RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498678.5

HOXB3-212, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 2,196 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-212ENST00000498678 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
HOXB3-212ENST00000498678 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
HOXB3-212ENST00000498678 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
HOXB3-212ENST00000498678 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
HOXB3-212ENST00000498678 CFAP45Q9UL16 551 aa30.22■■■□□ 2.43
HOXB3-212ENST00000498678 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
HOXB3-212ENST00000498678 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
HOXB3-212ENST00000498678 SWAP70Q9UH65 585 aa30.22■■■□□ 2.43
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HOXB3-212ENST00000498678 TCP10Q12799 353 aa30.21■■■□□ 2.43
HOXB3-212ENST00000498678 SPATA32Q96LK8 384 aa30.21■■■□□ 2.43
HOXB3-212ENST00000498678 BCS1LQ9Y276 419 aa30.21■■■□□ 2.43
HOXB3-212ENST00000498678 ATL3Q6DD88 541 aa30.21■■■□□ 2.43
HOXB3-212ENST00000498678 TMEM47Q9BQJ4 181 aa30.21■■■□□ 2.43
HOXB3-212ENST00000498678 STX8Q9UNK0 236 aa30.21■■■□□ 2.43
HOXB3-212ENST00000498678 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
HOXB3-212ENST00000498678 KIF28PB7ZC32 967 aa30.2■■■□□ 2.43
HOXB3-212ENST00000498678 TRIM29Q14134 588 aa30.2■■■□□ 2.43
HOXB3-212ENST00000498678 MAP3K14Q99558 947 aa30.2■■■□□ 2.43
HOXB3-212ENST00000498678 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP30.2■■■□□ 2.43
HOXB3-212ENST00000498678 EHD4Q9H223 541 aa30.2■■■□□ 2.43
HOXB3-212ENST00000498678 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
HOXB3-212ENST00000498678 TMEM63CQ9P1W3 806 aa30.2■■■□□ 2.43
HOXB3-212ENST00000498678 MYH15Q9Y2K3 1946 aa30.2■■■□□ 2.42
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HOXB3-212ENST00000498678 BRAPQ7Z569 592 aa30.2■■■□□ 2.42
HOXB3-212ENST00000498678 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.42
HOXB3-212ENST00000498678 TAOK2Q9UL54 1235 aa30.2■■■□□ 2.42
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HOXB3-212ENST00000498678 CXCL9Q07325 125 aa30.19■■■□□ 2.42
HOXB3-212ENST00000498678 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
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HOXB3-212ENST00000498678 CEP95Q96GE4 821 aa30.18■■■□□ 2.42
HOXB3-212ENST00000498678 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
HOXB3-212ENST00000498678 SHMT1P34896 483 aa30.18■■■□□ 2.42
HOXB3-212ENST00000498678 PKN1Q16512 942 aa30.18■■■□□ 2.42
HOXB3-212ENST00000498678 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa30.18■■■□□ 2.42
HOXB3-212ENST00000498678 USP28Q96RU2 1077 aa30.18■■■□□ 2.42
HOXB3-212ENST00000498678 HDAC9Q9UKV0 1011 aa30.18■■■□□ 2.42
HOXB3-212ENST00000498678 KIF5BP33176 963 aa30.17■■■□□ 2.42
HOXB3-212ENST00000498678 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
HOXB3-212ENST00000498678 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa30.17■■■□□ 2.42
HOXB3-212ENST00000498678 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP30.17■■■□□ 2.42
HOXB3-212ENST00000498678 V9GY48 417 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
HOXB3-212ENST00000498678 SPDYE2BA6NHP3 402 aa30.17■■■□□ 2.42
HOXB3-212ENST00000498678 SPDYE6P0CI01 402 aa30.17■■■□□ 2.42
HOXB3-212ENST00000498678 AKR1B1P15121 316 aa30.17■■■□□ 2.42
HOXB3-212ENST00000498678 TPRNQ4KMQ1 711 aa30.17■■■□□ 2.42
HOXB3-212ENST00000498678 OGFOD1Q8N543 542 aa30.17■■■□□ 2.42
HOXB3-212ENST00000498678 AGBL3Q8NEM8 1001 aa30.17■■■□□ 2.42
HOXB3-212ENST00000498678 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa30.16■■■□□ 2.42
HOXB3-212ENST00000498678 GRM4Q14833 912 aa30.16■■■□□ 2.42
HOXB3-212ENST00000498678 JDP2Q8WYK2 163 aa30.16■■■□□ 2.42
HOXB3-212ENST00000498678 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
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HOXB3-212ENST00000498678 RCOR1Q9UKL0 485 aa30.15■■■□□ 2.42
HOXB3-212ENST00000498678 ENTPD3O75355 529 aa30.15■■■□□ 2.42
HOXB3-212ENST00000498678 NLGN2Q8NFZ4 835 aa30.15■■■□□ 2.42
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HOXB3-212ENST00000498678 SLURP2P0DP57 97 aa30.14■■■□□ 2.42
HOXB3-212ENST00000498678 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP30.14■■■□□ 2.422e-6■□□□□ 10.7
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HOXB3-212ENST00000498678 DNAJC18Q9H819 358 aa30.14■■■□□ 2.42
HOXB3-212ENST00000498678 TOP1P11387 765 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.41
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HOXB3-212ENST00000498678 MTMR4Q9NYA4 1195 aa30.14■■■□□ 2.41
HOXB3-212ENST00000498678 MAD2L2Q9UI95 211 aa30.14■■■□□ 2.41
HOXB3-212ENST00000498678 KCNJ14Q9UNX9 436 aa30.14■■■□□ 2.41
HOXB3-212ENST00000498678 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa30.13■■■□□ 2.41
HOXB3-212ENST00000498678 CIAPIN1Q6FI81 312 aa30.13■■■□□ 2.41
HOXB3-212ENST00000498678 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
HOXB3-212ENST00000498678 STAG2Q8N3U4 1231 aa30.13■■■□□ 2.41
HOXB3-212ENST00000498678 SIPA1L1O43166 1804 aa30.13■■■□□ 2.41
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HOXB3-212ENST00000498678 FSD2A1L4K1 749 aa30.13■■■□□ 2.41
HOXB3-212ENST00000498678 ZNF445P59923 1031 aa30.12■■■□□ 2.41
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HOXB3-212ENST00000498678 PGBD1Q96JS3 809 aa30.12■■■□□ 2.41
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HOXB3-212ENST00000498678 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
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HOXB3-212ENST00000498678 MTMR14Q8NCE2 650 aa30.1■■■□□ 2.41
HOXB3-212ENST00000498678 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
HOXB3-212ENST00000498678 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP30.1■■■□□ 2.41
HOXB3-212ENST00000498678 CCDC17Q96LX7 622 aa30.1■■■□□ 2.41
HOXB3-212ENST00000498678 TMOD2Q9NZR1 351 aa30.1■■■□□ 2.41
HOXB3-212ENST00000498678 MTMR7Q9Y216 660 aa30.1■■■□□ 2.41
HOXB3-212ENST00000498678 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa30.09■■■□□ 2.41
HOXB3-212ENST00000498678 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa30.09■■■□□ 2.41
HOXB3-212ENST00000498678 BTBD18B2RXH4 712 aa30.09■■■□□ 2.41
HOXB3-212ENST00000498678 RASSF7Q02833 373 aa30.09■■■□□ 2.41
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