RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497453.1

UBE2Q1-207, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 5

Gene UBE2Q1, Length 830 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-207ENST00000497453 ALX1Q15699 326 aa21.29■■□□□ 1
UBE2Q1-207ENST00000497453 USP17L2Q6R6M4 530 aa21.29■■□□□ 1
UBE2Q1-207ENST00000497453 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
UBE2Q1-207ENST00000497453 FEZ1Q99689 392 aa21.29■■□□□ 1
UBE2Q1-207ENST00000497453 MKNK2Q9HBH9 465 aa21.29■■□□□ 1
UBE2Q1-207ENST00000497453 EMILIN3Q9NT22 766 aa21.29■■□□□ 1
UBE2Q1-207ENST00000497453 CPA4Q9UI42 421 aa21.29■■□□□ 1
UBE2Q1-207ENST00000497453 RASA1P20936 1047 aa21.28■■□□□ 1
UBE2Q1-207ENST00000497453 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
UBE2Q1-207ENST00000497453 C17orf99Q6UX52 265 aa21.28■■□□□ 1
UBE2Q1-207ENST00000497453 SKAP1Q86WV1 359 aa21.28■■□□□ 1
UBE2Q1-207ENST00000497453 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP21.27■■□□□ 1
UBE2Q1-207ENST00000497453 CLEC10AQ8IUN9 316 aa21.27■■□□□ 1
UBE2Q1-207ENST00000497453 CD99L2Q8TCZ2 262 aa21.27■■□□□ 1
UBE2Q1-207ENST00000497453 ERO1AQ96HE7 468 aa21.27■■□□□ 1
UBE2Q1-207ENST00000497453 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa21.27■■□□□ 1
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZNF287Q9HBT7 754 aa21.27■■□□□ 1
UBE2Q1-207ENST00000497453 PNMA3Q9UL41 463 aa21.27■■□□□ 1
UBE2Q1-207ENST00000497453 LOC285556D6RIA3 1793 aa21.27■■□□□ 1
UBE2Q1-207ENST00000497453 A0A1W2PRG0 241 aa21.26■□□□□ 0.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 PRDM1O75626 825 aa21.26■□□□□ 0.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 FGAP02671 866 aa21.26■□□□□ 0.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 USP14P54578 494 aa21.26■□□□□ 0.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 C12orf42Q96LP6 360 aa21.26■□□□□ 0.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 MCOLN1Q9GZU1 580 aa21.26■□□□□ 0.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 OSBPP22059 807 aa21.25■□□□□ 0.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 ICA1Q05084 483 aa21.25■□□□□ 0.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 CTDSPL2Q05D32 466 aa21.25■□□□□ 0.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 PDE4BQ07343 736 aa21.25■□□□□ 0.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 SIAH1Q8IUQ4 282 aa21.25■□□□□ 0.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP21.25■□□□□ 0.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 ANAPC4Q9UJX5 808 aa21.25■□□□□ 0.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZMYM6O95789 1325 aa21.25■□□□□ 0.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 BCRP11274 1271 aa21.24■□□□□ 0.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 CHMLP26374 656 aa21.24■□□□□ 0.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 CAP1Q01518 475 aa21.24■□□□□ 0.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 IL25Q9H293 177 aa21.24■□□□□ 0.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 KANSL2Q9H9L4 492 aa21.24■□□□□ 0.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa21.24■□□□□ 0.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP21.23■□□□□ 0.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 TACC3Q9Y6A5 838 aa21.23■□□□□ 0.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 MYH8P13535 1937 aa21.22■□□□□ 0.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 EEF2P13639 858 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 VCAM1P19320 739 aa21.22■□□□□ 0.