RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494420.1

HOXB-AS3-215, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 431 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-215ENST00000494420 USP17L13C9JLJ4 530 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 USP17L11C9JVI0 530 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 USP17L18D6R9N7 530 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 USP17L22D6RA61 530 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 USP17L17D6RBQ6 530 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 USP17L19D6RCP7 530 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 USP17L20D6RJB6 530 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ERC2O15083 957 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CCL5P13501 91 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ELNP15502 786 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 USP17L24Q0WX57 530 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 C12orf60Q5U649 245 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RNF208Q9H0X6 261 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RBPJLQ9UBG7 517 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MGAMO43451 1857 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PEX10O60683 326 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ANKRD45Q5TZF3 282 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 PXYLP1Q8TE99 480 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PAGR1Q9BTK6 254 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TXNRD2Q9NNW7 524 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CDK8P49336 464 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CTR9Q6PD62 1173 aa23.17■■□□□ 1.3
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 TMEM179Q6ZVK1 233 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 APPBP2Q92624 585 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 OSBP2Q969R2 916 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SMIM22K7EJ46 135 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 VCAM1P19320 739 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 Q3C1V9 767 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NKX2-3Q8TAU0 364 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CCDC17Q96LX7 622 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 INHAP05111 366 aa23.15■■□□□ 1.3
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 AKR1B1P15121 316 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ERVK-9P63128 1117 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ERVK-24P63145 666 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 UNC93B1Q9H1C4 597 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GJD2Q9UKL4 321 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 A0A1W2PRG0 241 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MX1P20591 662 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 C16orf86Q6ZW13 317 aa23.14■■□□□ 1.29
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 GCC1Q96CN9 775 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 GSG1L2A8MUP6 293 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MAPK4P31152 587 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MYH7P12883 1935 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MINDY4BA8MYZ0 360 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GPAA1O43292 621 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 APPP05067 770 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GJA8P48165 433 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ICA1Q05084 483 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GIMAP6Q6P9H5 292 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 POTEEQ6S8J3 1075 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NUDT12Q9BQG2 462 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FSD1Q9BTV5 496 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 M0R2C6 588 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GNAT2P19087 354 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CYP2B6P20813 491 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 AAMPQ13685 434 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SBK1Q52WX2 424 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CLEC10AQ8IUN9 316 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 STK11IPQ8N1F8 1099 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SHISA4Q96DD7 197 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PORCNQ9H237 461 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SH2D4AQ9H788 454 aa23.11■■□□□ 1.29
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 DOCK3Q8IZD9 2030 aa23.11■■□□□ 1.29
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 COG2Q14746 738 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PLEKHH3Q7Z736 793 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SIAH1Q8IUQ4 282 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TANGO6Q9C0B7 1094 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HOXC10Q9NYD6 342 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TMX2Q9Y320 296 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CNMDO75829 334 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SGPL1O95470 568 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HMGCRP04035 888 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TDO2P48775 406 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 WDR78Q5VTH9 848 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GPR142Q7Z601 462 aa23.09■■□□□ 1.29
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