RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493831.1

ETV1-222, Transcript of ETS variant 1, human

TSL 2

Gene ETV1, Length 536 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ETV1-222	ENST00000493831	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	GGT7	Q9UJ14	662 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	SLITRK5	O94991	958 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	EOMES	O95936	686 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	PGR	P06401	933 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	RAP1GAP	P47736	663 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	KCNMB1	Q16558	191 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	AOC3	Q16853	763 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	RIN3	Q8TB24	985 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	FOXQ1	Q9C009	403 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	BCL11A	Q9H165	835 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	BPNT1	O95861	308 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	CEACAM5	P06731	702 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	CAP2	P40123	477 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	OXCT1	P55809	520 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	UNCX	A6NJT0	531 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	GRIN3B	O60391	1043 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	GREM1	O60565	184 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	RECK	O95980	971 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	ZNF76	P36508	570 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	FANCC	Q00597	558 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	MESP2	Q0VG99	397 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	TMEM87B	Q96K49	555 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	MIPEP	Q99797	713 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ETV1-222	ENST00000493831	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	TSPAN15	O95858	294 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	PLCG1	P19174	1290 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	ITIH2	P19823	946 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	VAMP1	P23763	118 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	CRK	P46108	304 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	PDE4B	Q07343	736 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	MPP2	Q14168	576 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	MLANA	Q16655	118 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	SLC6A19	Q695T7	634 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	REC114	Q7Z4M0	266 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	ASB11	Q8WXH4	323 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	UBP1	Q9NZI7	540 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	PRR33	A8MZF0	331 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	4.82	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	DNAJA2	O60884	412 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	HTR3B	O95264	441 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	AFM	P43652	599 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	ZNF394	Q53GI3	561 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	CDH24	Q86UP0	819 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	CD96	P40200	585 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	IKZF1	Q13422	519 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ETV1-222	ENST00000493831	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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