RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517323.2

TRPS1-206, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRPS1, Length 2,171 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-206ENST00000517323 RAB3GAP1Q15042 981 aa18.17■□□□□ 0.5
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TRPS1-206ENST00000517323 TATDN1Q6P1N9 297 aa18.17■□□□□ 0.5
TRPS1-206ENST00000517323 SGMS1Q86VZ5 419 aa18.17■□□□□ 0.5
TRPS1-206ENST00000517323 NEDD1Q8NHV4 660 aa18.17■□□□□ 0.5
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TRPS1-206ENST00000517323 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa18.16■□□□□ 0.5
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TRPS1-206ENST00000517323 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
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TRPS1-206ENST00000517323 GUCY1B3Q02153 619 aa18.1■□□□□ 0.49
TRPS1-206ENST00000517323 ICA1Q05084 483 aa18.1■□□□□ 0.49
TRPS1-206ENST00000517323 SLC35G1Q2M3R5 365 aa18.1■□□□□ 0.49
TRPS1-206ENST00000517323 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
TRPS1-206ENST00000517323 SPICE1Q8N0Z3 855 aa18.1■□□□□ 0.49
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