RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525861.5

ACER3-204, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 2,058 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-204ENST00000525861 PLIN4Q96Q06 1357 aa26.93■■□□□ 1.9
ACER3-204ENST00000525861 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
ACER3-204ENST00000525861 NPM3O75607 178 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
ACER3-204ENST00000525861 HLA-DOAP06340 250 aa26.93■■□□□ 1.9
ACER3-204ENST00000525861 VIL1P09327 827 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
ACER3-204ENST00000525861 KIF5BP33176 963 aa26.93■■□□□ 1.9
ACER3-204ENST00000525861 RCOR1Q9UKL0 485 aa26.93■■□□□ 1.9
ACER3-204ENST00000525861 STX8Q9UNK0 236 aa26.93■■□□□ 1.9
ACER3-204ENST00000525861 MYSM1Q5VVJ2 828 aa26.92■■□□□ 1.9
ACER3-204ENST00000525861 CD2APQ9Y5K6 639 aa26.92■■□□□ 1.9
ACER3-204ENST00000525861 PSMD14O00487 310 aa26.91■■□□□ 1.9
ACER3-204ENST00000525861 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP26.91■■□□□ 1.9
ACER3-204ENST00000525861 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
ACER3-204ENST00000525861 MYH8P13535 1937 aa26.91■■□□□ 1.9
ACER3-204ENST00000525861 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa26.91■■□□□ 1.9
ACER3-204ENST00000525861 RAD17O75943 681 aa26.91■■□□□ 1.9
ACER3-204ENST00000525861 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
ACER3-204ENST00000525861 CFAP100Q494V2 611 aa26.91■■□□□ 1.9
ACER3-204ENST00000525861 TPRNQ4KMQ1 711 aa26.91■■□□□ 1.9
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ACER3-204ENST00000525861 NIM1KQ8IY84 436 aa26.91■■□□□ 1.9
ACER3-204ENST00000525861 TMEM47Q9BQJ4 181 aa26.91■■□□□ 1.9
ACER3-204ENST00000525861 EHD4Q9H223 541 aa26.91■■□□□ 1.9
ACER3-204ENST00000525861 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
ACER3-204ENST00000525861 ZNRF3Q9ULT6 936 aa26.91■■□□□ 1.9
ACER3-204ENST00000525861 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa26.9■■□□□ 1.9
ACER3-204ENST00000525861 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa26.9■■□□□ 1.9
ACER3-204ENST00000525861 MMP1P03956 469 aa26.9■■□□□ 1.9
ACER3-204ENST00000525861 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP26.9■■□□□ 1.93e-6■■■□□ 15.4
ACER3-204ENST00000525861 GAS2L3Q86XJ1 694 aa26.9■■□□□ 1.9
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ACER3-204ENST00000525861 GMLQ99445 158 aa26.9■■□□□ 1.9
ACER3-204ENST00000525861 FAM198AQ9UFP1 575 aa26.9■■□□□ 1.9
ACER3-204ENST00000525861 TAOK2Q9UL54 1235 aa26.9■■□□□ 1.9
ACER3-204ENST00000525861 NOVP48745 357 aa26.89■■□□□ 1.9
ACER3-204ENST00000525861 CACNB3P54284 484 aa26.89■■□□□ 1.9
ACER3-204ENST00000525861 PKN1Q16512 942 aa26.89■■□□□ 1.9
ACER3-204ENST00000525861 RTEL1Q9NZ71 1219 aa26.89■■□□□ 1.9
ACER3-204ENST00000525861 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 GRM4Q14833 912 aa26.89■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 ZFPM1Q8IX07 1006 aa26.89■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 PGBD1Q96JS3 809 aa26.89■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 TAOK3Q9H2K8 898 aa26.89■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 V9GY48 417 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP26.88■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 CCDC183Q5T5S1 534 aa26.88■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 CEP95Q96GE4 821 aa26.88■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 POLR3EQ9NVU0 708 aa26.88■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 XBP1P17861 261 aa26.88■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 SHMT1P34896 483 aa26.87■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 TCP10Q12799 353 aa26.87■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP26.87■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 SYCE3A1L190 88 aa26.86■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 PTGER2P43116 358 aa26.86■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 GNAQP50148 359 aa26.86■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 KLHL34Q8N239 644 aa26.86■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 HDAC9Q9UKV0 1011 aa26.86■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 KCNJ14Q9UNX9 436 aa26.86■■□□□ 1.89
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ACER3-204ENST00000525861 AKR1B1P15121 316 aa26.86■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 MAD2L2Q9UI95 211 aa26.86■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 SIPA1L1O43166 1804 aa26.86■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 YEATS4O95619 227 aa26.85■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 NASPP49321 788 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 PI4KBQ9UBF8 816 aa26.85■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa26.85■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 MRE11P49959 708 aa26.85■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 LRSAM1Q6UWE0 723 aa26.85■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 OGFOD1Q8N543 542 aa26.85■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 LINC00301Q8NCQ3 95 aa26.85■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 MTMR4Q9NYA4 1195 aa26.85■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa26.84■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 SPDYE2BA6NHP3 402 aa26.84■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 ENTPD3O75355 529 aa26.84■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 SPDYE6P0CI01 402 aa26.84■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 NOSTRINQ8IVI9 506 aa26.84■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 STAG2Q8N3U4 1231 aa26.84■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 AGBL3Q8NEM8 1001 aa26.84■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 CLIC4Q9Y696 253 aa26.84■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 BTBD18B2RXH4 712 aa26.83■■□□□ 1.89
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ACER3-204ENST00000525861 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa26.83■■□□□ 1.89
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ACER3-204ENST00000525861 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
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ACER3-204ENST00000525861 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 LIG1P18858 919 aa26.83■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 ANO1Q5XXA6 986 aa26.83■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 SHISA4Q96DD7 197 aa26.83■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 DNAJC18Q9H819 358 aa26.83■■□□□ 1.89
ACER3-204ENST00000525861 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
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