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.22■□□□□ 0.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 OTOP1Q7RTM1 612 aa21.22■□□□□ 0.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 INCENPQ9NQS7 918 aa21.22■□□□□ 0.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 TMX2Q9Y320 296 aa21.22■□□□□ 0.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 TRIM17Q9Y577 477 aa21.22■□□□□ 0.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 ATP2B2Q01814 1243 aa21.21■□□□□ 0.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 KIF22Q14807 665 aa21.21■□□□□ 0.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 DSCC1Q9BVC3 393 aa21.21■□□□□ 0.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa21.21■□□□□ 0.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 SH2D4AQ9H788 454 aa21.21■□□□□ 0.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 EFCC1Q9HA90 598 aa21.21■□□□□ 0.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 RAD50Q92878 1312 aa21.21■□□□□ 0.99
UBE2Q1-207ENST00000497453 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa21.2■□□□□ 0.98
UBE2Q1-207ENST00000497453 USP17L15C9J2P7 530 aa21.2■□□□□ 0.98
UBE2Q1-207ENST00000497453 USP17L13C9JLJ4 530 aa21.2■□□□□ 0.98
UBE2Q1-207ENST00000497453 USP17L11C9JVI0 530 aa21.2■□□□□ 0.98
UBE2Q1-207ENST00000497453 USP17L18D6R9N7 530 aa21.2■□□□□ 0.98
UBE2Q1-207ENST00000497453 USP17L22D6RA61 530 aa21.2■□□□□ 0.98
UBE2Q1-207ENST00000497453 USP17L17D6RBQ6 530 aa21.2■□□□□ 0.98
UBE2Q1-207ENST00000497453 USP17L19D6RCP7 530 aa21.2■□□□□ 0.98
UBE2Q1-207ENST00000497453 USP17L20D6RJB6 530 aa21.2■□□□□ 0.98
UBE2Q1-207ENST00000497453 USP17L24Q0WX57 530 aa21.2■□□□□ 0.98
UBE2Q1-207ENST00000497453 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
UBE2Q1-207ENST00000497453 FAM47AQ5JRC9 791 aa21.2■□□□□ 0.98
UBE2Q1-207ENST00000497453 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa21.2■□□□□ 0.98
UBE2Q1-207ENST00000497453 NEDD1Q8NHV4 660 aa21.2■□□□□ 0.98
UBE2Q1-207ENST00000497453 RUFY2Q8WXA3 655 aa21.2■□□□□ 0.98
UBE2Q1-207ENST00000497453 ABHD8Q96I13 439 aa21.2■□□□□ 0.98
UBE2Q1-207ENST00000497453 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
UBE2Q1-207ENST00000497453 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.2■□□□□ 0.98
UBE2Q1-207ENST00000497453 FGRP09769 529 aa21.19■□□□□ 0.98
UBE2Q1-207ENST00000497453 TSPY3P0CV98 308 aa21.19■□□□□ 0.98
UBE2Q1-207ENST00000497453 TSPY8P0CW00 308 aa21.19■□□□□ 0.98
UBE2Q1-207ENST00000497453 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
UBE2Q1-207ENST00000497453 HAND2P61296 217 aa21.19■□□□□ 0.98
UBE2Q1-207ENST00000497453 TFAP4Q01664 338 aa21.19■□□□□ 0.98
UBE2Q1-207ENST00000497453 ARHGEF6Q15052 776 aa21.19■□□□□ 0.98
UBE2Q1-207ENST00000497453 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa21.19■□□□□ 0.98
UBE2Q1-207ENST00000497453 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa21.19■□□□□ 0.98
UBE2Q1-207ENST00000497453 VCPKMTQ9H867 229 aa21.19■□□□□ 0.98
UBE2Q1-207ENST00000497453 NYAP2Q9P242 653 aa21.19■□□□□ 0.98
UBE2Q1-207ENST00000497453 PLIN4Q96Q06 1357 aa21.19■□□□□ 0.98
UBE2Q1-207ENST00000497453 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
UBE2Q1-207ENST00000497453 ORC4O43929 436 aa21.18■□□□□ 0.98
UBE2Q1-207ENST00000497453 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
UBE2Q1-207ENST00000497453 CTGFP29279 349 aa21.18■□□□□ 0.98
UBE2Q1-207ENST00000497453 HERVK_113P62684 666 aa21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 326.1 ms