aa26.52■■□□□ 1.84
PUF60-216ENST00000531897 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
PUF60-216ENST00000531897 CRHR2Q13324 411 aa26.51■■□□□ 1.83
PUF60-216ENST00000531897 CCDC178Q5BJE1 867 aa26.51■■□□□ 1.83
PUF60-216ENST00000531897 CEP95Q96GE4 821 aa26.51■■□□□ 1.83
PUF60-216ENST00000531897 EMILIN3Q9NT22 766 aa26.51■■□□□ 1.83
PUF60-216ENST00000531897 NEDD4P46934 1319 aa26.5■■□□□ 1.83
PUF60-216ENST00000531897 A0A1W2PRG0 241 aa26.5■■□□□ 1.83
PUF60-216ENST00000531897 TBC1D8O95759 1140 aa26.5■■□□□ 1.83
PUF60-216ENST00000531897 CYP21A2P08686 494 aa26.5■■□□□ 1.83
PUF60-216ENST00000531897 CLEC10AQ8IUN9 316 aa26.5■■□□□ 1.83
PUF60-216ENST00000531897 VCPKMTQ9H867 229 aa26.5■■□□□ 1.83
PUF60-216ENST00000531897 INCENPQ9NQS7 918 aa26.5■■□□□ 1.83
PUF60-216ENST00000531897 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa26.5■■□□□ 1.83
PUF60-216ENST00000531897 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
PUF60-216ENST00000531897 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
PUF60-216ENST00000531897 TREML2Q5T2D2 321 aa26.49■■□□□ 1.83
PUF60-216ENST00000531897 IQCA1Q86XH1 822 aa26.49■■□□□ 1.83
PUF60-216ENST00000531897 CLIP2Q9UDT6 1046 aa26.49■■□□□ 1.83
PUF60-216ENST00000531897 TACC3Q9Y6A5 838 aa26.49■■□□□ 1.83
PUF60-216ENST00000531897 USP17L15C9J2P7 530 aa26.48■■□□□ 1.83
PUF60-216ENST00000531897 USP17L13C9JLJ4 530 aa26.48■■□□□ 1.83
PUF60-216ENST00000531897 USP17L11C9JVI0 530 aa26.48■■□□□ 1.83
PUF60-216ENST00000531897 USP17L18D6R9N7 530 aa26.48■■□□□ 1.83
PUF60-216ENST00000531897 USP17L22D6RA61 530 aa26.48■■□□□ 1.83
PUF60-216ENST00000531897 USP17L17D6RBQ6 530 aa26.48■■□□□ 1.83
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